Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F29 I1 R1
|
13 |
69.3 |
2756640 |
93.6% |
2580215 |
126.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913_3_bme_pgi |
4,158,783 |
T→G |
I98M (ATT→ATG) |
oxyR → |
oxidative and nitrosative stress transcriptional regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913_3_bme_pgi | 4,158,783 | 0 | T | G | 96.0%
| 259.5
/ ‑3.3
| 76 | I98M (ATT→ATG) | oxyR | oxidative and nitrosative stress transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/1); new base G (35/38); total (37/39) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.10e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACTGGCGCAACTGGACAGCGGCAAACTCGATTGCGTG > NC_000913_3_bme_pgi/4158636‑4158921
|
gCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGAGGATCAGGCACGACCAGGGATACGTGAGTTGAAGTTCCTAAATGAGATGACAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGcc < 1:810132/150‑1 (MQ=255)
ggACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCca < 4:172966/150‑1 (MQ=255)
gACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTGAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCcac > 2:605601/1‑150 (MQ=255)
gACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCcac < 4:376339/150‑1 (MQ=255)
aCCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCcaca > 2:676954/1‑150 (MQ=255)
cagcagTAAAGGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGAAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGt < 1:749364/150‑1 (MQ=255)
cAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGt > 1:404265/1‑150 (MQ=255)
aGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGtt < 4:406432/150‑1 (MQ=255)
aaaGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCg > 3:265828/1‑150 (MQ=255)
ttgttCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTg < 3:187614/150‑1 (MQ=255)
gttCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCt > 1:264646/1‑150 (MQ=255)
aCCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGa > 2:415425/1‑135 (MQ=255)
aCCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGa < 1:415425/135‑1 (MQ=255)
cccAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGc < 3:365404/150‑1 (MQ=255)
ccAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTg < 2:638463/131‑1 (MQ=255)
ccAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTg > 1:638463/1‑131 (MQ=255)
ccAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGt < 3:260235/137‑1 (MQ=255)
ccAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGt > 4:260235/1‑137 (MQ=255)
cAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCat > 1:384213/1‑150 (MQ=255)
cAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGAAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCat > 2:634202/1‑150 (MQ=255)
gggAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCAtattat > 2:823026/1‑150 (MQ=255)
gctgGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTAtgct < 1:676954/150‑1 (MQ=255)
ggtggATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCa < 2:404265/150‑1 (MQ=255)
gtggATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGc < 2:684490/124‑1 (MQ=255)
gtggATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGc > 1:684490/1‑124 (MQ=255)
ggATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCa > 2:117982/1‑150 (MQ=255)
gATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAg > 1:58074/1‑150 (MQ=255)
aTCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGa < 2:486869/150‑1 (MQ=255)
aGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCt > 2:476608/1‑150 (MQ=255)
ggCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCt < 3:348643/117‑1 (MQ=255)
ggCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCt > 4:348643/1‑117 (MQ=255)
ggCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCtt > 2:169888/1‑150 (MQ=255)
gcgcGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCttt > 1:6489/1‑150 (MQ=255)
gcgTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCa < 1:271106/120‑1 (MQ=255)
gcgTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCa > 2:271106/1‑120 (MQ=255)
gTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCaa < 2:264646/150‑1 (MQ=255)
tgcGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGaaa < 1:634202/150‑1 (MQ=255)
gTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCt > 3:77263/1‑116 (MQ=255)
gTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCt < 4:77263/116‑1 (MQ=255)
gTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCt > 2:55053/1‑132 (MQ=255)
gTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCt < 1:55053/132‑1 (MQ=255)
gAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGa > 2:849355/1‑87 (MQ=255)
gAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGa > 2:849290/1‑87 (MQ=255)
gAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGa < 1:849355/87‑1 (MQ=255)
gAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGa < 1:849290/87‑1 (MQ=255)
tGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGc > 2:594987/1‑150 (MQ=255)
gAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCa > 4:490890/1‑150 (MQ=255)
gAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCAAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACATTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCa > 3:389884/1‑150 (MQ=255)
tCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAg < 1:823026/150‑1 (MQ=255)
cTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGca > 4:61817/1‑150 (MQ=255)
aaGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGa < 1:117982/150‑1 (MQ=255)
tGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATcc > 1:297530/1‑90 (MQ=255)
tGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATcc < 2:297530/90‑1 (MQ=255)
tGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACccacc < 1:605601/150‑1 (MQ=255)
ggCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACccacca < 1:169888/150‑1 (MQ=255)
ggCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACccacca < 3:61817/150‑1 (MQ=255)
ccAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACt < 2:58074/150‑1 (MQ=255)
cagcagGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACTg < 1:594987/150‑1 (MQ=255)
gcagGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCt < 2:397038/82‑1 (MQ=255)
gcagGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCt > 1:397038/1‑82 (MQ=255)
gaCGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACTGGCGCAACTGGa > 1:740486/1‑150 (MQ=255)
tGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACTGGCGCAACTGGACAGCg < 2:6489/150‑1 (MQ=255)
cGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCAc < 1:714942/73‑1 (MQ=255)
cGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCAc > 2:714942/1‑73 (MQ=255)
aCCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACTGGCGCAACTGGACAGCGGCAAACt < 3:490890/150‑1 (MQ=255)
cGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATcc < 1:375363/57‑1 (MQ=255)
cGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATcc > 2:375363/1‑57 (MQ=255)
cTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCa < 1:641375/65‑1 (MQ=255)
cTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCa > 2:641375/1‑65 (MQ=255)
cacaTTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACccac < 2:313692/111‑1 (MQ=255)
cacaTTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACccac > 1:313692/1‑111 (MQ=255)
aTTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACTGGCGCAACTGGACAGCGGCAAACTCGATTGCGTg > 3:394902/1‑150 (MQ=255)
gTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACTGGCGCAACTGGACAg < 4:153726/127‑1 (MQ=255)
gTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACTGGCGCAACTGGACAg > 3:153726/1‑127 (MQ=255)
gTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACTGGCGCAACTGGACAGCGGCAAACTCGATTGCg < 3:68920/144‑1 (MQ=255)
gTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACTGGCGCAACTGGACAGCGGCAAACTCGATTGCg > 4:68920/1‑144 (MQ=255)
|
GCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACTGGCGCAACTGGACAGCGGCAAACTCGATTGCGTG > NC_000913_3_bme_pgi/4158636‑4158921
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
