Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F28 I1 R1
|
120 |
93.5 |
3664254 |
88.3% |
3235536 |
136.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,994,202 |
(A)7→6 |
pseudogene (264/503 nt) |
pbl → |
transglycosylase domain‑containing protein Pbl |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,994,196 | 0 | A | . | 100.0%
| 530.9
/ NA
| 120 | pseudogene (258/503 nt) | pbl | transglycosylase domain‑containing protein Pbl |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base . (74/46); total (74/46) |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
AATTTAATTAAAGCTATCGCTCTTGTTGAAAGCAATCTAAAAAAGGATAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTTAAAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTGGCAATGCCTGGGGACTTATA > NC_000913/2994059‑2994329
|
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aaaGCTATCGCTCTTGTTGAAAGCAATCTAAAAAAGGATAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTTaaaaaacgtg < 1:1301872/138‑5 (MQ=255)
aGCTATCGCTCTTGTTGAAAGCAATCTAAAAAAGGATAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGa < 2:301675/138‑1 (MQ=255)
gCTCTTGTTGAAAGCAATCTAAAAAAGGATAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAAtaataa > 1:1806100/1‑138 (MQ=255)
ctctTGTTGAAAGCAATCTAAAAAAGGATAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATaaa < 1:338246/138‑1 (MQ=255)
ctctTGTTGAAAGCAATCTAAAAAAGGATAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATaaa < 2:1074014/138‑1 (MQ=255)
ttgAAAGCAATCTAAAAAAGGATAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGa > 2:540775/1‑138 (MQ=255)
ttgAAAGCAATCTAAAAAAGGATAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGa > 1:1096372/1‑138 (MQ=255)
aaaGCAATCTAAAAAAGGATAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACg < 2:829816/138‑1 (MQ=255)
cAATCTAAAAAAGGATAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGAt > 2:1223755/1‑138 (MQ=255)
cAATCTAAAAAAGGATAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGAt > 1:1307367/1‑138 (MQ=255)
aaTCTAAAAAAGGATAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGAtt < 1:1830409/138‑1 (MQ=255)
aTCTAAAAAAGGATAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGAttt < 1:1623903/138‑1 (MQ=255)
aaaaaaGGATAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTa < 2:459359/138‑1 (MQ=255)
aaaaaaGGATAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTa < 1:1342955/138‑1 (MQ=255)
aaaaaaGGATAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTa < 1:298694/138‑1 (MQ=255)
gATAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAAcc > 2:1091170/1‑138 (MQ=255)
tAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGTTGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTa < 1:1642075/129‑1 (MQ=255)
tAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGTTGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTa > 2:1642075/1‑129 (MQ=255)
tAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCt > 2:600788/1‑138 (MQ=255)
gCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTg > 1:683594/1‑138 (MQ=255)
gCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTg > 1:1317503/1‑138 (MQ=255)
aTAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTc < 2:956257/138‑1 (MQ=255)
aTAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTc < 1:1479756/138‑1 (MQ=255)
aTAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTATAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTc < 1:1194149/138‑1 (MQ=255)
cAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAAc > 1:963967/1‑138 (MQ=255)
aCAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTaa > 1:1067197/1‑138 (MQ=255)
cAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTaaa > 1:1234827/1‑138 (MQ=255)
gaTAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAg > 1:350971/1‑138 (MQ=255)
aTAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAgg > 1:1697886/1‑138 (MQ=255)
aTAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAgg > 2:26656/1‑138 (MQ=255)
aaGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGaa < 2:1206715/138‑1 (MQ=255)
aaGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGaa < 2:1234827/138‑1 (MQ=255)
aaTAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCg > 2:1615573/1‑138 (MQ=255)
aaTAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCg > 2:457889/1‑138 (MQ=255)
aTAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCga < 1:540775/138‑1 (MQ=255)
aCAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGAt < 2:1307367/138‑1 (MQ=255)
cAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGAtt > 1:506408/1‑138 (MQ=255)
aaTATAAAGAATTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGAttt < 1:177009/138‑1 (MQ=255)
atatAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGAtttt > 1:1466724/1‑138 (MQ=255)
atatAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGAtttt > 2:332683/1‑138 (MQ=255)
atatAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGAtttt > 2:1309521/1‑138 (MQ=255)
ataAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTtat > 1:819409/1‑138 (MQ=255)
taAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTtata > 1:1358905/1‑138 (MQ=255)
taAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTtata > 1:504932/1‑138 (MQ=255)
taAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTtata < 2:157464/138‑1 (MQ=255)
aaGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAGTAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTtatata > 2:1448640/1‑138 (MQ=255)
aaGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTtatata > 2:129964/1‑138 (MQ=255)
aaGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTtatata > 1:1210579/1‑138 (MQ=255)
aaGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTCtatata > 2:1828467/1‑138 (MQ=255)
gTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCa > 1:1642312/1‑138 (MQ=255)
tttAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCAt > 1:973742/1‑138 (MQ=255)
tttAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCAt > 1:741447/1‑138 (MQ=255)
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aGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCAtttt > 2:192790/1‑138 (MQ=255)
aGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCAtttt > 1:136388/1‑138 (MQ=255)
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aGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCAtttt > 1:1516357/1‑138 (MQ=255)
aGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCAtttt > 2:1739731/1‑138 (MQ=255)
aGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCAtttt < 2:1642312/138‑1 (MQ=255)
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gATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCAttttt > 2:612513/1‑138 (MQ=255)
ttattGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCa < 1:332683/138‑1 (MQ=255)
tattGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCAc > 2:523306/1‑138 (MQ=255)
attGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACg < 2:498513/138‑1 (MQ=255)
gTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTtgt > 2:501452/1‑138 (MQ=255)
gTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTtgt > 2:1693983/1‑138 (MQ=255)
tAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTgg < 2:136388/138‑1 (MQ=255)
tAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTgg > 2:19794/1‑138 (MQ=255)
aTGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCAttttt < 1:1258947/126‑1 (MQ=255)
aaaCCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTgg > 1:1132255/1‑138 (MQ=255)
aaaCCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTgg > 2:562481/1‑138 (MQ=255)
aaaCCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTgg > 2:654751/1‑138 (MQ=255)
aaaCCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTgg > 2:1115917/1‑138 (MQ=255)
aaaCCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTgg > 1:1329350/1‑138 (MQ=255)
aaaCCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTgg > 1:398063/1‑138 (MQ=255)
aaaCCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTgg < 2:1173189/138‑1 (MQ=255)
aaCCAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTGGc < 1:1091170/138‑1 (MQ=255)
cAGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTGGCAAt < 1:612513/138‑1 (MQ=255)
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aGATGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTGGCAATg < 1:1115917/138‑1 (MQ=255)
aTGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTGGCAATGcc < 1:1693983/138‑1 (MQ=255)
aTGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTGGCAATGcc < 2:683594/138‑1 (MQ=255)
aTGCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTGGCAATGcc < 2:1317503/138‑1 (MQ=255)
gCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTGGCAATGCCTg < 2:587742/138‑1 (MQ=255)
gCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTGGCAATGCCTg > 1:1639319/1‑138 (MQ=255)
gCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTGGCAATGCCTg < 2:1329350/138‑1 (MQ=255)
gCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTGGCAATGCCTg > 1:414611/1‑138 (MQ=255)
gCATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTGGCAATGCCTg < 1:1615573/138‑1 (MQ=255)
cATATTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTGGCAATGCCTgg > 2:681078/1‑138 (MQ=255)
tatTCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGAGGAGTAACGTGGCAATGCCTgggg < 1:1828467/138‑1 (MQ=255)
ttCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTg < 1:794037/123‑1 (MQ=255)
ttCCCCTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTg > 2:794037/1‑123 (MQ=255)
cTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTGGCAATGCCTGGGGACTtata > 2:1748990/1‑138 (MQ=255)
cTGTT‑AAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTGGCAATGCCTGGGGACTtata > 1:1421886/1‑138 (MQ=255)
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AATTTAATTAAAGCTATCGCTCTTGTTGAAAGCAATCTAAAAAAGGATAGCATAGGCAAGAACAGAGATAAGAATAACAATATAAAGAGTTTAGATTATTGGTTAATGCAGATAAACCAGATGCATATTCCCCTGTTAAAAAAACGTGGAATAATAAAAGATGAACGAGATTTGTTAGATAACCCTTGTCTGAACATTAAAATAGGAACCGAGATTTTATATAACCATTTTTCACGTTGTGGAGTAACGTGGCAATGCCTGGGGACTTATA > NC_000913/2994059‑2994329
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
