Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F30 I1 R1
|
19 |
97.7 |
3348414 |
99.0% |
3314929 |
138.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
738,158 |
G→T |
E23* (GAA→TAA) |
ybfD → |
H repeat‑associated putative transposase YbfD |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 738,158 | 0 | G | T | 97.8%
| 392.9
/ 2.7
| 134 | E23* (GAA→TAA) | ybfD | H repeat‑associated putative transposase YbfD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/1); new base T (79/52); total (81/53) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.47e-01 |
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
ATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTAT > NC_000913/738024‑738294
|
attaCCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACAt < 1:297819/140‑1 (MQ=37)
ccTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAAt > 2:188188/1‑140 (MQ=255)
cTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAAtt > 1:249931/1‑140 (MQ=37)
aaGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATc < 1:1122619/140‑1 (MQ=37)
aaGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATc < 2:249931/140‑1 (MQ=255)
aaGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATc < 1:711501/140‑1 (MQ=255)
ttttttATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGatat > 2:1201627/1‑140 (MQ=37)
tttttATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATAtt > 1:579442/1‑140 (MQ=255)
ttATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTa < 2:1239529/140‑1 (MQ=255)
tATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTAc < 1:1207689/140‑1 (MQ=255)
cTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTg > 2:901027/1‑140 (MQ=255)
tataCATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGa > 2:1569532/1‑125 (MQ=255)
aTCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTtgtg > 2:5528/1‑140 (MQ=255)
aTCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTtgtg < 1:1542201/140‑1 (MQ=255)
aTCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTtgtg > 1:695667/1‑140 (MQ=255)
aTCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAACCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTtgtg > 2:1457646/1‑140 (MQ=17)
tCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGc > 2:348094/1‑140 (MQ=255)
aaTACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGt > 1:1451323/1‑140 (MQ=255)
aaTACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGt > 1:169164/1‑140 (MQ=255)
aTACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGtt < 1:1339703/140‑1 (MQ=37)
aCTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTAt < 2:719982/140‑1 (MQ=37)
aCTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAACCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTAt < 2:389167/140‑1 (MQ=17)
ttcttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTAttt > 2:1297064/1‑140 (MQ=37)
tcttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc < 1:21399/140‑1 (MQ=25)
tcttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc < 1:384535/140‑1 (MQ=25)
tcttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc > 2:1094533/1‑140 (MQ=37)
cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTtgtg < 2:941088/129‑1 (MQ=25)
cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTtgtg > 1:941088/1‑129 (MQ=25)
cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTAttctg > 1:764809/1‑137 (MQ=25)
cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 1:1383112/1‑140 (MQ=25)
cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 1:1642368/1‑140 (MQ=21)
cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 1:1069599/1‑140 (MQ=25)
cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 2:1138967/1‑140 (MQ=25)
cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 1:1016489/1‑140 (MQ=25)
cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 1:409248/1‑140 (MQ=25)
cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 1:413198/1‑140 (MQ=21)
cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 2:1269864/1‑140 (MQ=21)
cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 2:1482047/1‑140 (MQ=21)
cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 1:572816/1‑140 (MQ=25)
cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 1:1251032/1‑140 (MQ=21)
tAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCa < 2:1451323/140‑1 (MQ=17)
tAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCa < 2:1633690/140‑1 (MQ=17)
aTTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCa > 2:1412797/1‑138 (MQ=17)
aTTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCa < 1:1412797/138‑1 (MQ=17)
aTTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGa < 2:409248/140‑1 (MQ=17)
ttAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGaa < 1:348094/140‑1 (MQ=17)
tAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAg > 2:1080083/1‑140 (MQ=17)
aGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGc < 2:1642368/140‑1 (MQ=18)
aGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGc < 1:1482047/140‑1 (MQ=18)
aGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGc < 2:1069599/140‑1 (MQ=18)
aGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGc > 1:1632514/1‑140 (MQ=18)
aGGAGAACAAAATGGAAATTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGc < 1:1135074/140‑1 (MQ=18)
gagaACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTg > 2:1033933/1‑140 (MQ=21)
aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAgg > 1:1132800/1‑134 (MQ=17)
aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAgg < 2:1132800/134‑1 (MQ=17)
aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGc < 2:297377/135‑1 (MQ=18)
aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGc > 1:297377/1‑135 (MQ=18)
aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGa > 1:1379615/1‑140 (MQ=21)
aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGa < 2:1379615/140‑1 (MQ=21)
aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGa < 2:1016489/140‑1 (MQ=25)
aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGa > 1:627883/1‑140 (MQ=21)
aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGa > 1:495535/1‑140 (MQ=21)
aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGa > 1:263002/1‑140 (MQ=21)
cAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTggg > 1:505478/1‑137 (MQ=21)
cAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAg > 2:854396/1‑140 (MQ=21)
aaCTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGc < 1:262099/125‑1 (MQ=18)
ttAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGAt > 2:1336320/1‑140 (MQ=21)
aaaaaaTTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGAttt < 1:156331/140‑1 (MQ=25)
aaaaaaTTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGAttt < 1:1297064/140‑1 (MQ=25)
aTTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTgggg < 1:361545/140‑1 (MQ=25)
tattatCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGAttttt < 2:169164/140‑1 (MQ=21)
attatCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGAtttttt > 1:727538/1‑140 (MQ=21)
ttatCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTg > 1:1246408/1‑140 (MQ=25)
ttatCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTg < 2:495535/140‑1 (MQ=21)
ttatCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTg > 2:1387015/1‑140 (MQ=37)
tatCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGa < 2:1246408/140‑1 (MQ=21)
atCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGaa > 1:1242256/1‑140 (MQ=37)
tCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAg > 1:69153/1‑140 (MQ=37)
tCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAg > 2:330855/1‑140 (MQ=37)
tCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAg > 1:1215811/1‑140 (MQ=37)
tCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAg > 2:443689/1‑140 (MQ=37)
ccccGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGc < 2:627883/140‑1 (MQ=21)
cccGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGa > 2:214834/1‑128 (MQ=37)
cccGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCa > 1:1499158/1‑140 (MQ=37)
cccGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGA‑TTTTTGAAGCaa > 2:541797/1‑140 (MQ=255)
cGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAat > 1:292146/1‑140 (MQ=37)
gATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAata > 2:852282/1‑140 (MQ=37)
gATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAata < 2:413198/140‑1 (MQ=21)
cAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTg < 2:1398416/140‑1 (MQ=21)
cAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTg < 2:1242256/140‑1 (MQ=21)
aCAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGAtt > 1:1607660/1‑140 (MQ=37)
aCAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGAtt > 1:1280806/1‑140 (MQ=37)
gCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGa > 2:135928/1‑140 (MQ=25)
ccTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGaa > 2:675480/1‑140 (MQ=21)
ccTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGaa < 2:720320/140‑1 (MQ=21)
ccTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGaa > 2:766969/1‑140 (MQ=21)
ccTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGaa > 1:1038996/1‑140 (MQ=21)
ggAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAAt > 1:1204135/1‑140 (MQ=21)
aaaGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATgg > 1:472185/1‑140 (MQ=21)
aGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTa < 2:1590700/140‑1 (MQ=18)
|
ATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTAT > NC_000913/738024‑738294
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
