Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F28 I1 R1
|
161 |
75.5 |
2581324 |
99.3% |
2563254 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
25,321 |
A→G |
T39A (ACG→GCG) |
lspA → |
lipoprotein signal peptidase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 25,321 | 0 | A | G | 100.0%
| 375.2
/ NA
| 101 | T39A (ACG→GCG) | lspA | lipoprotein signal peptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (48/53); total (48/53) |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GTGAAAAACGTAAGTTTGCCTGATGAGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGC > NC_000913/25185‑25457
|
gtgaAAAACGTAAGTTTGCCTGATGAGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCgg < 1:747237/140‑1 (MQ=255)
gaAAAACGTAAGTTTGCCTGATGAGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTc < 1:887454/140‑1 (MQ=255)
aaaaaCGTAAGTTTGCCTGATGAGTCAATCGATTTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTcc < 2:1024804/140‑1 (MQ=255)
aaaaCGTAAGTTTGCCTGATGAGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTccc > 1:640370/1‑140 (MQ=255)
aaCGTAAGTTTGTCTGATGAGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGc < 2:298221/140‑1 (MQ=255)
tAAGTTTGCCTGATGAGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGtt > 1:897728/1‑140 (MQ=255)
aaGTTTGCCTGATGAGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCgg > 1:1217146/1‑129 (MQ=255)
aaGTTTGCCTGATGAGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCgg < 2:1217146/129‑1 (MQ=255)
aaGTTTGCCTGATGAGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTc < 1:1281440/140‑1 (MQ=255)
gTTTGCCTGATGAGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTccc < 2:94420/140‑1 (MQ=255)
gTTTGCCTGATGAGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTccc > 1:653219/1‑140 (MQ=255)
ccTGATGAGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCg > 1:114925/1‑127 (MQ=255)
ccTGATGAGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCg < 2:114925/127‑1 (MQ=255)
ccTGATGAGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGc < 2:64241/140‑1 (MQ=255)
ccTGATGAGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGc < 2:912176/140‑1 (MQ=255)
ccTGATGAGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGc < 1:567876/140‑1 (MQ=255)
ccTGATGAGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGc > 1:1227160/1‑140 (MQ=255)
ccTGATGAGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGc < 2:1075152/140‑1 (MQ=255)
ccTGATGAGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGc < 1:312494/140‑1 (MQ=255)
tgatgaGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCtt < 2:191004/140‑1 (MQ=255)
atgaGTCGATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTaa < 1:539870/140‑1 (MQ=255)
atgaGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTaa > 2:1079871/1‑140 (MQ=255)
atgaGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTaa < 1:980888/140‑1 (MQ=255)
tCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATc > 2:83213/1‑137 (MQ=255)
tCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATc < 1:83213/137‑1 (MQ=255)
aTCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCAtt < 2:120375/140‑1 (MQ=255)
cGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCAtt < 2:1216497/138‑1 (MQ=255)
cGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCAtt > 1:1216497/1‑138 (MQ=255)
cGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTAt < 2:640370/140‑1 (MQ=255)
tGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGcgcg > 2:888162/1‑140 (MQ=255)
gTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGt < 1:372594/140‑1 (MQ=255)
ttCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTa > 1:1058636/1‑140 (MQ=255)
ggCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGgc > 2:831215/1‑140 (MQ=255)
ggCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGgc < 2:774871/140‑1 (MQ=255)
gCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGgcg < 2:942840/140‑1 (MQ=255)
gCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGgcg < 1:398442/140‑1 (MQ=255)
gCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGgcg < 2:653219/140‑1 (MQ=255)
cTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGgcgc > 2:1221231/1‑140 (MQ=255)
cTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGgcgc > 1:76341/1‑140 (MQ=255)
cTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGgcgc < 1:1079871/140‑1 (MQ=255)
cTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGgcgc > 2:332029/1‑140 (MQ=255)
cTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGgcgc > 2:379692/1‑140 (MQ=255)
tACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGcgcg < 2:897728/140‑1 (MQ=255)
tACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGcgcg < 2:547209/140‑1 (MQ=255)
aCGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCgcgg < 2:423665/140‑1 (MQ=255)
cGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCgcggc < 2:670138/140‑1 (MQ=255)
gctgtggctgGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTa > 1:603906/1‑140 (MQ=255)
gctgtggctgGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTa > 1:275684/1‑140 (MQ=255)
gctgtggctgGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGATCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTa > 1:649651/1‑140 (MQ=255)
gctgtggctgGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACATTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTa > 2:880880/1‑140 (MQ=255)
ggctgGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTc > 1:898218/1‑140 (MQ=255)
ggctgGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTc < 1:1221231/140‑1 (MQ=255)
gctgGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCgcggc < 2:645506/129‑1 (MQ=255)
gctgGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCgcggc > 1:645506/1‑129 (MQ=255)
gtggtAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGc > 1:873454/1‑140 (MQ=255)
gtggtAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGc > 1:554169/1‑140 (MQ=255)
cGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAgcg < 1:831215/140‑1 (MQ=255)
tGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAgcggc > 1:798306/1‑140 (MQ=255)
gCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAgcggcg > 1:296214/1‑140 (MQ=255)
cTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGcggcgg > 1:482521/1‑140 (MQ=255)
tATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGc < 2:873454/140‑1 (MQ=255)
gATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCg < 2:972186/140‑1 (MQ=255)
tGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAgcg > 1:819335/1‑123 (MQ=255)
tGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAgcg < 2:819335/123‑1 (MQ=255)
tGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTgg > 2:982256/1‑140 (MQ=255)
tGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTgg > 2:294637/1‑140 (MQ=255)
tGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTgg < 2:488360/140‑1 (MQ=255)
gggCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGt > 1:558412/1‑140 (MQ=255)
ggCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGtt > 1:160397/1‑140 (MQ=255)
ggCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTAGCAGCGTTGGtt > 2:462275/1‑140 (MQ=255)
cagcaAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCt > 1:60417/1‑140 (MQ=255)
agcaAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCtt > 1:600586/1‑140 (MQ=255)
caAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTg > 2:431541/1‑140 (MQ=255)
aaaTACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGc < 2:296214/140‑1 (MQ=255)
aaaTACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGc < 2:160397/140‑1 (MQ=255)
aCCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTc < 2:1267726/131‑1 (MQ=255)
aCCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTc > 1:1267726/1‑131 (MQ=255)
aCCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGt > 1:343951/1‑140 (MQ=255)
gATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTg < 2:502764/140‑1 (MQ=255)
aTCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTa > 2:333970/1‑136 (MQ=255)
aTCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTa < 1:333970/136‑1 (MQ=255)
aTCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTAt < 2:1241662/137‑1 (MQ=255)
aTCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTAt > 1:1241662/1‑137 (MQ=255)
aTCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGc > 1:606032/1‑140 (MQ=255)
aTCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGc > 1:914555/1‑140 (MQ=255)
tcctccAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCg < 2:482521/140‑1 (MQ=255)
ctccAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGAt < 2:1279601/140‑1 (MQ=255)
ctccAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGAt < 2:898218/140‑1 (MQ=255)
ctccAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGAt < 2:554169/140‑1 (MQ=255)
ctccAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGAt < 1:431541/140‑1 (MQ=255)
ctccAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTCGTTCTTTGCCGGTATTGCGAt < 2:914555/140‑1 (MQ=255)
ctccAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGATCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGAt < 2:649651/140‑1 (MQ=255)
tccAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGAtt > 2:1198193/1‑140 (MQ=255)
tccAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTCCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGAtt > 1:1020763/1‑140 (MQ=255)
cAGAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTgg > 1:217227/1‑140 (MQ=255)
gAACTTTGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTa < 2:606032/140‑1 (MQ=255)
tGCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCg > 2:510795/1‑140 (MQ=255)
gCTCTGGGGGATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGt < 2:798306/140‑1 (MQ=255)
ggggATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCt > 2:948742/1‑140 (MQ=255)
gATGCGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGc < 1:888162/140‑1 (MQ=255)
|
GTGAAAAACGTAAGTTTGCCTGATGAGTCAATCGATCTGTTCAACAGGGCTACGCTGGCTGTGGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGC > NC_000913/25185‑25457
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
