Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F28 I1 R1
|
112 |
94.0 |
3211786 |
99.3% |
3189303 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,719,916 |
C→T |
intergenic (+148/‑133) |
yiaG → / → cspA |
putative DNA‑binding transcriptional regulator YiaG/cold shock protein CspA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,719,916 | 0 | C | T | 99.2%
| 425.2
/ NA
| 120 | intergenic (+148/‑133) | yiaG/cspA | putative DNA‑binding transcriptional regulator YiaG/cold shock protein CspA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (62/57); total (63/57) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
TATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGCAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAGGCACACTTAATTATTAAAGGTAATACACTAT > NC_000913/3719783‑3720050
|
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tttACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCa > 2:734430/1‑140 (MQ=255)
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tgatgaCAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCa > 2:1043096/1‑140 (MQ=255)
cAGGCCCGTTTTCCAACCGATTAATCAAAAATATAAAAAATAATTGTTGCATCCCCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGtt < 2:772893/140‑1 (MQ=255)
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aGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTa > 1:918403/1‑140 (MQ=255)
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aGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTa > 2:426849/1‑140 (MQ=255)
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gACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATc > 1:481497/1‑140 (MQ=255)
ccGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGt < 2:1035606/140‑1 (MQ=255)
gTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTg < 1:1534211/140‑1 (MQ=255)
ttttCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAagag < 2:338684/130‑1 (MQ=255)
ttttCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAagag > 1:338684/1‑130 (MQ=255)
ttttCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGa > 1:1008112/1‑140 (MQ=255)
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aaCCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATAcccc < 1:340355/140‑1 (MQ=255)
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gATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGAt < 1:1053010/131‑1 (MQ=255)
gATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGt > 1:759459/1‑140 (MQ=255)
gATAAACCATAAATATAAAAAAAATTTGTTGCATCTCCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGt < 2:669283/140‑1 (MQ=255)
aaTTAATCATAAATATAAAAAATAATTGTTGCACCCCCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGt < 2:722385/139‑1 (MQ=255)
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ttAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGAt > 1:902375/1‑129 (MQ=255)
ttAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAg > 1:321197/1‑140 (MQ=255)
tCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGca < 1:574091/140‑1 (MQ=255)
tCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGca < 2:1222380/140‑1 (MQ=255)
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aTAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGcaca < 2:183852/140‑1 (MQ=255)
aTAAATATAAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGcaca < 2:722303/140‑1 (MQ=255)
tAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACAt > 1:722385/1‑140 (MQ=255)
aaTATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTc > 1:272388/1‑140 (MQ=255)
aaTATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGCAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTc > 2:1407812/1‑140 (MQ=255)
tGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCttt > 1:307245/1‑140 (MQ=255)
tGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCttt > 1:1003957/1‑140 (MQ=255)
tGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCttt > 2:143420/1‑140 (MQ=255)
aaaaTAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAAc < 1:494470/140‑1 (MQ=255)
atTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGca > 1:710234/1‑122 (MQ=255)
atTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCa > 1:176333/1‑140 (MQ=255)
atTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCa > 2:437584/1‑140 (MQ=255)
tgttgCATCCCCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCaaa < 2:151809/140‑1 (MQ=255)
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aTCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGt > 1:1054632/1‑140 (MQ=255)
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aCCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTaaa < 1:739554/140‑1 (MQ=255)
cccGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAg < 2:918403/140‑1 (MQ=255)
cccGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAg > 1:1479095/1‑140 (MQ=255)
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aTGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAAAGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCa < 2:1003957/140‑1 (MQ=255)
gCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCata < 2:1054632/140‑1 (MQ=255)
gCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCata < 1:1043096/140‑1 (MQ=255)
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cGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGcc > 2:787833/1‑136 (MQ=255)
tGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCg > 2:706477/1‑140 (MQ=255)
ggCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGc > 1:302922/1‑140 (MQ=255)
gCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGcc < 2:8693/140‑1 (MQ=255)
cTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCg > 1:792904/1‑140 (MQ=255)
cTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACAGTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCg > 2:1486579/1‑140 (MQ=255)
tAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGaa < 1:1416691/140‑1 (MQ=255)
tAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGaa < 1:155507/140‑1 (MQ=255)
aTGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAg > 1:1452037/1‑140 (MQ=255)
tGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAgg < 1:1111757/140‑1 (MQ=255)
tGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAgg < 2:272388/140‑1 (MQ=255)
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gCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAGGc < 1:734430/140‑1 (MQ=255)
cacaTCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAGGca < 1:437584/140‑1 (MQ=255)
cacaTCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAGGca < 1:813953/140‑1 (MQ=255)
caTCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAGGcaca < 2:302922/140‑1 (MQ=255)
aTCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAgg > 2:768543/1‑135 (MQ=255)
aTCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAGGCacac < 2:792904/140‑1 (MQ=255)
aTCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAGGCacac > 1:1029204/1‑140 (MQ=255)
aCGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAGGCACACTTaa > 1:1572788/1‑140 (MQ=255)
cGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAGGca < 1:339141/132‑1 (MQ=255)
cGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAGGCACACTTa > 1:455728/1‑138 (MQ=255)
cGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAGGCACACTTa < 2:455728/138‑1 (MQ=255)
cGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAGGCACACTTAat > 1:1433602/1‑140 (MQ=255)
gTACAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAGGCACACTTAATTATTAAAgg < 2:542941/140‑1 (MQ=255)
aaaGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAGGCACACTTAATTATTAAAGGTa < 2:1147963/138‑1 (MQ=255)
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cAGACCATTAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAGGCACACTTAATTATTAAAGGTaa < 2:17736/140‑1 (MQ=255)
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tAAAGTAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAGGCACACTTAATTATTAAAGGTAATACACTAt > 1:345564/1‑140 (MQ=255)
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TATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGCAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAAGAGTTATCGTTGATACCCCTCGTAGTGCACATTCCTTTAACGCTTCAAAATCTGTAAAGCACGCCATATCGCCGAAAGGCACACTTAATTATTAAAGGTAATACACTAT > NC_000913/3719783‑3720050
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
