Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A13 F60 I1 R1
|
24 |
115.9 |
3905994 |
99.1% |
3870840 |
138.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,248,470 |
T→C |
L11P (CTA→CCA) |
mzrA → |
modulator protein MzrA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,248,470 | 0 | T | C | 100.0%
| 355.4
/ NA
| 91 | L11P (CTA→CCA) | mzrA | modulator protein MzrA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (56/35); total (56/35) |
TGATGTCATGCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAAT > NC_000913/3248335‑3248602
|
tGATGTCATGCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCagccagcc < 2:63769/140‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCcagccagc < 2:1587391/131‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCcagccagc > 1:1587391/1‑131 (MQ=255)
tGCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCgg > 2:1101622/1‑140 (MQ=255)
gCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGgc < 2:98254/140‑1 (MQ=255)
gCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGgc > 2:440649/1‑140 (MQ=255)
gCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGgc > 2:97877/1‑140 (MQ=255)
ccTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGgcg < 2:101595/140‑1 (MQ=255)
ccTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGgcg < 2:1862623/140‑1 (MQ=255)
aTGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCgg < 2:86823/134‑1 (MQ=255)
aTGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCgg > 1:86823/1‑134 (MQ=255)
aTGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGt > 2:1275009/1‑140 (MQ=255)
aTGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGt > 2:595962/1‑140 (MQ=255)
tgctCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTa > 1:1905313/1‑140 (MQ=255)
gctCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGGATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTAc > 2:1784429/1‑140 (MQ=255)
ctCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACt > 2:266369/1‑140 (MQ=255)
ctCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACt > 1:744951/1‑140 (MQ=255)
ctCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACt > 1:1151224/1‑140 (MQ=255)
ggtggtGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTgg > 2:703840/1‑140 (MQ=255)
ggtggtGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTgg > 1:1896516/1‑140 (MQ=255)
ggtggtGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTgg > 1:1092122/1‑140 (MQ=255)
gtggtgCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGt < 2:1339267/140‑1 (MQ=255)
gtgCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCgg < 1:266369/140‑1 (MQ=255)
tgctgcTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGc < 1:1162498/140‑1 (MQ=255)
ctgctgGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCAc > 1:460187/1‑140 (MQ=255)
tgctgGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACg < 1:595962/140‑1 (MQ=255)
tgctgGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACg > 2:648400/1‑140 (MQ=255)
tgctgGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACg < 1:1275009/140‑1 (MQ=255)
tGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTgg > 1:1010942/1‑140 (MQ=255)
gCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGcc > 2:1632715/1‑140 (MQ=255)
ggCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGt > 1:1059112/1‑140 (MQ=255)
gCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTc > 1:921889/1‑140 (MQ=255)
cAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTcc > 2:1691593/1‑140 (MQ=255)
ttCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCgg > 1:489495/1‑140 (MQ=255)
ttCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCgg > 1:1831787/1‑140 (MQ=255)
tGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGc < 2:1059112/140‑1 (MQ=255)
tGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGc > 1:1165136/1‑140 (MQ=255)
cGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGc > 2:1051599/1‑140 (MQ=255)
cGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGc > 2:1052895/1‑140 (MQ=255)
cGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGc > 1:1150711/1‑140 (MQ=255)
gtgtTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGt > 1:1507026/1‑131 (MQ=255)
gtgtTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGt < 2:1507026/131‑1 (MQ=255)
ttATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCTCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAaga > 1:538739/1‑140 (MQ=255)
ttATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAaga > 1:412443/1‑140 (MQ=255)
ttATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAaga < 2:1831787/140‑1 (MQ=255)
ttATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAaga > 1:727970/1‑140 (MQ=255)
aTGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGt > 1:1383459/1‑140 (MQ=255)
aTGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGt < 2:1165136/140‑1 (MQ=255)
gAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTa < 2:1383459/140‑1 (MQ=255)
aaGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCt > 2:1850030/1‑140 (MQ=255)
aGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTg < 2:489495/140‑1 (MQ=255)
aaTATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGACGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCg > 2:756032/1‑140 (MQ=255)
tatGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTCGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGAt < 1:1325663/140‑1 (MQ=255)
gAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGt > 2:1663843/1‑140 (MQ=255)
aaaTCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTg < 1:1446242/140‑1 (MQ=255)
aaaTCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTg < 2:1151224/140‑1 (MQ=255)
aaaTCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTg < 1:1101622/140‑1 (MQ=255)
aTCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGcc > 1:800861/1‑140 (MQ=255)
aTCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGcc > 1:1058985/1‑140 (MQ=255)
aTCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGcc > 1:19983/1‑140 (MQ=255)
aTCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGcc > 1:424394/1‑140 (MQ=255)
tCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCg < 2:800861/140‑1 (MQ=255)
ggTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTtcat < 2:1905313/140‑1 (MQ=255)
ggTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTtcat < 2:1058985/140‑1 (MQ=255)
gTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTtcatc > 1:1630781/1‑140 (MQ=255)
tAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTtcatca < 1:1632715/140‑1 (MQ=255)
tAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTtcatca < 1:713478/140‑1 (MQ=255)
ggATGTAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGc < 1:1206891/140‑1 (MQ=255)
tGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGcaca > 1:54902/1‑140 (MQ=255)
tGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGcaca > 2:1581666/1‑140 (MQ=255)
gCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACaa < 1:648400/140‑1 (MQ=255)
gCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACaa > 1:1490954/1‑140 (MQ=255)
gCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACaa > 1:766506/1‑140 (MQ=255)
gCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACaa < 2:1092122/140‑1 (MQ=255)
aaaTACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACg < 2:1150711/140‑1 (MQ=255)
aCCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGc > 1:521203/1‑140 (MQ=255)
aCCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGc > 2:1804010/1‑140 (MQ=255)
aCCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGc > 1:1060234/1‑140 (MQ=255)
tCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAg > 1:189471/1‑140 (MQ=255)
tCGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGGTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAg > 1:1107625/1‑140 (MQ=255)
cGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGa < 2:560260/140‑1 (MQ=255)
cGCATGTCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGa > 1:939284/1‑140 (MQ=255)
tCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACg > 2:314661/1‑126 (MQ=255)
tCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACg < 1:314661/126‑1 (MQ=255)
tCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACg < 1:875140/126‑1 (MQ=255)
tCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACg > 2:875140/1‑126 (MQ=255)
tCGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGttt > 1:1939938/1‑140 (MQ=255)
cGCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGtttt > 1:1425501/1‑140 (MQ=255)
gCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACgg > 1:1546241/1‑135 (MQ=255)
gCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACgg < 2:1546241/135‑1 (MQ=255)
gCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGttttt > 2:1815097/1‑140 (MQ=255)
gCTTCGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGttttt < 1:1051599/140‑1 (MQ=255)
cGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAAt < 1:1663843/140‑1 (MQ=255)
cGCCAGCCAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAAt < 1:1784429/140‑1 (MQ=255)
|
TGATGTCATGCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAAT > NC_000913/3248335‑3248602
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
