Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F28 I1 R1
|
224 |
87.5 |
2960670 |
99.3% |
2939945 |
138.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,501,834 |
T→C |
H189H (CAT→CAC) |
frlB → |
fructoselysine 6‑phosphate deglycase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,501,834 | 0 | T | C | 98.4%
| 419.2
/ ‑3.6
| 124 | H189H (CAT→CAC) | frlB | fructoselysine 6‑phosphate deglycase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (62/60); total (63/61) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
CAGGCCGACTGTATCTGGGAAATTCACCTGCTGCTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCATCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGTTACAAAGAAGGCATTGTAACGCTGATGGA > NC_000913/3501697‑3501965
|
gCCGACTGTATCTGGGAAATTCACCTGCTGCTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGt > 1:1094933/1‑140 (MQ=255)
gCCGACTGTATCTGGGAAATTCACCTGCTGCTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCAGTCACCTGGt > 2:422618/1‑140 (MQ=255)
ccGACTGTATCTGGGAAATTCACCTGCTGCTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCAGTCACCTGGTa < 1:422618/140‑1 (MQ=255)
cGACTGTATCTGGGAAATTCACCTGCTGCTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGTACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTAc > 2:912908/1‑140 (MQ=255)
cGACTGTATCTGGGAAATTCACCTGCTGCTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTAc > 2:1385272/1‑140 (MQ=255)
aCTGTATCTGGGAAATTCACCTGCTGCTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGTGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGc > 2:1039256/1‑140 (MQ=255)
cTGTATCTGGGAAATTCACCTGCTGCTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACGTGGTACGCa < 2:1229095/140‑1 (MQ=255)
tGTATCTGGGAAATTCACCTGCTGCTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCAc < 1:487089/140‑1 (MQ=255)
tGTATCTGGGAAATTCACCTGCTGCTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCAc > 1:258436/1‑140 (MQ=255)
tATCTGGGAAATTCACCTGCTGCTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCt < 2:365244/140‑1 (MQ=255)
ggAAATTCACCTGCTGCTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGgaag > 1:1271079/1‑140 (MQ=255)
gAAATTCACCTGCTGCTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGgaaga > 2:460883/1‑140 (MQ=255)
aaaTTCACCTGCTGCTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGgaagaa > 1:863050/1‑140 (MQ=255)
aaTTCACCTGCTGCTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGaaa < 2:896004/140‑1 (MQ=255)
aTTCACCTGCTGCTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGaaaa > 2:1378399/1‑140 (MQ=255)
aTTCACCTGCTGCTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGaaaa > 2:1014854/1‑140 (MQ=255)
aTTCACCTGCTGCTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCAGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTAACCTGGTACGCACCTGGGAAGaaaa > 1:675419/1‑140 (MQ=255)
tgctgcTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGgccgc < 2:863050/140‑1 (MQ=255)
tgctgcTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGgccgc < 1:972841/140‑1 (MQ=255)
ctgctctgctACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCa < 2:1271079/140‑1 (MQ=255)
ctgctctgctACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCa < 1:303665/140‑1 (MQ=255)
ctctgctACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCt < 1:1014854/140‑1 (MQ=255)
ctACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTg > 2:1220367/1‑140 (MQ=255)
ctACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTg > 1:192002/1‑140 (MQ=255)
aCAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGaa > 1:1050535/1‑140 (MQ=255)
cAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAAc < 2:909246/140‑1 (MQ=255)
gCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTg > 1:860522/1‑140 (MQ=255)
gCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTg > 2:397602/1‑140 (MQ=255)
cGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTgg > 1:1321375/1‑140 (MQ=255)
cGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTgg > 1:1402926/1‑140 (MQ=255)
tggtgCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGgcc > 1:295167/1‑140 (MQ=255)
tggtgCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGgcc > 1:906207/1‑140 (MQ=255)
tggtgCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGgcc > 2:717413/1‑140 (MQ=255)
tggtgCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGgcc > 2:762189/1‑140 (MQ=255)
tggtgCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGgcc > 1:38372/1‑140 (MQ=255)
gtgCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGACTGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGgcc < 2:1319623/138‑1 (MQ=255)
gtgCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCATCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGgccag > 2:278722/1‑140 (MQ=255)
gtgCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGgccag > 2:1244986/1‑140 (MQ=255)
gtgCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGgccag > 1:950864/1‑140 (MQ=255)
gtgCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGgccag > 1:37627/1‑140 (MQ=255)
tgCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGgccagc > 1:324976/1‑140 (MQ=255)
ggAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGt < 2:38372/140‑1 (MQ=255)
gatgatCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGc < 2:258436/140‑1 (MQ=255)
tgatCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCg < 2:950864/140‑1 (MQ=255)
tgatCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCg < 1:123328/140‑1 (MQ=255)
tgatCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCg < 2:860522/140‑1 (MQ=255)
gatCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCga > 1:481841/1‑140 (MQ=255)
gatCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCga > 2:824242/1‑140 (MQ=255)
gatCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTAGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCga > 1:356854/1‑140 (MQ=255)
atCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCgat < 2:723538/140‑1 (MQ=255)
atCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCgat > 1:723538/1‑140 (MQ=255)
cccGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGAtt > 1:474865/1‑140 (MQ=255)
cccGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGAtt > 1:932116/1‑140 (MQ=255)
ccTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTtata > 2:1045382/1‑140 (MQ=255)
ccTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTtata > 1:433710/1‑140 (MQ=255)
cTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGAACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATAc > 1:774780/1‑140 (MQ=255)
tCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCg > 1:20197/1‑128 (MQ=255)
tCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCg < 2:20197/128‑1 (MQ=255)
gcgcCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGt > 1:799534/1‑140 (MQ=255)
cgcCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGtt > 1:69962/1‑140 (MQ=255)
cgcCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGtt > 1:643585/1‑140 (MQ=255)
gAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTtgctg < 1:1355321/140‑1 (MQ=255)
gAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTAGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTtgctg < 2:356854/140‑1 (MQ=255)
cgcgGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCgg < 2:433710/140‑1 (MQ=255)
gcgGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCggg < 1:956504/140‑1 (MQ=255)
gcgGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCggg < 2:324976/140‑1 (MQ=255)
cgGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGt < 2:295167/140‑1 (MQ=255)
gAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTcc < 2:481841/140‑1 (MQ=255)
aGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCg < 2:1094933/140‑1 (MQ=255)
aGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCg < 2:643585/140‑1 (MQ=255)
aGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGAGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCg < 2:1049844/140‑1 (MQ=255)
aTCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGTCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCt < 2:1402926/140‑1 (MQ=255)
aTCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCt < 1:825538/140‑1 (MQ=255)
aTCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCt < 2:932116/140‑1 (MQ=255)
aTCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCt < 1:397602/140‑1 (MQ=255)
aTCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCt < 2:799534/140‑1 (MQ=255)
aTCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCt < 2:474865/140‑1 (MQ=255)
aTCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCt < 1:717413/140‑1 (MQ=255)
aaaaaCGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTggg < 1:1244986/140‑1 (MQ=255)
aaaCGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGtt < 1:1045382/140‑1 (MQ=255)
aaaCGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTAGGAAGAAAAGGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGtt < 2:1321375/140‑1 (MQ=255)
aaaCGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTAACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGtt < 2:675419/140‑1 (MQ=255)
aTCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGTTACaaa > 2:364520/1‑140 (MQ=255)
aTCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGTTACaaa > 1:1366147/1‑140 (MQ=255)
tctcAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCg > 1:813839/1‑123 (MQ=255)
tctcAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCg < 2:813839/123‑1 (MQ=255)
tctcAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGTTACAaag > 2:1106863/1‑140 (MQ=255)
ctcAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGTTACAaaga < 2:829505/140‑1 (MQ=255)
aaGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGTTACAAAGAAgg < 1:733878/140‑1 (MQ=255)
aaGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGTTACAAAGAAgg < 2:69962/140‑1 (MQ=255)
ccgTTGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGTTACAAAGAAGGCAt < 2:1366147/138‑1 (MQ=255)
ttGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGTTACAAAGAAGGCATTGt > 1:1177301/1‑140 (MQ=255)
tGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGTTACAaaga < 1:1189668/130‑1 (MQ=255)
tGCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGTTACAaaga > 2:1189668/1‑130 (MQ=255)
gCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGTTACAAAGAAGGCATTGTaa < 2:37627/140‑1 (MQ=255)
gCCGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGTTACAAAGAAGGCATTGTaa < 1:1013966/140‑1 (MQ=255)
cGAATGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGTTACAAAGAAGGCATTGTAACg < 1:1378399/140‑1 (MQ=255)
tGCGCTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGTTACAAAGAAGGCATTGTAACGCTGa < 1:1106863/140‑1 (MQ=255)
gcgcTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGTTACAAAGAAGGCATTGTAACGCTGAt < 1:1220367/140‑1 (MQ=255)
cTCGGTCACCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGTTACAAAGAAGGCATTGTAACGCTGATGGa > 1:1055329/1‑140 (MQ=255)
|
CAGGCCGACTGTATCTGGGAAATTCACCTGCTGCTCTGCTACAGCGTGGTGCTGGAGATGATCACCCGCCTCGCGCCGAACGCGGAAATCGGCAAGATCAAAAACGATCTCAAGCAGTTGCCGAATGCGCTCGGTCATCTGGTACGCACCTGGGAAGAAAAAGGCCGCCAGCTTGGTGAACTGGCCAGCCAGTGGCCGATGATTTATACCGTTGCTGCGGGTCCGCTGCGTCCGCTGGGTTACAAAGAAGGCATTGTAACGCTGATGGA > NC_000913/3501697‑3501965
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
