Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A9 F28 I1 R1
|
138 |
91.1 |
3071990 |
99.2% |
3047414 |
138.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,238,397 |
T→C |
V255A (GTT→GCT) |
yjbH → |
YjbH family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,238,397 | 0 | T | C | 100.0%
| 349.0
/ NA
| 99 | V255A (GTT→GCT) | yjbH | YjbH family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (46/53); total (46/53) |
AGACGCCCTGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAACCGCAGCCGCAGGATGCCATTTTGCA > NC_000913/4238262‑4238532
|
aGACGCCCTGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAAc < 1:1117334/140‑1 (MQ=255)
gACGCCCTGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAAcc > 2:91211/1‑140 (MQ=255)
gACGCCCTGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAAcc > 2:592950/1‑140 (MQ=255)
gACGCCCTGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAAcc > 2:1121393/1‑140 (MQ=255)
gACGCCCTGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAAcc < 1:1245342/140‑1 (MQ=255)
aCGCCCTGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCt < 1:384700/140‑1 (MQ=255)
aCGCCCTGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCt < 2:1223397/140‑1 (MQ=255)
cGCCCTGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCtt < 1:635317/140‑1 (MQ=255)
gCCCTGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCt < 2:1399440/138‑1 (MQ=255)
gCCCTGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCt > 1:1399440/1‑138 (MQ=255)
ccTGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGc > 2:469969/1‑140 (MQ=255)
tGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTa > 2:1051050/1‑140 (MQ=255)
aCCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAAc < 1:91211/140‑1 (MQ=255)
cGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGt > 2:130066/1‑140 (MQ=255)
cTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAACTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTgg < 2:1347054/140‑1 (MQ=255)
tGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAAc > 1:128552/1‑122 (MQ=255)
tGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAAc < 2:128552/122‑1 (MQ=255)
gcgcCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCa < 1:655577/140‑1 (MQ=255)
gcgcCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCa < 1:1051050/140‑1 (MQ=255)
ccgctgcaaaCTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCa < 2:1033433/133‑1 (MQ=255)
cgcCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCaa > 2:809052/1‑140 (MQ=255)
cgcCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCaa > 2:1520748/1‑140 (MQ=255)
cgcCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCaa < 2:1128782/140‑1 (MQ=255)
cgcCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCaa < 1:592950/140‑1 (MQ=255)
ccTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAaca < 2:867803/140‑1 (MQ=255)
tGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACAcc < 1:1346046/140‑1 (MQ=255)
aGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGttt > 1:427514/1‑140 (MQ=255)
tGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCg > 2:314205/1‑140 (MQ=255)
tGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCg > 1:726505/1‑140 (MQ=255)
tGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCg > 2:511907/1‑140 (MQ=255)
aaGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGtt < 1:236063/140‑1 (MQ=255)
aGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTa < 1:130066/140‑1 (MQ=255)
aGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTa < 2:887464/140‑1 (MQ=255)
aGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTa < 1:324152/140‑1 (MQ=255)
gCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACg > 1:1355215/1‑140 (MQ=255)
gCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACg > 1:949533/1‑140 (MQ=255)
cAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGt < 2:209110/140‑1 (MQ=255)
cAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGt > 1:78622/1‑140 (MQ=255)
cAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGt > 1:1265758/1‑140 (MQ=255)
cAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGt > 2:429046/1‑140 (MQ=255)
aataatTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGtt < 2:796915/140‑1 (MQ=255)
ataatTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTg < 1:718081/140‑1 (MQ=255)
ataatTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTg > 1:789689/1‑140 (MQ=255)
ataatTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTg > 2:299501/1‑140 (MQ=255)
ataatTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTAGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTg < 2:949974/140‑1 (MQ=255)
ataatTATCAGCAGGATTTTGCCGGAAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGtt < 1:227373/127‑1 (MQ=255)
ataatTATCAGCAGGATTTTGCCGGAAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGtt > 2:227373/1‑127 (MQ=255)
aTCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCAcc < 2:78622/140‑1 (MQ=255)
aTCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCAcc < 2:1265758/140‑1 (MQ=255)
aTCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCAcc < 1:314205/140‑1 (MQ=255)
agcagGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAAc > 1:590194/1‑140 (MQ=255)
agcagGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAAc > 2:1160201/1‑140 (MQ=255)
cagGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCAcc < 1:64788/135‑1 (MQ=255)
cagGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCAcc > 2:64788/1‑135 (MQ=255)
cagGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACtt > 2:1041757/1‑140 (MQ=255)
cagGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACtt > 2:1451842/1‑140 (MQ=255)
gATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGtt < 2:1448877/125‑1 (MQ=255)
gATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGtt > 1:1448877/1‑125 (MQ=255)
gATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTaa > 2:635532/1‑140 (MQ=255)
gATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTaa > 2:960280/1‑140 (MQ=255)
gATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTaa > 1:374978/1‑140 (MQ=255)
tGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATc < 2:794148/140‑1 (MQ=255)
tGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATc > 1:754246/1‑140 (MQ=255)
gggAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTgcg < 2:789689/140‑1 (MQ=255)
ggAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTgcgc < 1:744734/140‑1 (MQ=255)
gAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGcc < 2:754246/140‑1 (MQ=255)
gAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGcc < 2:590194/140‑1 (MQ=255)
gCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGt < 1:1520748/140‑1 (MQ=255)
aaaaaaGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAAc < 1:469969/140‑1 (MQ=255)
aaaaGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCTCGTCTTACAACGa > 2:1518650/1‑140 (MQ=255)
aaaaGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGa > 2:825588/1‑140 (MQ=255)
aaaaGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGa > 2:748035/1‑140 (MQ=255)
tttAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAAcgcccg < 2:1287903/140‑1 (MQ=255)
tttAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAAcgcccg < 2:556580/140‑1 (MQ=255)
aaCGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACgcccgccc < 1:257064/140‑1 (MQ=255)
aaCGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACgcccgccc < 1:809052/140‑1 (MQ=255)
aCGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGcccgcccg > 2:449655/1‑140 (MQ=255)
aCGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGcccgcccg < 1:1121393/140‑1 (MQ=255)
aCGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCCTACAACGATAACGcccgcccg < 2:1088212/140‑1 (MQ=255)
cGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCccgcccgc < 1:299501/140‑1 (MQ=255)
cGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCccgcccgc > 2:789464/1‑140 (MQ=255)
gTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCa < 1:449655/140‑1 (MQ=255)
tttATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCTGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAAccg < 2:1355215/140‑1 (MQ=255)
tttATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAAccg < 1:429046/140‑1 (MQ=255)
tttATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACAAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAAccg < 1:523622/140‑1 (MQ=255)
cgcgTTACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAAccgcagcc > 1:638519/1‑140 (MQ=255)
ttACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAAccgcagccgcag > 2:56249/1‑140 (MQ=255)
tACCGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAACCGCAGCCGCAgg > 2:430171/1‑140 (MQ=255)
ccGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTTGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAACCGCAGCCGCAGGAt > 2:64167/1‑140 (MQ=255)
cGATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAACCGCAGCCGCAGGATg < 1:635532/140‑1 (MQ=255)
gATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAACCGCAGCCGCAGGATGc > 1:1499470/1‑140 (MQ=255)
gATTGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAACCGCAGCCGCAGGATGc > 1:1299374/1‑140 (MQ=255)
ttGGGCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAACCGCAGCCGCAGGATGCCa < 1:1041757/140‑1 (MQ=255)
gggCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAACCGCAGCCGCAGGATGCCAtt > 2:176566/1‑140 (MQ=255)
ggCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAACCGCAGCCGCAGGATGCCAttt > 1:864400/1‑140 (MQ=255)
gCCGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAACCGCAGCCGCAGGATGCCAtttt > 2:1115523/1‑140 (MQ=255)
ccGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAACCGCAGCCGCAGGATGCCATTTTg < 1:1512203/140‑1 (MQ=255)
ccGACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAACCGCAGCCGCAGGATGCCATTTTg < 2:638519/140‑1 (MQ=255)
gACGCTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAACCGCAGCCGCAGGATGCCATTTTgca < 1:1160201/140‑1 (MQ=255)
|
AGACGCCCTGGCAACCGCTGCGCCTGAAACTGGAGTATGAAGGCAATAATTATCAGCAGGATTTTGCCGGGAAGCTGGAGCAAAAAAGTAAGTTTAACGTCGGTGCGATTTATCGCGTTACCGATTGGGCCGACGTTAACCTTAGCTATGAACGTGGCAACACCTTTATGTTTGGCGTTACGTTGCGCACCAACTTTAACGATCTGCGCCCGTCTTACAACGATAACGCCCGCCCGCAATATCAACCGCAGCCGCAGGATGCCATTTTGCA > NC_000913/4238262‑4238532
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
