Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F66 I1 R1
|
15 |
85.2 |
3457112 |
93.8% |
3242771 |
129.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913_3_bme_pgi |
3,546,391 |
C→T |
intergenic (+192/‑168) |
nfuA → / → gntT |
Fe/S biogenesis protein, putative scaffold/chaperone protein/gluconate transporter, high‑affinity GNT I system |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913_3_bme_pgi | 3,546,391 | 0 | C | T | 92.7%
| 212.5
/ 5.4
| 68 | intergenic (+192/‑168) | nfuA/gntT | Fe/S biogenesis protein, putative scaffold/chaperone protein/gluconate transporter, high‑affinity GNT I system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/3); new base T (34/29); total (36/32) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.60e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.19e-01 |
GCCTACGTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTAC > NC_000913_3_bme_pgi/3546252‑3546530
|
gCCTACGTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCCAATCCTCGGTGCGTTTCCCCGCGCTAAGATGACCGACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTca < 4:83074/150‑1 (MQ=255)
gTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATggg > 4:69115/1‑150 (MQ=255)
gTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCACGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATggg > 4:69114/1‑150 (MQ=255)
aTGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCaaa < 1:724522/150‑1 (MQ=255)
tgtgCCAGACGTTGGCGCAGCCTTGCTTCGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAAc < 1:123022/150‑1 (MQ=255)
ggtgCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAAc < 2:332878/149‑1 (MQ=255)
ccAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATAc > 3:272041/1‑150 (MQ=255)
ggCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACAt > 2:146911/1‑150 (MQ=255)
cgcAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCt < 2:210929/150‑1 (MQ=255)
gcaTTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACt < 2:148267/150‑1 (MQ=255)
caTTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACACCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTa > 1:829411/1‑150 (MQ=255)
aTTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTc > 2:398059/1‑135 (MQ=255)
aTTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTc > 3:276993/1‑135 (MQ=255)
aTTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTc < 4:276993/135‑1 (MQ=255)
aTTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTc < 1:398059/135‑1 (MQ=255)
tGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACaa < 2:633650/150‑1 (MQ=255)
tttGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTCCaataa > 2:83460/1‑150 (MQ=255)
tttGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACaataa > 3:416753/1‑150 (MQ=255)
tttGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACaataa > 4:138708/1‑150 (MQ=255)
ttGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCt > 2:206827/1‑138 (MQ=255)
ttGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCt < 1:206827/138‑1 (MQ=255)
tCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAg > 3:214429/1‑150 (MQ=255)
aaaTCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAAtt < 3:398552/146‑1 (MQ=255)
aaaTCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAAtt > 4:398552/1‑146 (MQ=255)
aaaTCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGtt < 3:138708/150‑1 (MQ=255)
cTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTAccc < 1:637529/89‑1 (MQ=255)
cTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTAccc > 2:637529/1‑89 (MQ=255)
ggTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACAt > 4:422539/1‑123 (MQ=255)
ggTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACAt < 3:422539/123‑1 (MQ=255)
gTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGt > 4:93235/1‑150 (MQ=255)
ttCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTa > 4:160105/1‑150 (MQ=255)
cccGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGt > 2:374710/1‑141 (MQ=255)
cccGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGt < 1:374710/141‑1 (MQ=255)
ccGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCgtg < 4:416753/150‑1 (MQ=255)
gcgATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCAtt > 2:518193/1‑81 (MQ=255)
gcgATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCAtt < 1:518193/81‑1 (MQ=255)
gcgATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACAt < 2:731203/86‑1 (MQ=255)
gcgATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACAt > 1:731203/1‑86 (MQ=255)
gcgATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCgtggt > 2:465297/1‑150 (MQ=255)
cgATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCgtggtg < 3:69115/150‑1 (MQ=255)
cgATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCgtggtg < 3:69114/150‑1 (MQ=255)
ccAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATAtct > 1:689057/1‑150 (MQ=255)
ccAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATAtct > 1:688854/1‑150 (MQ=255)
aTAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGa > 2:723641/1‑150 (MQ=255)
tAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGAt > 2:385253/1‑150 (MQ=255)
atttaaatttaCCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTg > 1:110064/1‑150 (MQ=255)
taCCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTa > 4:474346/1‑150 (MQ=255)
aCCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTag < 4:272041/150‑1 (MQ=255)
ccGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACa > 3:426452/1‑60 (MQ=255)
ccGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACa < 4:426452/60‑1 (MQ=255)
cGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGtt > 1:436494/1‑150 (MQ=255)
ctctGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTg < 4:214429/150‑1 (MQ=255)
tctGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTgt < 2:824142/150‑1 (MQ=255)
ctGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTgtc < 2:110064/150‑1 (MQ=255)
ctGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTgtc < 1:146911/150‑1 (MQ=255)
aTTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATAtct < 4:564324/113‑1 (MQ=255)
aTTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATAtct > 3:564324/1‑113 (MQ=255)
tcAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAAt > 3:506908/1‑150 (MQ=255)
cAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAAtt < 2:551367/71‑1 (MQ=255)
cAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAAtt > 1:551367/1‑71 (MQ=255)
cAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAAtt > 4:341257/1‑150 (MQ=255)
cAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAAtt < 1:567171/150‑1 (MQ=255)
cAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAAtt < 1:189280/150‑1 (MQ=255)
cAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAAtt < 1:567071/150‑1 (MQ=255)
aaaCGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTg > 4:414742/1‑150 (MQ=255)
aaaCGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTg > 3:559580/1‑150 (MQ=255)
aaCGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAAtt < 1:779314/148‑1 (MQ=255)
aaCGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAAtt > 2:779314/1‑148 (MQ=255)
aGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTAc > 1:169152/1‑150 (MQ=255)
aGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTAc < 3:414742/150‑1 (MQ=255)
ccGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTgtcgtc > 2:348296/1‑125 (MQ=255)
ccGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTgtcgtc < 1:348296/125‑1 (MQ=255)
|
GCCTACGTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTAC > NC_000913_3_bme_pgi/3546252‑3546530
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
