Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F28 I1 R1
|
191 |
83.5 |
2830284 |
99.3% |
2810472 |
139.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,453,453 |
A→G |
M295V (ATG→GTG) |
ytfT → |
galactofuranose ABC transporter putative membrane subunit YtfT |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,453,453 | 0 | A | G | 100.0%
| 320.9
/ NA
| 88 | M295V (ATG→GTG) | ytfT | galactofuranose ABC transporter putative membrane subunit YtfT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (42/46); total (42/46) |
GGTGCCGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAG > NC_000913/4453318‑4453580
|
ggTGCCGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGaa < 2:1106883/140‑1 (MQ=255)
gTGCCGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAac > 2:306940/1‑140 (MQ=255)
gTGCCGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAac > 2:1223278/1‑140 (MQ=255)
tGCCGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAaca > 1:963868/1‑140 (MQ=255)
tGCCGATGCCAACAACGCTGGGTTAGGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGGGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCCGGTTATTCAGGGGGTGAaca > 2:837008/1‑140 (MQ=255)
ccGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACAcc > 2:1144431/1‑140 (MQ=255)
ccGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACAcc > 2:1260207/1‑140 (MQ=255)
aTGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGa > 2:472066/1‑140 (MQ=255)
aTGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGa > 2:100254/1‑140 (MQ=255)
acaacGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTg > 1:1090154/1‑140 (MQ=255)
cGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGTTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCttt > 2:1249690/1‑140 (MQ=255)
gggTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCggg < 2:1274031/140‑1 (MQ=255)
gTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCt < 1:1144431/140‑1 (MQ=255)
tGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTcc > 1:93684/1‑140 (MQ=255)
gctggagctggaCGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGc < 2:294022/140‑1 (MQ=255)
ggagctggaCGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCag > 1:678423/1‑140 (MQ=255)
ggagctggaCGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCag > 1:576834/1‑140 (MQ=255)
ggagctggaCGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCag > 2:1250370/1‑140 (MQ=255)
ggagctggaCGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCag > 2:157286/1‑140 (MQ=255)
gagctggaCGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCaga > 1:142656/1‑140 (MQ=255)
agctggaCGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGTACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCagag > 1:154239/1‑140 (MQ=255)
agctggaCGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGTACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCagag < 2:154239/140‑1 (MQ=255)
agctggaCGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCagag > 1:682280/1‑140 (MQ=255)
agctggaCGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCagag > 2:991060/1‑140 (MQ=255)
gaCGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGaa > 1:68265/1‑140 (MQ=255)
ccATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCATAGATGAACCAg < 2:1210853/140‑1 (MQ=255)
cATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAgg > 2:103998/1‑140 (MQ=255)
cATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAgg > 1:253466/1‑140 (MQ=255)
aTTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAggt < 1:1241185/140‑1 (MQ=255)
ttCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAggtg > 2:486976/1‑140 (MQ=255)
gcgGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGaa < 2:1116905/140‑1 (MQ=255)
cgGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGaaa > 1:408575/1‑140 (MQ=255)
gtggtgATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGc < 1:773397/140‑1 (MQ=255)
ggtgATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCgg < 1:486976/140‑1 (MQ=255)
ggtgATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCgg < 1:1223278/140‑1 (MQ=255)
ggtgATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCgg < 2:678423/140‑1 (MQ=255)
gtgATTGGCGGCGGGTCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCggt > 2:487536/1‑140 (MQ=255)
aTTGGCGGCGGGTCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCggtggt < 1:487536/140‑1 (MQ=255)
cggcggATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGc > 1:499207/1‑140 (MQ=255)
cggcggATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGc > 2:424605/1‑140 (MQ=255)
gcggATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCtt > 1:579492/1‑140 (MQ=255)
tCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGt < 1:829916/140‑1 (MQ=255)
tCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGt < 1:472066/140‑1 (MQ=255)
cTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTGCTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCt < 1:249565/140‑1 (MQ=255)
gggcgggcGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTg > 1:397878/1‑140 (MQ=255)
gggcgggcGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTg < 2:68265/140‑1 (MQ=255)
ggcgggcgCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGt > 1:405868/1‑140 (MQ=255)
cgggcgCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTc > 2:1142380/1‑140 (MQ=255)
cgggcgCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTc > 2:980380/1‑140 (MQ=255)
gggcgCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCa < 2:1227070/140‑1 (MQ=255)
cTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGc < 2:576834/140‑1 (MQ=255)
cTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGc < 1:1397000/140‑1 (MQ=255)
cTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGc < 1:1249690/140‑1 (MQ=255)
ttAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCaa < 2:156266/140‑1 (MQ=255)
tAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAAc > 1:751158/1‑140 (MQ=255)
aaCCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACg < 2:1090154/140‑1 (MQ=255)
aaCCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACg < 2:425318/140‑1 (MQ=255)
aaCCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACg < 2:751158/140‑1 (MQ=255)
aaCCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACg < 2:424423/140‑1 (MQ=255)
tGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGc > 1:526719/1‑132 (MQ=255)
tGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGc < 2:526719/132‑1 (MQ=255)
gCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTc > 1:8314/1‑125 (MQ=255)
gCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTc < 2:8314/125‑1 (MQ=255)
gCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTa > 2:144227/1‑140 (MQ=255)
gCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTa < 2:476785/140‑1 (MQ=255)
cTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTAt < 2:682280/140‑1 (MQ=255)
cTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGCGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTAt > 2:1157100/1‑140 (MQ=255)
tACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATc < 1:157286/140‑1 (MQ=255)
cTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAg > 1:120973/1‑140 (MQ=255)
tttCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGt < 2:963868/140‑1 (MQ=255)
tttCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGt < 1:1250370/140‑1 (MQ=255)
tttCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGt < 1:980380/140‑1 (MQ=255)
tttCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGt < 2:580199/140‑1 (MQ=255)
ttCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTAt < 1:606903/135‑1 (MQ=255)
ttCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTAt > 2:606903/1‑135 (MQ=255)
tCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCACCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCt > 2:579849/1‑140 (MQ=255)
ggtggtGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGa > 2:1399461/1‑140 (MQ=255)
ggtggtGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGAGAACTCCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGGGAAAGCGGTGGTTGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTTTgg > 2:972532/1‑139 (MQ=255)
gtggtgGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGAt < 2:579492/140‑1 (MQ=255)
gtggtgGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGAt < 1:972532/140‑1 (MQ=255)
gtggtgGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGAt < 1:317758/140‑1 (MQ=255)
gtggtgGGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGAt < 1:833683/140‑1 (MQ=255)
ggtggGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTa < 2:1110037/140‑1 (MQ=255)
gtggGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTaa < 1:1157100/140‑1 (MQ=255)
gtggGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTaa < 1:144227/140‑1 (MQ=255)
tggGGGCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTaaa > 1:1373428/1‑140 (MQ=255)
gggggCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAg < 2:120973/140‑1 (MQ=255)
gggggCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAg < 2:142656/140‑1 (MQ=255)
gggCGCTGATTATTCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAGCCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGa < 1:295028/140‑1 (MQ=255)
attattCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAg < 2:93684/140‑1 (MQ=255)
ttCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACg < 1:956971/133‑1 (MQ=255)
ttCAGGGGGTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACg > 2:956971/1‑133 (MQ=255)
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GGTGCCGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCTGGACGCCATTCTCGCGGTGGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAG > NC_000913/4453318‑4453580
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
