Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A15 F73 I1 R1
|
29 |
140.0 |
4785556 |
99.3% |
4752057 |
139.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,222,600 |
G→T |
intergenic (‑113/+204) |
arpA ← / ← iclR |
regulator of acetyl CoA synthetase/DNA‑binding transcriptional repressor IclR |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,222,600 | 0 | G | T | 98.5%
| 710.6
/ ‑3.1
| 201 | intergenic (‑113/+204) | arpA/iclR | regulator of acetyl CoA synthetase/DNA‑binding transcriptional repressor IclR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base T (108/90); total (109/92) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.94e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
CTACGAGGAATACGAGTAATCATTTAAATATCTCATTGTTTATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCAGCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAA > NC_000913/4222465‑4222735
|
aCGAGGAATACGAGTAATCATTTAAATATCTCATTGTTTATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTaa < 1:196710/140‑1 (MQ=255)
gAGGAATACGAGTAATCATTTAAATATCTCATTGTTTATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTaaaa > 1:1270606/1‑140 (MQ=255)
tACGAGTAATCATTTAAATATCTCATTGTTTATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCg < 1:560787/140‑1 (MQ=255)
aGTAATCATTTAAATATCTCATTGTTTATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTgg > 1:1918238/1‑140 (MQ=255)
aTCATTTAAATATCTCATTGTTTATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCgg < 2:1719355/133‑1 (MQ=255)
aTCATTTAAATATCTCATTGTTTATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATg < 1:1094945/140‑1 (MQ=255)
aTCATTTAAATATCTCATTGTTTATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATg > 2:1174087/1‑140 (MQ=255)
aTCATTTAAATATCTCATTGTTTATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATg > 1:1945204/1‑140 (MQ=255)
aTCATTTAAATATCTCATTGTTTATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATg > 1:1715706/1‑140 (MQ=255)
aTCATTTAAATATCTCATTGTTTATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATg > 1:1586459/1‑140 (MQ=255)
aTCATTTAAATATCTCATTGTTTATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATg > 2:660777/1‑140 (MQ=255)
aTTTAAATATCTCATTGTTTATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATgaga > 1:1540754/1‑140 (MQ=255)
ttAAATATCTCATTGTTTATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATc > 2:159058/1‑140 (MQ=255)
tctcATTGTTTATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGAt > 2:1383289/1‑140 (MQ=255)
ctcATTGTTTATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGAtt < 1:1569403/140‑1 (MQ=255)
tcATTGTTTATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGAttt < 1:772935/140‑1 (MQ=255)
tGTTTATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGtt > 1:2153156/1‑140 (MQ=255)
tGTTTATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGtt < 1:1544311/140‑1 (MQ=255)
tttATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTtaa < 1:644059/140‑1 (MQ=255)
tttATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTtaa > 1:1837650/1‑140 (MQ=255)
tttATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTtaa < 2:1918238/140‑1 (MQ=255)
ttATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTtaat < 2:2059327/140‑1 (MQ=255)
tATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTtaata > 1:272592/1‑140 (MQ=255)
tGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAAtt > 2:1291979/1‑140 (MQ=255)
aTGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTaa > 1:1778790/1‑140 (MQ=255)
aTGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTaa < 2:1252883/140‑1 (MQ=255)
aTGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGAGATTTTGTTAATAATTaa < 1:611714/140‑1 (MQ=255)
tCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTg > 2:485067/1‑140 (MQ=255)
tCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTg > 1:1935279/1‑140 (MQ=255)
aaTTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTg > 2:859520/1‑140 (MQ=255)
tAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGa > 2:2209021/1‑136 (MQ=255)
aCTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTa > 1:998541/1‑140 (MQ=255)
aTCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTaaaa > 2:21200/1‑140 (MQ=255)
aTCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTaaaa > 2:1862226/1‑140 (MQ=255)
tCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTaaaaa < 1:485067/140‑1 (MQ=255)
aCAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATg < 1:1590530/140‑1 (MQ=255)
aGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCt < 2:1586459/140‑1 (MQ=255)
aGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCt < 1:866648/140‑1 (MQ=255)
aGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCt < 1:1632097/140‑1 (MQ=255)
gTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCt < 2:1772147/139‑1 (MQ=255)
gTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTg > 1:939077/1‑140 (MQ=255)
tGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGa > 1:1382172/1‑140 (MQ=255)
tGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGa < 2:1782928/140‑1 (MQ=255)
tGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGa > 2:109473/1‑140 (MQ=255)
tGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGa < 1:1862226/140‑1 (MQ=255)
tGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGa < 2:560613/140‑1 (MQ=255)
tGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGa < 1:955676/140‑1 (MQ=255)
tGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGCTTAAAAATAATGCTGa < 2:1999966/140‑1 (MQ=255)
cgAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCAGTAAAAGGTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGa > 2:2295804/2‑140 (MQ=255)
gAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGttt > 1:1344425/1‑125 (MQ=255)
gAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCt > 1:1473281/1‑137 (MQ=255)
gAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGa < 2:299700/139‑1 (MQ=255)
gAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAg > 2:1477246/1‑140 (MQ=255)
aaaaaaTTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGt > 1:677076/1‑140 (MQ=255)
aTTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGt > 1:1880652/1‑135 (MQ=255)
aTTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCAGCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTtaata < 1:157293/140‑1 (MQ=255)
ttAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATaaa < 1:1793787/140‑1 (MQ=255)
ttAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATaaa < 1:31493/140‑1 (MQ=255)
ttAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATaaa < 2:272592/140‑1 (MQ=255)
ttAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATaaa < 2:1546536/140‑1 (MQ=255)
tAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCt > 2:2338804/1‑128 (MQ=255)
tAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGt > 1:2216257/1‑132 (MQ=255)
tAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATaaaa > 1:103783/1‑140 (MQ=255)
tAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATaaaa < 2:1368392/140‑1 (MQ=255)
aaTATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAg < 2:1540754/140‑1 (MQ=255)
tGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAgtgtg < 1:46451/140‑1 (MQ=255)
aTTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGtgtgtg < 1:1174087/140‑1 (MQ=255)
aTTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGtgtgtg < 2:1328991/140‑1 (MQ=255)
aTTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGtgtgtg < 2:414770/140‑1 (MQ=255)
aTTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTAAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGtgtgtg > 1:414770/1‑140 (MQ=255)
ttACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGa > 2:82804/1‑140 (MQ=255)
tACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGaa < 1:1330665/140‑1 (MQ=255)
aaCTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAgtg > 1:1326558/1‑140 (MQ=255)
cTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTa < 1:2008910/140‑1 (MQ=255)
cTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTa < 2:1935279/140‑1 (MQ=255)
aaGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGtgtgtg > 2:882578/1‑130 (MQ=255)
aaGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGtgtgtg < 2:1336497/130‑1 (MQ=255)
aaGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGaa > 1:514910/1‑132 (MQ=255)
aaGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGaa < 2:514910/132‑1 (MQ=255)
aaGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGa > 2:1644551/1‑140 (MQ=255)
aaGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGa > 1:292234/1‑140 (MQ=255)
aaGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGa > 2:1466367/1‑140 (MQ=255)
aaGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGa > 1:2197754/1‑140 (MQ=255)
aaaTATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACAt < 1:2126610/140‑1 (MQ=255)
aaTATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACAtt > 2:465035/1‑140 (MQ=255)
atatCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTa > 2:2258763/1‑140 (MQ=255)
atatCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTa > 1:2324014/1‑140 (MQ=255)
aaTCGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTAttt > 1:2179587/1‑140 (MQ=255)
cGCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTgg > 1:524756/1‑140 (MQ=255)
gCTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGc > 2:574071/1‑140 (MQ=255)
cTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCg > 2:1141664/1‑140 (MQ=255)
cTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCg > 2:1568224/1‑140 (MQ=255)
cTCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCg > 1:821945/1‑140 (MQ=255)
tCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACa > 1:1769307/1‑123 (MQ=255)
tCAATCTCATAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGt > 2:719963/1‑140 (MQ=255)
aTAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGa < 2:2153156/140‑1 (MQ=255)
aTAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGa < 2:755694/140‑1 (MQ=255)
aTAATGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGa > 1:755694/1‑140 (MQ=255)
tGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTaa > 2:70114/1‑140 (MQ=255)
tGCATCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTaa < 2:1977246/140‑1 (MQ=255)
|
CTACGAGGAATACGAGTAATCATTTAAATATCTCATTGTTTATTGATGTCTTGAATTTTAACTATCAGAACAGTGAAAAAATTTAATATGATTACAACTAAAGAAATATCATAAATCGCTCAATCTCATAATGCAGCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAA > NC_000913/4222465‑4222735
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
