Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F28 I1 R1
|
191 |
83.5 |
2830284 |
99.3% |
2810472 |
139.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,015,247 |
A→G |
T30A (ACA→GCA) |
mocA → |
molybdenum cofactor cytidylyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,015,247 | 0 | A | G | 100.0%
| 380.3
/ NA
| 103 | T30A (ACA→GCA) | mocA | molybdenum cofactor cytidylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (54/49); total (54/49) |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
AACGCAATTATCAGGCGTTATTAGCCCCTATAAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAACAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAACCAGAGCAATATCACTATTATTCACAACCCAGATT > NC_000913/3015113‑3015382
|
aaCGCAATTATCAGGCGTTATTAGCCCCTATAAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAAtt < 2:1388434/140‑1 (MQ=255)
aaCGCAATTATCAGGCGTTATTAGCCCCTATAAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAAtt < 1:199574/140‑1 (MQ=255)
aaCGCAATTATCAGGCGTTATTAGCCCCTATAAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAAtt < 1:504794/140‑1 (MQ=255)
aaCGCAATTATCAGGCGTTATTAGCCCCTATAAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAAtt < 1:976378/140‑1 (MQ=255)
aCGCAATTATCAGGCGTTATTAGCCCCTATAAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTc > 1:290844/1‑140 (MQ=255)
ttATCAGGCGTTATTAGCCCCTATAAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATa < 1:864316/140‑1 (MQ=255)
ttATCAGGCGTTATTAGCCCCTATAAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATa > 2:415804/1‑140 (MQ=255)
aTCAGGCGTTATTAGCCCCTATAAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACa > 2:643509/1‑140 (MQ=255)
aTCAGGCGTTATTAGCCCCTATAAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACa < 2:504491/140‑1 (MQ=255)
attaGCCCCTATAAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACa < 1:1082315/130‑1 (MQ=255)
attaGCCCCTATAAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACa > 2:1082315/1‑130 (MQ=255)
attaGCCCCTATAAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAg < 1:9465/132‑1 (MQ=255)
attaGCCCCTATAAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAg > 2:9465/1‑132 (MQ=255)
gCCCCTATAAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACA‑GGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCg < 1:1288469/140‑1 (MQ=255)
cccTATAAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCATTGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGt < 2:429980/140‑1 (MQ=255)
tataAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGc > 2:1225983/1‑140 (MQ=255)
tataAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGc < 1:1000233/140‑1 (MQ=255)
tataAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGc > 1:1369116/1‑140 (MQ=255)
tataAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGc > 2:831184/1‑140 (MQ=255)
taaataaTGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAg > 2:1087139/1‑140 (MQ=255)
taaataaTGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAg > 2:1256670/1‑140 (MQ=255)
tGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTa > 2:1023333/1‑140 (MQ=255)
tGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTa > 1:992779/1‑140 (MQ=255)
tGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTa > 1:1212383/1‑140 (MQ=255)
ggAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAg > 1:673301/1‑140 (MQ=255)
aaCCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGcc > 2:54171/1‑140 (MQ=255)
aaCCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGcc > 2:162625/1‑140 (MQ=255)
aCCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCg < 1:1256670/140‑1 (MQ=255)
aCCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCg > 2:1210219/1‑140 (MQ=255)
cACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGaa < 2:438275/140‑1 (MQ=255)
aCTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAat > 2:52101/1‑140 (MQ=255)
tGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAattatt > 2:1125177/1‑140 (MQ=255)
tCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTAtttt < 1:643509/140‑1 (MQ=255)
gCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGt > 2:316790/1‑140 (MQ=255)
gCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGt > 2:116228/1‑140 (MQ=255)
gCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGCTGCAGTTTTGTAGCCGACTTATTTTAGt > 2:606098/1‑140 (MQ=255)
ccATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTc < 1:116228/140‑1 (MQ=255)
aTCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCAc > 1:286714/1‑140 (MQ=255)
aTCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCAc > 2:634139/1‑140 (MQ=255)
cGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCg > 2:888819/1‑140 (MQ=255)
tgataATTTCCGCTTCCCGGATAAT‑ATCCAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTAt < 1:105581/138‑1 (MQ=255)
gTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTAt < 2:1369116/140‑1 (MQ=255)
gTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTAt < 2:290844/140‑1 (MQ=255)
gTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTAt < 1:854650/140‑1 (MQ=255)
gTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTAt < 1:831184/140‑1 (MQ=255)
tataATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATc > 1:650313/1‑140 (MQ=255)
ataATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCg < 2:22918/140‑1 (MQ=255)
ataATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCg < 1:294689/140‑1 (MQ=255)
aCCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTaa > 1:1144379/1‑140 (MQ=255)
gC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGGAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGa > 2:1063863/1‑140 (MQ=255)
gC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCgg > 2:1064908/1‑125 (MQ=255)
gC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCgg < 1:1064908/125‑1 (MQ=255)
gC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGa > 2:125235/1‑140 (MQ=255)
gC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGa > 2:342828/1‑140 (MQ=255)
gC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGa > 2:573990/1‑140 (MQ=255)
gC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGa > 2:1190516/1‑140 (MQ=255)
c‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGaa > 2:87575/1‑140 (MQ=255)
ttATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGa < 2:2549/140‑1 (MQ=255)
atcaAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGtt > 1:613269/1‑140 (MQ=255)
aaGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATg < 1:486131/140‑1 (MQ=255)
aaGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATg < 1:573990/140‑1 (MQ=255)
gAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCg < 2:1212383/140‑1 (MQ=255)
aaTGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGa > 1:1301018/1‑140 (MQ=255)
tGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAAc > 2:844249/1‑140 (MQ=255)
tGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAAc > 1:1377318/1‑140 (MQ=255)
tGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAAc > 2:1034637/1‑140 (MQ=255)
tGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAAc > 2:495338/1‑140 (MQ=255)
tGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAAc > 2:489756/1‑140 (MQ=255)
tGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAAc > 1:283766/1‑140 (MQ=255)
tGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAAc < 1:489756/140‑1 (MQ=255)
tGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAAc > 2:203732/1‑140 (MQ=255)
tGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAAc < 2:17423/140‑1 (MQ=255)
gggCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAACCa > 1:934082/1‑140 (MQ=255)
ggCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAACCag > 2:409363/1‑140 (MQ=255)
cAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAACCagag < 1:606098/140‑1 (MQ=255)
cAATCGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAACCagag < 2:1301018/140‑1 (MQ=255)
aaTGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAACCAGAGc < 2:193974/140‑1 (MQ=255)
aaTGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGATATGCGAACCAGAGc < 2:934082/140‑1 (MQ=255)
tGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAACCAGAGCaa < 2:14704/140‑1 (MQ=255)
tGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAACCAGAGCaa > 1:14704/1‑140 (MQ=255)
aaaaTGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAACCAGAGCAatat < 2:286714/140‑1 (MQ=255)
aaTGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAACCagag > 2:216792/1‑132 (MQ=255)
aaTGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAACCagag < 1:216792/132‑1 (MQ=255)
aaTGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAACCAGAGCAATATCa < 1:634139/140‑1 (MQ=255)
aaTGATGTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAACCAGAGCAATATCa < 1:1023333/140‑1 (MQ=255)
gatgTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAACCAGAGCAATATCACta < 1:1210219/140‑1 (MQ=255)
atgTTACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAACCAGAGCAATATCACtat < 1:409363/140‑1 (MQ=255)
tACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAGCCAGAGCAATATCACTattatt < 1:1225983/140‑1 (MQ=255)
tACCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAACCAGAGCAATATCACTattatt > 2:190383/1‑140 (MQ=255)
aCCCTGGGAACAGGGAGCAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAACCAGAGCAATATCACTATTATTc > 1:864202/1‑140 (MQ=255)
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|
AACGCAATTATCAGGCGTTATTAGCCCCTATAAATAATGGAACCACTATGTCAGCCATCGACTGTATAATTACCGC‑TGCCGGATTATCATCAAGAATGGGGCAATGGAAAATGATGTTACCCTGGGAACAGGGAACAATTCTTGATACAAGTATCAAAAATGCGTTGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGAACCAGAGCAATATCACTATTATTCACAACCCAGATT > NC_000913/3015113‑3015382
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
