Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F28 I1 R1
|
120 |
93.5 |
3664254 |
88.3% |
3235536 |
136.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,863,367 |
C→T |
G199G (GGC→GGT) |
gapA → |
glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase A |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,863,367 | 0 | C | T | 100.0%
| 262.9
/ NA
| 79 | G199G (GGC→GGT) | gapA | glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (32/47); total (32/47) |
GGCTCCGCTGGCTAAAGTTATCAACGATAACTTCGGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGCGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGTATGGCGTTCCGCGTTCCGACCCCGAACGTATCTGTAGT > NC_000913/1863235‑1863492
|
ggCTCCGCTGGCTAAAGTTATCAACGATAACTTCGGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTc < 2:660731/138‑1 (MQ=255)
gCTCCGCTGGCTAAAGTTATCAACGATAACTTCGGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTcc < 2:419566/138‑1 (MQ=255)
cTCCGCTGGCTAAAGTTATCAACGATAACTTCGGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTccc > 1:763177/1‑138 (MQ=255)
tCCGCTGGCTAAAGTTATCAACGATAACTTCGGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTc > 1:429523/1‑135 (MQ=255)
tCCGCTGGCTAAAGTTATCAACGATAACTTCGGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTc < 2:429523/135‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCTAAAGTTATCAACGATAACTTCGGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAg > 1:143076/1‑138 (MQ=255)
gCTGGCTAAAGTTATCAACGATAACTTCGGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGaa > 1:1248419/1‑138 (MQ=255)
cTAAAGTTATCAACGATAACTTCGGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAAcatca < 2:267032/138‑1 (MQ=255)
cTAAAGTTATCAACGATAACTTCGGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAAcatca < 2:1706020/138‑1 (MQ=255)
cTAAAGTTATCAACGATAACTTCGGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAAcatca < 2:143076/138‑1 (MQ=255)
tAAAGTTATCAACGATAACTTCGGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAAcatcat < 1:1273966/138‑1 (MQ=255)
aaGTTATCAACGATAACTTCGGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATcc < 2:209055/138‑1 (MQ=255)
aGTTATCAACGATAACTTCGGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATccc < 1:1245496/138‑1 (MQ=255)
gTTATCAACGATAACTTCGGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCg < 1:1366446/138‑1 (MQ=255)
aaCGATAACTTCGGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCctct < 2:1074768/138‑1 (MQ=255)
aaCGATAACTTCGGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCctct < 1:960426/138‑1 (MQ=255)
aTAACTTCGGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCg < 2:1570251/138‑1 (MQ=255)
aCTTCTGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGtg > 2:434110/1‑138 (MQ=255)
aCTTCGGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGtg > 2:713771/1‑138 (MQ=255)
atcatcGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCGTCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTaaa < 2:376533/138‑1 (MQ=255)
tcatcGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAg < 1:1698910/138‑1 (MQ=255)
tcatcGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAg < 1:970926/138‑1 (MQ=255)
tcatcGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAg < 2:745692/138‑1 (MQ=255)
tcGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTaaa > 2:749697/1‑134 (MQ=255)
tcGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTaaa < 1:749697/134‑1 (MQ=255)
gAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTa > 2:3774/1‑138 (MQ=255)
aaGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAg < 1:143977/138‑1 (MQ=255)
cTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTaaa < 2:763177/138‑1 (MQ=255)
tgatgaCCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAg > 2:318694/1‑138 (MQ=255)
atgaCCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTa > 2:308829/1‑138 (MQ=255)
tgaCCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTAc > 2:358174/1‑138 (MQ=255)
gaCCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACt > 1:39104/1‑138 (MQ=255)
gaCCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACt > 2:1373680/1‑138 (MQ=255)
caccGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGcc > 1:1588706/1‑138 (MQ=255)
ccGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAg > 2:1741747/1‑138 (MQ=255)
cGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGa > 2:180654/1‑138 (MQ=255)
cGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTACTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGa > 1:922170/1‑138 (MQ=255)
tCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACt < 2:1787313/138‑1 (MQ=255)
cACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCAAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTg > 2:930328/1‑138 (MQ=255)
gCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAAt > 2:685333/1‑138 (MQ=255)
ctactaCCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATg < 2:118239/138‑1 (MQ=255)
tactacCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATgg < 2:1529973/138‑1 (MQ=255)
actacCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGc < 1:743780/138‑1 (MQ=255)
ctacCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCa < 1:685333/138‑1 (MQ=255)
ctacCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCa < 2:108448/138‑1 (MQ=255)
acCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCaaa < 1:1232852/138‑1 (MQ=255)
acCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCaaa < 1:507111/138‑1 (MQ=255)
acCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCaaa < 1:826506/138‑1 (MQ=255)
acCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCaaa < 2:39104/138‑1 (MQ=255)
ccGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCTTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAac < 2:1147480/138‑1 (MQ=255)
ccGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGaa < 2:1174483/130‑1 (MQ=255)
ccGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGaa > 1:1174483/1‑130 (MQ=255)
gCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATTGCAAactg < 2:1461184/138‑1 (MQ=255)
gCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAactg < 1:308829/138‑1 (MQ=255)
gCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAactg < 2:1588706/138‑1 (MQ=255)
aCTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAactgact > 1:228991/1‑138 (MQ=255)
tCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTgg > 1:884668/1‑138 (MQ=255)
tCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTgg > 2:1779921/1‑138 (MQ=255)
ccGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGTATGgcgt < 1:1779921/138‑1 (MQ=255)
ttGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCaaa < 2:105052/119‑1 (MQ=255)
ttGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCaaa > 1:105052/1‑119 (MQ=255)
gATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGt > 2:265568/1‑126 (MQ=255)
gATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGt < 1:265568/126‑1 (MQ=255)
cccGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGAAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGTATGgcgttccgcgttcc > 2:1137849/1‑138 (MQ=255)
cGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGTATGGCGTTCCGCGTTCCGa < 1:713771/138‑1 (MQ=255)
cGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGTATGGCGTTCCGCGTTCCGa > 1:807284/1‑138 (MQ=255)
cGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGTATGGCGTTCCGCGTTCCGa < 1:1461649/138‑1 (MQ=255)
gTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGTATGGCGTTCCGCGTTCCGAc < 2:606997/138‑1 (MQ=255)
tctcACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTACTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGTATGGCGTTCCGCGTTCCGAcc < 2:922170/138‑1 (MQ=255)
ctcACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGTATGGCGTTCCGCGTTCCGAccc < 1:1429661/138‑1 (MQ=255)
acaAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGAAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGTATGGCGTTCCGCGTTCCGACCCCGa < 1:1137849/138‑1 (MQ=255)
aaGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGTATGgcgttccgcgtt < 1:1547632/125‑1 (MQ=255)
aaGACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGTATGgcgttccgcgtt > 2:1547632/1‑125 (MQ=255)
gACTGGCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGTATGGCGTTCCGCGTTCCGACCCCGAACGTa < 2:807284/138‑1 (MQ=255)
ggCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGTATGgcgttccgcgtt > 2:89586/1‑119 (MQ=255)
ggCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGTATGgcgttccgcgtt < 1:89586/119‑1 (MQ=255)
ggCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGTATGGCGTTCCGCGTTCCGACCCCGAAc > 2:1127237/1‑131 (MQ=255)
ggCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGTATGGCGTTCCGCGTTCCGACCCCGAAc < 1:1127237/131‑1 (MQ=255)
ggCGCGGCGGCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGTATGGCGTTCCGCGTTCCGACCCCGAACGTATCTg > 1:1473060/1‑138 (MQ=255)
cggcggCCGCGGTGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGTATGGCGTTCCGCGTTCCGACCCCGAACGTATCTGTAGt > 1:1823489/1‑138 (MQ=255)
|
GGCTCCGCTGGCTAAAGTTATCAACGATAACTTCGGCATCATCGAAGGTCTGATGACCACCGTTCACGCTACTACCGCTACTCAGAAAACCGTTGATGGCCCGTCTCACAAAGACTGGCGCGGCGGCCGCGGCGCTTCCCAGAACATCATCCCGTCCTCTACCGGTGCTGCTAAAGCTGTAGGTAAAGTACTGCCAGAACTGAATGGCAAACTGACTGGTATGGCGTTCCGCGTTCCGACCCCGAACGTATCTGTAGT > NC_000913/1863235‑1863492
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
