Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F73 I1 R1
|
23 |
119.7 |
4117902 |
99.2% |
4084958 |
139.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,358,858 |
G→T |
L1378L (CTG→CTT) |
gltB → |
glutamate synthase subunit GltB |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,358,858 | 0 | G | T | 100.0%
| 368.2
/ NA
| 103 | L1378L (CTG→CTT) | gltB | glutamate synthase subunit GltB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (63/40); total (63/40) |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GCGACCGGTGGTCGTCTGTATGCCGCAGGCCGCGCGGGTGAACGTTTCGGCGTGCGTAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTGGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGACGCTCTGGCGATCCATG > NC_000913/3358721‑3358994
|
gcgACCGGTGGTCGTCTGTATGCCGCAGGCCGCGCGGGTGAACGTTTCGGCGTGCGTAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTtgg > 2:1571718/1‑140 (MQ=255)
cgACCGGTGGTCGTCTGTATGCCGCAGGCCGCGCGGGTGAACGTTTCGGCGTGCGTAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGt < 1:1077260/140‑1 (MQ=255)
cGGTGGTCGTCTGTATGCCGCAGGCCGCGCGGGTGAACGTTTCGGCGTGCGTAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTaaaa < 1:916125/140‑1 (MQ=255)
cgtcTGTATGCCGCAGGCCGCGCGGGTGAACGTTTCGGCGTGCGTAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGt < 2:1760770/140‑1 (MQ=255)
gtcTGTATGCCGCAGGCCGCGCGGGTGAACGTTTCGGCGTGCGTAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGtt < 1:1052766/140‑1 (MQ=255)
tcTGTATGCCGCAGGCCGCGCGGGTGAACGTTTCGGCGTGCGCAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTa > 1:1473391/1‑140 (MQ=255)
tATGCCGCAGGCCGCGCGGGTGAACGTTTCGGCGTGCGTAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACtt > 1:552748/1‑140 (MQ=255)
tATGCCGCAGGCCGCGCGGGTGAACGTTTCGGCGTGCGTAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACtt > 2:869598/1‑140 (MQ=255)
gCCGCAGGCCGCGCGGGTGAACGTTTCGGCGTGCGTAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCgg > 2:1856168/1‑140 (MQ=255)
cGCAGGCCGCGCGGGTGAACGTTTCGGCGTGCGTAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTg > 2:758021/1‑140 (MQ=255)
cAGGCCGCGCGGGTGAACGTTTCGGCGTGCGTAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAAcc > 1:558898/1‑122 (MQ=255)
gCCGCGCGGGTGAACGTTTCGGCGTGCGTAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGc > 1:1439815/1‑140 (MQ=255)
ccGCGCGGGTGAACGTTTCGGCGTGCGTAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCa < 2:1496165/140‑1 (MQ=255)
cgcgGGTGAACGTTTCGGCGTGCGTAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGa > 1:484231/1‑140 (MQ=255)
cgcgGGTGAACGTTTCGGCGTGCGTAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGa > 2:21250/1‑140 (MQ=255)
cgGGTGAACGTTTCGGCGTGCGTAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGAcc < 2:701660/140‑1 (MQ=255)
gTGAACGTTTCGGCGTGCGTAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACcggc > 1:1449541/1‑140 (MQ=255)
tGAACGTTTCGGCGTGCGTAACTCCGGTGCTACCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACCACGGTTGTGAATATATGACGGGTGACAACATATGGACTCTCGGGAACGACAGCGTTTACTTCGGTGCGGGCATGACcggcg > 2:1776373/1‑140 (MQ=255)
cGGCGTGCGTAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCtt > 2:1804408/1‑140 (MQ=255)
cgtgcgtAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACg < 1:829852/140‑1 (MQ=255)
tgcgtAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTTGCTTACGtt > 2:897489/1‑140 (MQ=255)
tgcgtAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGtt < 2:1439815/140‑1 (MQ=255)
tgcgtAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGtt > 2:2001062/1‑140 (MQ=255)
gcgtAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTtc < 1:1103907/140‑1 (MQ=255)
gcgtAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTtc < 2:1449541/140‑1 (MQ=255)
cGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGaaa < 2:741098/140‑1 (MQ=255)
ggTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAg > 2:394051/1‑140 (MQ=255)
gTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGATAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCCTACGTTCTCGTTGTAAga > 1:1771991/1‑139 (MQ=255)
cTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAgcggc > 2:1394029/1‑140 (MQ=255)
cTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAgcggc > 1:1726768/1‑140 (MQ=255)
aTCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTTGCTTACGGTCTCGATGAAAGACGCGa > 1:1094415/1‑140 (MQ=255)
aTCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGAGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTTTCTTACCTTCTCGATTAAAGCGGGGa > 1:780518/1‑140 (MQ=255)
gTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGGGGGCATGACCGGCGGTTTCATTTACGTTCTCGGCTAAAGCGGGGGttttcc > 2:1815723/1‑137 (MQ=255)
ggTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCa > 1:1425546/1‑140 (MQ=255)
gTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTTCGGTCTTGATTAAAGCGGCGATTTCCGCaa > 2:252227/1‑140 (MQ=255)
gTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCaa < 1:758021/140‑1 (MQ=255)
aGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCCTACGGTCTCGATGAAAGCGGGGATTTCCGCcaaa > 2:347463/1‑139 (MQ=255)
ggCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGt < 1:1618168/140‑1 (MQ=255)
ggCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGt < 2:552748/140‑1 (MQ=255)
ggCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGt < 1:1796588/140‑1 (MQ=255)
ggCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGt < 1:869598/140‑1 (MQ=255)
ggCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGt < 2:484231/140‑1 (MQ=255)
gCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGtt < 2:1425546/140‑1 (MQ=255)
tGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTTGCTTACGTTCTCGGTGAAAGCGGCGGTTTCCGCAAACGCGTTAAcc > 2:1467575/1‑140 (MQ=255)
tGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTAAGTTTTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAAcc > 1:1156137/1‑140 (MQ=255)
tGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGATAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAAcc > 2:1882039/1‑140 (MQ=255)
ttGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCg > 1:1208682/1‑140 (MQ=255)
tgtgAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGt < 2:828315/122‑1 (MQ=255)
tgtgAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGt > 1:828315/1‑122 (MQ=255)
tgtgAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGa < 1:1394029/140‑1 (MQ=255)
gtgAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAg < 1:1011971/140‑1 (MQ=255)
atatatGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCt < 1:1278863/140‑1 (MQ=255)
atatGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTa < 2:176704/140‑1 (MQ=255)
tatGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGa < 2:222634/132‑1 (MQ=255)
tatGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGa > 1:222634/1‑132 (MQ=255)
atGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGGGGATTTCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAg > 2:1016050/1‑140 (MQ=255)
atGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGGTTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGGCTTAAg > 2:913693/1‑140 (MQ=255)
atGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAg > 2:332943/1‑140 (MQ=255)
atGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAg > 2:1520918/1‑140 (MQ=255)
atGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAg > 2:1733411/1‑140 (MQ=255)
atGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAAAGGGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGGCTTAAg > 2:121858/1‑140 (MQ=255)
atGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGGTCTCGATGAAAACGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAg > 1:1328182/1‑140 (MQ=255)
gACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCg > 1:1078697/1‑140 (MQ=255)
aCGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGGCTTAAGCGt > 2:786109/1‑140 (MQ=255)
cGGGTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCTATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGtt > 1:192108/1‑140 (MQ=255)
gggTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTTCGTTCTCGCGGAAAGCGGCGCTTTCCCCCAACGCGCTAAACCCGAATCGGGCGGGGTCTTAAGCGttt > 2:920177/1‑139 (MQ=255)
gggTGGTATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTg > 2:845694/1‑140 (MQ=255)
ggtggtATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGa < 1:252227/140‑1 (MQ=255)
ggtggtATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGa < 1:845694/140‑1 (MQ=255)
gtggtATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTTGATTTCGCTCTCGCTGAAAGCGGCGGTTTTCGCCAACGCGTTACACCGGAACAGGTCGAGGGCTTAAACgattag > 2:31550/1‑135 (MQ=255)
gtggtATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGAc > 1:1166310/1‑140 (MQ=255)
gtggtATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGAc > 2:535647/1‑140 (MQ=255)
gtggtATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGGCTTAAGCGTTGAc > 2:343458/1‑140 (MQ=255)
tggtATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGACg < 1:1733411/140‑1 (MQ=255)
ggtATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGGTTTCCGCAAACGCGTTAACCCCGGACTGGGCGAGGGCTTAAGCGTTGACGc > 2:1489313/1‑140 (MQ=255)
gtATCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGGCTTAAGCGTTGACGct > 2:607406/1‑140 (MQ=255)
tCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGACGCTCTg > 1:1038944/1‑140 (MQ=255)
tCGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGGCTTAAGCGTTGACGCTCTg > 2:1447807/1‑140 (MQ=255)
cGTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGACGCTCTgg > 1:1195703/1‑140 (MQ=255)
gagacagttCTTGGTAAAACCGGCGTTAGCTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGACGCTCTGGc < 1:2003045/133‑1 (MQ=255)
gTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCTATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGACGCTCTGGc < 2:192108/140‑1 (MQ=255)
gTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGACGCTCTGGc < 1:1855411/140‑1 (MQ=255)
gTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGACGCTCTGGc < 1:708898/140‑1 (MQ=255)
gTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGACGCTCTGGc < 1:1571718/140‑1 (MQ=255)
gTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGACGCTCTGGc < 1:1524803/140‑1 (MQ=255)
gTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGACGCTCTGGc < 1:1520918/140‑1 (MQ=255)
gTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGACGCTCTGGc < 1:931220/140‑1 (MQ=255)
gTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGACGCTCTGGc < 2:1195703/140‑1 (MQ=255)
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gTCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTCTAGTGAGTCGTTGACAGGGTGTTTCGCTTACGTTCTCGATCAAAGCGCCGATTTCCGCAAACGCGTTTACCCGGAACTGGTTGAGGTCTTAAGCGTTGACGATCTGGc < 2:1771991/140‑1 (MQ=255)
tCTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGACGCTCTGGCg > 1:1075729/1‑140 (MQ=255)
cTGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGACGCTCTGGCGa < 2:1473391/140‑1 (MQ=255)
tGCATTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTTTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAAATGGTCGAGGGCTTAAGCGTTGACGCCCTGGCGAt > 2:1069187/1‑140 (MQ=255)
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aTTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGACGCTCTGGCGATCCa > 2:699000/1‑140 (MQ=255)
aTTCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGACGCTCTGGCGATCCa > 2:461205/1‑140 (MQ=255)
aTTCTTGGTAAAACCGGCGATAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGACGCTCTGGCGATCCa < 1:1882039/140‑1 (MQ=255)
tCTTGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCCGCTATGTTTTCCATGGAAGCGGCGATTTCCGCAAACACGTTAAACCGGAACTGGTTCAGGACTTAACCGTTGTCGATCTGGCGCTCCAta > 2:1797276/1‑139 (MQ=255)
|
GCGACCGGTGGTCGTCTGTATGCCGCAGGCCGCGCGGGTGAACGTTTCGGCGTGCGTAACTCCGGTGCTATCACCGTGGTAGAAGGCATTGGCGACAACGGTTGTGAATATATGACGGGTGGTATCGTCTGCATTCTGGGTAAAACCGGCGTTAACTTCGGTGCGGGCATGACCGGCGGTTTCGCTTACGTTCTCGATGAAAGCGGCGATTTCCGCAAACGCGTTAACCCGGAACTGGTCGAGGTCTTAAGCGTTGACGCTCTGGCGATCCATG > NC_000913/3358721‑3358994
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
