Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A13 F60 I1 R1
|
24 |
115.9 |
3905994 |
99.1% |
3870840 |
138.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,933,881 |
A→G |
intergenic (‑193/‑354) |
fucA ← / → fucP |
L‑fuculose‑phosphate aldolase/L‑fucose:H(+) symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,933,881 | 0 | A | G | 100.0%
| 303.3
/ NA
| 79 | intergenic (‑193/‑354) | fucA/fucP | L‑fuculose‑phosphate aldolase/L‑fucose:H(+) symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (49/30); total (49/30) |
GAATTAGCCGTTTAATTACCCACCATCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCAT > NC_000913/2933745‑2934013
|
gAATTAGCCGTTTAATTACCCACCATCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCg < 2:1828246/140‑1 (MQ=255)
tAGCCGTTTAATTACCCACCATCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGctct > 2:658798/1‑140 (MQ=255)
gCCGTTTAATTACCCACCATCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTa > 2:1216008/1‑140 (MQ=255)
gCCGTTTAATTACCCACCATCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTa > 1:796104/1‑140 (MQ=255)
gCCGTTTAATTACCCACCATCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTa > 1:1534118/1‑140 (MQ=255)
cGTTTAATTACCCACCATCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGc > 1:1528930/1‑133 (MQ=255)
cGTTTAATTACCCACCATCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGc < 2:1528930/133‑1 (MQ=255)
cGTTTAATTACCCACCATCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTaaa > 1:699488/1‑140 (MQ=255)
cGTTTAATTACCCACCATCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTaaa > 2:699971/1‑140 (MQ=255)
gTTTAATTACCCACCATCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTaaaa < 2:1381841/140‑1 (MQ=255)
ttAATTACCCACCATCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGct > 1:911164/1‑131 (MQ=255)
ttAATTACCCACCATCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGct < 2:911164/131‑1 (MQ=255)
tAATTACCCACCATCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAata > 2:305464/1‑140 (MQ=255)
aTTAGCCACCATCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATAtt < 2:187503/140‑1 (MQ=255)
accaTCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCaaa > 1:1355875/1‑140 (MQ=255)
tcttcCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCa < 2:1355875/140‑1 (MQ=255)
tcatcCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCa > 2:333131/4‑140 (MQ=255)
cTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCAttttt > 1:370555/1‑140 (MQ=255)
cTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCAttttt > 1:1601868/1‑140 (MQ=255)
cTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCAttttt > 1:367968/1‑140 (MQ=255)
aTTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTa > 1:1386775/1‑140 (MQ=255)
ttAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTAt < 1:699971/140‑1 (MQ=255)
aagaaagaAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATtcctc < 1:441444/140‑1 (MQ=255)
aagaaagaAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATtcctc < 2:1534118/140‑1 (MQ=255)
agaaagaaATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATtcctcc > 1:1820116/1‑140 (MQ=255)
aagaaaTTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATtcctcc > 1:1414571/1‑137 (MQ=255)
aagaaaTTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATtcctcc < 2:1414571/137‑1 (MQ=255)
aagaaaTTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAg < 2:367968/140‑1 (MQ=255)
agaaaTTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATtcctcc > 2:1148052/1‑136 (MQ=255)
agaaaTTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATtcctcc < 1:1148052/136‑1 (MQ=255)
gaaaTTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGcc < 2:1601868/140‑1 (MQ=255)
ttCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGa > 1:1386195/1‑140 (MQ=255)
tCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGaa < 1:479602/140‑1 (MQ=255)
tatTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTc > 1:909730/1‑140 (MQ=255)
tgtgACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGcac > 1:1635059/1‑140 (MQ=255)
gtgACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGcaca < 1:868195/140‑1 (MQ=255)
gtgACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGcaca < 2:1738547/140‑1 (MQ=255)
tgACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCacaa > 1:878897/1‑140 (MQ=255)
aCCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCgg > 2:1619048/1‑133 (MQ=255)
aCCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCgg < 1:1619048/133‑1 (MQ=255)
aCCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCacaaac > 2:914719/1‑140 (MQ=255)
tGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAAt < 2:1635059/140‑1 (MQ=255)
aCTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACg < 2:909730/140‑1 (MQ=255)
tCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGcaca > 2:206209/1‑122 (MQ=255)
tCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGcaca < 1:206209/122‑1 (MQ=255)
tCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATa > 2:1382011/1‑133 (MQ=255)
tCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATa < 1:1382011/133‑1 (MQ=255)
tCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCAt > 1:204248/1‑140 (MQ=255)
tAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGAtt > 1:1119466/1‑140 (MQ=255)
aaaTAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGAttt < 1:1139328/140‑1 (MQ=255)
tGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGtttt > 1:1763308/1‑140 (MQ=255)
cAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGtttttt > 2:1057407/1‑140 (MQ=255)
cAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGtttttt > 1:575586/1‑140 (MQ=255)
cAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGtttttt > 1:315189/1‑140 (MQ=255)
cAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGtttttt > 1:1937492/1‑140 (MQ=255)
cAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGtttttt < 2:878897/140‑1 (MQ=255)
cAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGtttttt > 1:1024493/1‑140 (MQ=255)
cAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGtttttt > 1:130852/1‑140 (MQ=255)
aGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTAt < 2:575586/140‑1 (MQ=255)
aGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTAt > 2:9648/1‑140 (MQ=255)
tctTTTTATAACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGattt > 2:1832221/1‑140 (MQ=255)
ataACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGAGTTATTTTc < 1:1331663/139‑1 (MQ=255)
ataACCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGAGTTATTTTc > 2:1331663/1‑139 (MQ=255)
aCCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGaa > 1:1835913/1‑140 (MQ=255)
aCCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGaa > 2:835671/1‑140 (MQ=255)
aCCCCATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGaa > 2:528001/1‑140 (MQ=255)
ccccATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGaaa < 2:1835913/140‑1 (MQ=255)
ccccATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGaaa < 2:796104/140‑1 (MQ=255)
cATTTAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAGCGGAGATTTTTCTGTTCCTCCTAAACCGGAAAAACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTGCTGAAACgg > 2:1937984/1‑140 (MQ=255)
cATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACgg > 2:666153/1‑140 (MQ=255)
cATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACgg > 2:413954/1‑140 (MQ=255)
cATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACgg > 2:1663775/1‑140 (MQ=255)
cATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACgg < 1:1832221/140‑1 (MQ=255)
cATTAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACgg > 1:1780731/1‑140 (MQ=255)
ttAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGc > 1:93534/1‑140 (MQ=255)
ttAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGc > 2:791696/1‑140 (MQ=255)
ttAAAAATGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCT‑CAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCa > 1:1502913/1‑140 (MQ=255)
aaaaaTGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCAt < 1:413954/140‑1 (MQ=255)
aaaaaTGGCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCAt < 2:315189/140‑1 (MQ=255)
|
GAATTAGCCGTTTAATTACCCACCATCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCAT > NC_000913/2933745‑2934013
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
