Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F28 I1 R1
|
191 |
83.5 |
2830284 |
99.3% |
2810472 |
139.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,829,426 |
T→C |
V161A (GTT→GCT) |
xanP → |
xanthine:H(+) symporter XanP |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,829,426 | 0 | T | C | 100.0%
| 298.9
/ NA
| 81 | V161A (GTT→GCT) | xanP | xanthine:H(+) symporter XanP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (47/34); total (47/34) |
ACCGCGCTGAAAACCGGTGGTGCTGATGTTCCTACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTT > NC_000913/3829290‑3829561
|
aCCGCGCTGAAAACCGGTGGTGCTGATGTTCCTACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTc > 2:24404/1‑140 (MQ=255)
aCCGCGCTGAAAACCGGTGGTGCTGATGTTCCTACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTc < 1:926929/140‑1 (MQ=255)
cgcTGAAAACCGGTGGTGCTGATGTTCCTACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGc > 1:1411596/1‑140 (MQ=255)
cgcTGAAAACCGGTGGTGCTGATGTTCCTACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGc > 2:1191426/1‑140 (MQ=255)
gcTGAAAACCGGTGGTGCTGATGTTCCTACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCg < 1:968490/140‑1 (MQ=255)
tGAAAACCGGTGGTGCTGATGTTCCTACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGtt < 2:335126/140‑1 (MQ=255)
tGAAAACCGGTGGTGCTGATGTTCCTACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGtt < 2:1313593/140‑1 (MQ=255)
aaaCCGGTGGTGCTGATGTTCCTACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTtgtg < 1:972146/140‑1 (MQ=255)
ccGGTGGTGCTGATGTTCCTACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTgtggtg < 1:238889/140‑1 (MQ=255)
ggtggtGCTGATGTTCCTACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGtgat < 2:1358435/140‑1 (MQ=255)
tggtgCTGATGTTCCTACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGtgatga > 2:80867/1‑140 (MQ=255)
gtgCTGATGTTCCTACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGAtt > 1:840433/1‑140 (MQ=255)
cTGATGTTCCTACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATc > 1:526033/1‑140 (MQ=255)
tGTTCCTACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGcc < 1:1191426/140‑1 (MQ=255)
ccTACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTc > 1:1238921/1‑140 (MQ=255)
ccTACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTc > 2:1015016/1‑140 (MQ=255)
ccTACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTc > 2:39746/1‑140 (MQ=255)
cTACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCg < 2:273472/140‑1 (MQ=255)
tACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTTTCGc > 2:993463/1‑140 (MQ=255)
aCCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCt < 1:1015016/140‑1 (MQ=255)
cATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTaa > 2:1045857/1‑140 (MQ=255)
cATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTaa > 1:1327385/1‑140 (MQ=255)
atgatgGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAAt < 1:893013/140‑1 (MQ=255)
tgatgGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAAtt < 1:89890/140‑1 (MQ=255)
tgatgGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAAtt < 1:80867/140‑1 (MQ=255)
gatgGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTc > 1:213119/1‑140 (MQ=255)
gatgGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTc > 2:1397668/1‑140 (MQ=255)
atgGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCa > 1:1085461/1‑140 (MQ=255)
atgGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCa > 2:210273/1‑140 (MQ=255)
ggcggcTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAgg > 1:1350109/1‑140 (MQ=255)
ggcTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTg > 2:1337348/1‑140 (MQ=255)
tttGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGt > 2:1008801/1‑140 (MQ=255)
ttGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGtt < 1:653480/140‑1 (MQ=255)
tGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTggc > 1:1204186/1‑140 (MQ=255)
tGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTggc < 2:213119/140‑1 (MQ=255)
cTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGcggcgg > 2:1267302/1‑140 (MQ=255)
cTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGcggcgg < 2:1085461/140‑1 (MQ=255)
ggCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGtt > 2:913112/1‑140 (MQ=255)
gCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTa > 2:1058560/1‑140 (MQ=255)
gCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTa > 1:445858/1‑140 (MQ=255)
gTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCa < 1:1114278/140‑1 (MQ=255)
ccGAGGTGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATg > 1:1213366/1‑140 (MQ=255)
ccGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATg > 1:1187737/1‑140 (MQ=255)
ccGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATg < 1:506080/140‑1 (MQ=255)
agaTGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGc > 2:1163448/1‑140 (MQ=255)
agaTGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGc > 1:311902/1‑140 (MQ=255)
agaTGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGc > 1:525151/1‑140 (MQ=255)
ctcCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCt > 1:193792/1‑140 (MQ=255)
tcCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCtt > 2:319156/1‑140 (MQ=255)
cccGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTc > 1:355728/1‑140 (MQ=255)
cccGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTc > 2:663925/1‑140 (MQ=255)
ccGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCg > 1:147052/1‑140 (MQ=255)
ccGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCg > 1:409292/1‑140 (MQ=255)
ccGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCg > 1:346971/1‑140 (MQ=255)
gcgTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGgc > 1:1270852/1‑140 (MQ=255)
gcgTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAAAACCTTCGgc > 1:972103/1‑140 (MQ=255)
cgTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGgcg > 1:1106616/1‑140 (MQ=255)
gTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGgcgc < 2:840433/140‑1 (MQ=255)
cTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCAcc < 1:1045857/140‑1 (MQ=255)
tGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAAt < 1:33121/140‑1 (MQ=255)
ggCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATc > 2:468385/1‑140 (MQ=255)
gcgcgcCGCATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATct > 1:62765/1‑140 (MQ=255)
cgccgcATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATctgct < 1:1267302/140‑1 (MQ=255)
cgccgcATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATctgct < 2:1270852/140‑1 (MQ=255)
cATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTgg < 1:24404/140‑1 (MQ=255)
cATTATTACGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTgg < 1:1397668/140‑1 (MQ=255)
ttattaCGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCa < 2:1327385/140‑1 (MQ=255)
ttattaCGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCa < 1:1400513/140‑1 (MQ=255)
taCGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCg < 2:526033/140‑1 (MQ=255)
taCGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCg < 2:559559/140‑1 (MQ=255)
taCGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCg < 1:983123/140‑1 (MQ=255)
taCGCCGCTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCg < 2:972103/140‑1 (MQ=255)
cgccgcTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTg > 2:740897/1‑140 (MQ=255)
cgccgcTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTg > 1:237684/1‑140 (MQ=255)
ccgcTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTggg > 2:435757/1‑139 (MQ=255)
ccgcTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGt > 1:418549/1‑140 (MQ=255)
ccgcTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGt > 1:332480/1‑140 (MQ=255)
cgcTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTc < 2:237684/140‑1 (MQ=255)
gcTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCt < 1:1010737/140‑1 (MQ=255)
cTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCtt > 1:94730/1‑140 (MQ=255)
cTGGCTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCtt < 1:39746/140‑1 (MQ=255)
|
ACCGCGCTGAAAACCGGTGGTGCTGATGTTCCTACCATGATGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTT > NC_000913/3829290‑3829561
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
