Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F28 I1 R1
|
191 |
83.5 |
2830284 |
99.3% |
2810472 |
139.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,677,935 |
G→A |
intergenic (‑32/‑492) |
pntA ← / → ydgH |
pyridine nucleotide transhydrogenase subunit alpha/DUF1471 domain‑containing protein YdgH |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,677,935 | 0 | G | A | 100.0%
| 254.7
/ NA
| 71 | intergenic (‑32/‑492) | pntA/ydgH | pyridine nucleotide transhydrogenase subunit alpha/DUF1471 domain‑containing protein YdgH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (35/36); total (35/36) |
GCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGT > NC_000913/1677803‑1678065
|
gcgACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGcc < 2:1053714/140‑1 (MQ=255)
cgACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCt > 1:607174/1‑140 (MQ=255)
cgACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCt > 1:303125/1‑140 (MQ=255)
cgACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCt > 2:804577/1‑140 (MQ=255)
cgACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCt > 2:717603/1‑140 (MQ=255)
gACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCt < 2:1026680/139‑1 (MQ=255)
gACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCt > 1:1026680/1‑139 (MQ=255)
cGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCtgtg > 2:697143/1‑140 (MQ=255)
cGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCtgtg > 2:508348/1‑140 (MQ=255)
cGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCtgtg > 2:478563/1‑140 (MQ=255)
cGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCtgtg > 2:43535/1‑140 (MQ=255)
gTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGc < 2:133871/133‑1 (MQ=255)
gTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGc > 1:133871/1‑133 (MQ=255)
cccAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGc < 1:1023745/140‑1 (MQ=255)
gTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCcaca < 2:1368574/140‑1 (MQ=255)
tttCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCcacac > 1:69088/1‑140 (MQ=255)
cagcagCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAg < 1:1255031/140‑1 (MQ=255)
cagcagCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAg < 2:1362293/140‑1 (MQ=255)
cagcagCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAg < 2:145130/140‑1 (MQ=255)
cagcagCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAg < 1:281019/140‑1 (MQ=255)
cagcagCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAg < 1:717603/140‑1 (MQ=255)
cagcagCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGCATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAg < 2:1228572/140‑1 (MQ=255)
gcagcTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAgct < 1:478563/140‑1 (MQ=255)
cTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTc > 1:1288048/1‑140 (MQ=255)
gTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCAt > 1:100683/1‑140 (MQ=255)
tGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAg < 2:1288048/140‑1 (MQ=255)
tttttGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCt < 1:499470/140‑1 (MQ=255)
tttttGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCt < 2:69088/140‑1 (MQ=255)
tttGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTaa > 2:339101/1‑140 (MQ=255)
ggCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCt < 2:980757/135‑1 (MQ=255)
ggCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCt > 1:980757/1‑135 (MQ=255)
gTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTa < 1:339101/140‑1 (MQ=255)
tgctgcAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATCTTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTAcc > 2:916246/1‑139 (MQ=255)
aTTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGt > 2:871320/1‑140 (MQ=255)
ggTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAAc < 1:697143/140‑1 (MQ=255)
ggTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAAc < 1:43535/140‑1 (MQ=255)
ttAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACaa < 1:616638/140‑1 (MQ=255)
ttAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACaa > 1:177775/1‑140 (MQ=255)
tAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACaaa < 1:871320/140‑1 (MQ=255)
tAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACaaa < 1:863861/140‑1 (MQ=255)
tAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACaaa < 1:1374860/140‑1 (MQ=255)
tAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACaaa < 2:249321/140‑1 (MQ=255)
aCCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACg < 2:1103375/140‑1 (MQ=255)
aCCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACg < 2:303125/140‑1 (MQ=255)
aCCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACg < 1:374958/140‑1 (MQ=255)
ctctTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACg < 1:941483/134‑1 (MQ=255)
ctctTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACg > 2:941483/1‑134 (MQ=255)
ctctTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCtat > 2:1384857/1‑140 (MQ=255)
ttGGTATGCCAATTCGCATGATATACCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAAc > 2:944997/1‑140 (MQ=255)
tGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACaaa < 2:139810/128‑1 (MQ=255)
tGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACaaa > 1:139810/1‑128 (MQ=255)
tGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACaaa > 1:338889/1‑128 (MQ=255)
tGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACaaa < 2:338889/128‑1 (MQ=255)
aTGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACt < 2:607174/140‑1 (MQ=255)
aTGCCAATTCGCATGATATACCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACt < 1:944997/140‑1 (MQ=255)
tGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTg > 1:1055867/1‑140 (MQ=255)
tGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTg < 2:177775/140‑1 (MQ=255)
gCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGa > 2:277551/1‑140 (MQ=255)
gCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGa > 1:1371199/1‑140 (MQ=255)
ccAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGaa > 2:382816/1‑140 (MQ=255)
ttCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAAtt > 1:1304452/1‑140 (MQ=255)
cGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTAt < 1:508348/140‑1 (MQ=255)
cGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTAt > 1:768488/1‑140 (MQ=255)
gATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTATGCCtg < 2:1371199/140‑1 (MQ=255)
tCCATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAgcg > 1:342777/1‑140 (MQ=255)
cATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGcc > 2:704441/1‑140 (MQ=255)
cATCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGcc > 1:1005596/1‑140 (MQ=255)
tCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCaa > 2:1205942/1‑140 (MQ=255)
tCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCaa < 2:1005596/140‑1 (MQ=255)
tCGGTTTTATTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCaa > 2:1362223/1‑140 (MQ=255)
aTTGATGATAGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGt > 1:570515/1‑140 (MQ=255)
|
GCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGT > NC_000913/1677803‑1678065
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
