Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F28 I1 R1
|
151 |
83.1 |
2798978 |
99.4% |
2782184 |
139.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,931,183 |
(G)7→8 |
intergenic (‑90/‑133) |
ravA ← / → kup |
regulatory ATPase RavA/K(+):H(+) symporter Kup |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,931,176 | 1 | . | G | 96.0%
| 347.9
/ 5.0
| 100 | intergenic (‑83/‑140) | ravA/kup | regulatory ATPase RavA/K(+):H(+) symporter Kup |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/1); new base G (48/48); total (51/49) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.18e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
TTCCAACGAACTGCTCAGGCGGGAAATTCTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑A‑‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGACTAAGCACACATTTCATATTTCAACGAAAGACT > NC_000913/3931037‑3931310
|
ttCCAACGAACTGCTCAGGCGGGAAATTCTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑aa‑a > 2:31211/1‑140 (MQ=255)
ttCCAACGAACTGCTCAGGCGGGAAATTCTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑aa‑a > 2:1236262/1‑140 (MQ=255)
cAACGAACTGCTCAGGCGGGAAATTCTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑A‑‑ggg < 2:122533/140‑1 (MQ=255)
aCGAACTGCTCAGGCGGGAAATTCTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑A‑‑ggggg > 2:764090/1‑140 (MQ=255)
aCGAACTGCTCAGGCGGGAAATTCTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑A‑‑ggggg < 1:409564/140‑1 (MQ=255)
cTGCTCAGGCGGGAAATTCTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑A‑‑ggggg‑ggggg > 1:270512/1‑137 (MQ=255)
cTCAGGCGGGAAATTCTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑aa‑a > 1:1028394/1‑127 (MQ=255)
cTCAGGCGGGAAATTCTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑aa‑a < 2:1028394/127‑1 (MQ=255)
gCGGGAAATTCTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCtt > 2:540067/1‑140 (MQ=255)
gCGGGAAATTCTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCtt > 2:11359/1‑140 (MQ=255)
ggAAATTCTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGa > 1:178481/1‑140 (MQ=255)
gAAATTCTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAg < 1:416992/140‑1 (MQ=255)
gAAATTCTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCAGGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAg < 2:1247943/140‑1 (MQ=255)
aaaTTCTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGc < 1:563021/140‑1 (MQ=255)
cTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGt > 1:960236/1‑140 (MQ=255)
cTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGt > 2:847489/1‑140 (MQ=255)
tCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AGGGGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTa > 2:787772/1‑140 (MQ=255)
ccGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAAt < 2:126050/140‑1 (MQ=255)
taataaATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTgg < 2:1308877/140‑1 (MQ=255)
taataaATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTgg < 1:1236262/140‑1 (MQ=255)
taataaATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTgg < 1:461129/140‑1 (MQ=255)
aataaATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGc > 1:484973/1‑140 (MQ=255)
ataaATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGcc < 2:1188897/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGACAGGTTAATGTGGCCGCAtt > 1:1158249/1‑140 (MQ=255)
gAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCAttt < 1:36807/140‑1 (MQ=255)
gAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCAttt < 1:539989/140‑1 (MQ=255)
gggTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAg > 2:947081/1‑140 (MQ=255)
gggTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAg > 2:1314652/1‑140 (MQ=255)
ggTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAgg > 2:161583/1‑140 (MQ=255)
gTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGa > 2:672516/1‑140 (MQ=255)
gTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGa > 1:987958/1‑140 (MQ=255)
tGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AAGG‑‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAg > 1:76493/1‑140 (MQ=255)
tGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAg > 2:1254712/1‑140 (MQ=255)
aGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTa > 2:1298297/1‑140 (MQ=255)
aGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTa > 1:780430/1‑140 (MQ=255)
aGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTa > 2:462759/1‑140 (MQ=255)
tAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCAttt > 1:57807/1‑128 (MQ=255)
tAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCAttt < 2:57807/128‑1 (MQ=255)
tAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGAtt < 2:1335909/140‑1 (MQ=255)
aaTGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGAttt > 2:1012011/1‑140 (MQ=255)
aaTGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGAttt > 1:365000/1‑140 (MQ=255)
aaTGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGAttt > 1:587395/1‑140 (MQ=255)
aaTGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGAttt > 2:955464/1‑140 (MQ=255)
gTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGt < 1:1156550/140‑1 (MQ=255)
gTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGt < 1:462759/140‑1 (MQ=255)
tGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGtt > 2:416915/1‑140 (MQ=255)
tGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑A‑‑GGGGGTGGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTCAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGtt > 1:1092530/1‑140 (MQ=255)
ggCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTa < 1:704846/140‑1 (MQ=255)
ggCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTa < 1:540067/140‑1 (MQ=255)
ggCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTa < 1:1012011/140‑1 (MQ=255)
ggCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTa < 1:11359/140‑1 (MQ=255)
gCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGt > 1:234010/1‑137 (MQ=255)
gCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGt < 2:234010/137‑1 (MQ=255)
gCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTaa > 1:934533/1‑140 (MQ=255)
gCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTaa < 1:416915/140‑1 (MQ=255)
gCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTaa > 1:1193162/1‑140 (MQ=255)
gCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTa < 1:1115429/139‑1 (MQ=255)
gCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTa > 2:1115429/1‑139 (MQ=255)
gCGTCCTTTCGTCAAAACATCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGCGTACGATTTTGCCGTTaa > 2:927542/1‑140 (MQ=255)
cGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAAt < 1:1342548/140‑1 (MQ=255)
cGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGAATTTTTTTTGGGGCCAGGTTAATGTGGCGGCTTTTAGGGGTAGGATTTTGCGGTTAAt > 2:594984/1‑140 (MQ=255)
tCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATGGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCg > 2:1247846/1‑140 (MQ=255)
tCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAAt < 2:178599/138‑1 (MQ=255)
tCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAAt > 1:178599/1‑138 (MQ=255)
tCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCg > 2:1294922/1‑140 (MQ=255)
gTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AGGGGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTa > 1:1304350/1‑130 (MQ=255)
gTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATAc > 1:462188/1‑140 (MQ=255)
aaaGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACtgtg < 1:847489/140‑1 (MQ=255)
aaaGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACtgtg < 1:1298297/140‑1 (MQ=255)
tGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCtttt > 2:733623/1‑140 (MQ=255)
gTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTtg < 2:587395/140‑1 (MQ=255)
aaaTTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTtgtg < 2:1193162/140‑1 (MQ=255)
aaaTTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTtgtg < 1:955464/140‑1 (MQ=255)
ttGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGc < 1:619830/140‑1 (MQ=255)
gCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCa < 2:960236/140‑1 (MQ=255)
gAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAg < 2:484973/140‑1 (MQ=255)
gTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAggg < 2:780430/140‑1 (MQ=255)
ataGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGAc < 1:1314652/140‑1 (MQ=255)
taGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGACt < 1:1247846/140‑1 (MQ=255)
taGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGACt > 2:80352/1‑140 (MQ=255)
gTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGACTAAGca < 2:934533/140‑1 (MQ=255)
gTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGACTAAGca < 1:764090/140‑1 (MQ=255)
tCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAggg < 2:34271/129‑1 (MQ=255)
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tc‑AA‑AG‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGACTAAGCACACATTTCATATTTCAACGAAAGACt < 1:161583/140‑1 (MQ=255)
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TTCCAACGAACTGCTCAGGCGGGAAATTCTTTCCGCTAATAAATGAGGGTGAGCCATAATGAAGTGGCGTCCTTTCGTCAAAAGTTCTGCGTAAATTGCGAGTATAGACGTTTCTTGCTGGTGGCTAAAATAGTCTC‑AA‑A‑‑GGGGG‑GGTATTTTTCTTTGAGCCAGGTTAATGTGGCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGACTAAGCACACATTTCATATTTCAACGAAAGACT > NC_000913/3931037‑3931310
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
