Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A38 F30 I1 R1
|
20 |
211.3 |
7163870 |
99.4% |
7120886 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,453,510 |
G→T |
A314S (GCG→TCG) |
ytfT → |
galactofuranose ABC transporter putative membrane subunit YtfT |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,453,510 | 0 | G | T | 99.6%
| 889.8
/ ‑4.9
| 250 | A314S (GCG→TCG) | ytfT | galactofuranose ABC transporter putative membrane subunit YtfT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (108/141); minor base C (0/1); total (108/142) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.30e-01 |
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
GGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTGGGTTATCTTTAC > NC_000913/4453374‑4453645
|
ggtgATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCgg < 2:1073022/140‑1 (MQ=255)
gATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCggtgg < 2:2165299/140‑1 (MQ=255)
gATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCggtgg < 2:1539614/140‑1 (MQ=255)
ttGGCGGCGGATCGCTGATTGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCggtggtg > 2:2523323/1‑140 (MQ=255)
cggcggATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCggtggt < 2:1972343/135‑1 (MQ=255)
cggcggATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCggtggt > 1:1972343/1‑135 (MQ=255)
ggcggATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCt < 2:2135184/140‑1 (MQ=255)
gcggATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCtt > 1:2292068/1‑140 (MQ=255)
gATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGAGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGc > 1:2436238/1‑140 (MQ=255)
tCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGt < 1:3363462/140‑1 (MQ=255)
tCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGt < 2:2605994/140‑1 (MQ=255)
tCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAACCGGTGGTGGTGCTTTGCGt < 2:129888/140‑1 (MQ=255)
aTGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGAt < 2:3469079/140‑1 (MQ=255)
ggcgggcgCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGt > 1:3154654/1‑140 (MQ=255)
cgggcgCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGt < 1:167692/129‑1 (MQ=255)
cgggcgCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGt < 1:847383/129‑1 (MQ=255)
ggcgCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAg > 1:1454560/1‑140 (MQ=255)
gcgcTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGt > 2:644182/1‑140 (MQ=255)
cTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGc < 1:3578067/140‑1 (MQ=255)
cTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGc < 1:56959/140‑1 (MQ=255)
cTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGc < 1:2093069/140‑1 (MQ=255)
cTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGc < 2:70137/140‑1 (MQ=255)
tttAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCATGCTGATTGTTCAGTCGCa < 2:2858571/140‑1 (MQ=255)
cTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCtt > 1:1098338/1‑140 (MQ=255)
cTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTAt > 2:1197805/1‑140 (MQ=255)
cTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTAt > 2:2804325/1‑140 (MQ=255)
tttCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGt < 1:1197805/140‑1 (MQ=255)
tttCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGt < 2:187388/140‑1 (MQ=255)
tttCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGt < 1:262766/140‑1 (MQ=255)
tttCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGt < 2:3439511/140‑1 (MQ=255)
tttCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGt < 2:1006249/140‑1 (MQ=255)
tttCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGt < 2:1095740/140‑1 (MQ=255)
tCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACg < 2:966069/128‑1 (MQ=255)
tCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGt > 2:1489943/1‑138 (MQ=255)
tCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCt < 1:1547484/140‑1 (MQ=255)
gtggtgGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGAt > 1:759826/1‑140 (MQ=255)
gtggtgGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGAt < 1:644182/140‑1 (MQ=255)
ggtggGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTa < 1:1224772/140‑1 (MQ=255)
gtggGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTaa < 2:1658471/140‑1 (MQ=255)
gtggGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTaa < 1:2796730/140‑1 (MQ=255)
tggGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTaaa > 1:2392067/1‑140 (MQ=255)
gggggCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAg < 1:1178053/140‑1 (MQ=255)
gggggCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAg < 2:113503/140‑1 (MQ=255)
ggggCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAgg < 2:1454560/140‑1 (MQ=255)
ggggCGCTGATTATTCA‑GGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGa > 2:1682796/1‑140 (MQ=255)
gggCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGa < 1:1734817/140‑1 (MQ=255)
ggCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAg > 1:324686/1‑137 (MQ=255)
ggCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAg > 1:2136708/1‑140 (MQ=255)
cTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACg < 1:2804325/140‑1 (MQ=255)
gATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTa > 2:1335113/1‑140 (MQ=255)
attattCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAg < 1:3440851/140‑1 (MQ=255)
tattCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGcc < 1:1004853/140‑1 (MQ=255)
cAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGa < 2:1956097/140‑1 (MQ=255)
gATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATaaaa > 2:441197/1‑140 (MQ=255)
aTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAAc > 1:2428279/1‑140 (MQ=255)
tGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACg < 2:873437/140‑1 (MQ=255)
gAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGt > 1:1993712/1‑140 (MQ=255)
gAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGt > 2:2083117/1‑140 (MQ=255)
gAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGt > 2:918736/1‑140 (MQ=255)
aaCACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTa > 1:1378366/1‑140 (MQ=255)
acacCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTaa > 1:1016200/1‑140 (MQ=255)
acCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAAtt < 1:8349/140‑1 (MQ=255)
ccGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAAttt > 1:2199287/1‑140 (MQ=255)
ccGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAAttt > 2:3304237/1‑140 (MQ=255)
ccGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAAttt > 2:2417923/1‑140 (MQ=255)
ccGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATT‑AAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTg > 1:194684/1‑140 (MQ=255)
cGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTg < 1:2999864/140‑1 (MQ=255)
ggAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGAt < 1:258617/126‑1 (MQ=255)
gAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATCGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGcc > 1:152154/1‑140 (MQ=255)
aaTTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCa < 1:2916335/140‑1 (MQ=255)
aaTTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCa < 2:2220679/140‑1 (MQ=255)
aaTTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCa < 2:2434107/140‑1 (MQ=255)
ttttGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGc > 1:936476/1‑136 (MQ=255)
ttGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACtga < 2:2653554/140‑1 (MQ=255)
cTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACt < 2:1478510/135‑1 (MQ=255)
cTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACt > 1:1478510/1‑135 (MQ=255)
cTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACt < 2:2869632/135‑1 (MQ=255)
cTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACt > 1:2869632/1‑135 (MQ=255)
gggCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCAcc < 1:451909/140‑1 (MQ=255)
tCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGc > 1:2238032/1‑140 (MQ=255)
gCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTc < 2:796899/140‑1 (MQ=255)
ccAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCt < 1:1888540/140‑1 (MQ=255)
ccAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCt < 1:3304237/140‑1 (MQ=255)
agaTGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTtgt < 1:1335113/140‑1 (MQ=255)
agaTGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTtgt < 1:2299215/140‑1 (MQ=255)
agaTGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTtgt > 1:268029/1‑140 (MQ=255)
aTGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTgtgt > 2:3247249/1‑140 (MQ=255)
tGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGtt < 2:2956592/140‑1 (MQ=255)
aaCCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTgg < 1:918736/140‑1 (MQ=255)
aaCCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTgg < 1:996332/140‑1 (MQ=255)
ggtggtGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTgtgt > 2:508345/1‑132 (MQ=255)
ggtggtGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTGGGt > 2:1421064/1‑137 (MQ=255)
ggtggtGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTGGGTTAt > 2:2718424/1‑140 (MQ=255)
gtggtgAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTGGGTTATc > 2:1572589/1‑140 (MQ=255)
gtggtgAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGG‑GTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTgg > 1:2541319/1‑133 (MQ=255)
tggtgAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTGGGTTATCt > 2:2585541/1‑140 (MQ=255)
tggtgAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTGGGTTATCt > 1:2847016/1‑140 (MQ=255)
gtgAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTGGGTTATCttt > 1:413945/1‑140 (MQ=255)
tgAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATCAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTGGGt > 2:839543/1‑132 (MQ=255)
gAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTGGGTTATCTTTAc > 2:3124579/1‑140 (MQ=255)
|
GGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTGGGTTATCTTTAC > NC_000913/4453374‑4453645
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
