Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A17 F60 I1 R1
|
21 |
68.5 |
2313054 |
98.9% |
2287610 |
137.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
3,290,451 |
IS1 (–) +9 bp |
coding (1638‑1646/2517 nt) |
yraJ → |
putative fimbrial usher protein YraJ |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
3290451 = | 0 (0.000) | 72 (1.070) |
52/274 |
0.2 |
100% |
coding (1638/2517 nt) |
yraJ |
putative fimbrial usher protein YraJ |
| ? | NC_000913 |
3583428 = |
NA (NA) | noncoding (1/768 nt) |
IS1 |
repeat region |
| * |
? |
NC_000913 |
= 3290459 | 0 (0.000) | 71 (1.050) |
48/274 |
0.2 |
100% |
coding (1646/2517 nt) |
yraJ |
putative fimbrial usher protein YraJ |
| ? | NC_000913 |
= 3584195 |
NA (NA) | noncoding (768/768 nt) |
IS1 |
repeat region |
GGGCGATCTTTCTGGCTGGTCATCTGATAGGAAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3290588‑3290451
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGAC > NC_000913/3583428‑3583561
GGGCGATCTTTCTGGCTGGTCATCTGATAGGAAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGG < 2:797196/140‑1
GGCGATCTTTCTGGCTGGTCATCTGATAGGAAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGT > 2:733112/1‑140
GCGATCTTTCTGGCTGGTCATCTGATAGGAAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTG < 1:733112/140‑1
TCTTTCTGGCTGGTCATCTGATAGGAAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGC > 2:32412/1‑140
TCTTTCTGGCTGGTCATCTGATAGGAAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGC > 2:1138531/1‑140
TCTGGCTGGTCATCTGATAGGAAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACAGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCC < 2:898015/140‑1
GCTGGTCATCTGATAGGAAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACT > 1:799022/1‑140
CTGGTCATCTGATAGGAAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTT > 1:847168/1‑140
TGGTCATCTGATAGGAAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTA < 1:32412/140‑1
GTCATCTGATAGGAAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACT > 1:591495/1‑140
TGATAGGAAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 2:799492/140‑1
GATAGGAAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 1:800807/1‑140
ATAGGAAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 2:847168/140‑1
AGGAAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:958039/140‑1
AGGAAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTA < 2:237653/128‑1
AGGAAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTA > 1:237653/1‑128
GGAAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA < 2:950719/140‑1
GGAAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA > 1:950719/1‑140
AAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 2:784367/131‑1
AAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT > 1:784367/1‑131
AACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 1:266890/140‑1
AACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 2:266890/1‑140
ACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT > 1:1087945/1‑140
ACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT > 1:415053/1‑129
ACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 2:415053/129‑1
ACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTG < 2:158172/126‑1
ACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTG > 1:158172/1‑126
ACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTA > 1:227388/1‑123
ACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTA < 2:227388/123‑1
CGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 2:1144298/134‑1
CGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:1144298/1‑134
TCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG > 2:429675/1‑140
CTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC < 1:408639/140‑1
TAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT > 1:341545/1‑140
GGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG < 2:209448/140‑1
GAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGT > 1:562968/1‑140
CTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA > 1:1139719/1‑140
AGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA < 2:799022/140‑1
ATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCGATCAGC < 2:1087945/140‑1
TTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT < 1:429675/140‑1
TTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT > 1:472823/1‑140
AGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC < 2:800807/140‑1
AGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC < 2:232060/140‑1
AGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT > 1:324008/1‑140
GCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT < 2:324008/140‑1
CGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTC < 1:304069/140‑1
CGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTC < 2:562968/140‑1
CATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC < 1:1138531/140‑1
TGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGG < 2:341545/140‑1
GATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGT > 2:156775/1‑140
GATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA < 1:759279/134‑1
GATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA > 2:759279/1‑134
TCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGG > 1:583374/1‑140
AGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTG > 2:546074/1‑140
TAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTA < 2:1139719/140‑1
GTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAA > 1:156056/1‑140
GTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAA > 1:95858/1‑140
GTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAA > 2:722963/1‑140
GTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAA > 2:334746/1‑140
GTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGG > 1:494904/1‑123
GTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGG < 2:494904/123‑1
GTATTGATAATTCAGGCTGGGTGATACTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAA > 1:668629/1‑140
GTATTGATAATTCAGGCTGGGCGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAA > 2:514546/1‑140
ATTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAG > 2:378966/1‑140
TTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGC > 1:683998/1‑140
TTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGC > 2:797252/1‑140
TTGATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGC > 2:469891/1‑140
GATAATTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCAC < 2:591495/140‑1
TTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCG < 1:469891/140‑1
TTCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCG < 1:797252/140‑1
TCAGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGG > 1:319401/1‑140
AGGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAATGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGAC > 1:503707/1‑140
GGGCGATCTTTCTGGCTGGTCATCTGATAGGAAACCCGGCTACGCGGTAACCAGCGTTCTAACGGAATACTGAGATTCAAAGAGAGTGCGCGGTCATTATTTTGATCAGTGTAGCGGCTGTATTGATAATTCAGGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3290588‑3290451
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGAC > NC_000913/3583428‑3583561
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
