Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F28 I1 R1
|
161 |
75.5 |
2581324 |
99.3% |
2563254 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,798,933 |
G→A |
P127L (CCC→CTC) |
waaU ← |
putative ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase 4 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,798,933 | 0 | G | A | 100.0%
| 433.4
/ NA
| 119 | P127L (CCC→CTC) | waaU | putative ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase 4 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (63/56); total (63/56) |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
TGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGGGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAAT > NC_000913/3798797‑3799067
|
tGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCa < 1:713287/140‑1 (MQ=255)
gCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCAt > 2:755320/1‑140 (MQ=255)
gCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCAt > 1:224476/1‑140 (MQ=255)
tCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAg > 2:1088192/1‑140 (MQ=255)
cGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGt > 2:1022272/1‑140 (MQ=255)
tgtACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGttt > 1:1052906/1‑140 (MQ=255)
tgtACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGttt > 1:18495/1‑140 (MQ=255)
gtACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTc > 2:291617/1‑140 (MQ=255)
tCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAg < 2:518600/140‑1 (MQ=255)
tCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAg < 2:124779/140‑1 (MQ=255)
tCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAg < 2:248985/140‑1 (MQ=255)
cATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAgg > 2:601450/1‑140 (MQ=255)
atatGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCGAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAggg > 2:897006/1‑140 (MQ=255)
atatGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAggg > 1:1058016/1‑140 (MQ=255)
atatGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAggg > 1:319067/1‑140 (MQ=255)
tGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTc < 1:1051228/140‑1 (MQ=255)
tGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTc < 1:1202726/140‑1 (MQ=255)
gTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCt > 1:407148/1‑140 (MQ=255)
ttCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCa < 1:737279/122‑1 (MQ=255)
ttCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCa > 2:737279/1‑122 (MQ=255)
ttCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTa > 2:140437/1‑140 (MQ=255)
ttCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTa > 2:214845/1‑140 (MQ=255)
ttCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGGAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTa > 2:795463/1‑140 (MQ=255)
cTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAAt > 2:5401/1‑140 (MQ=255)
ttttAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATa < 2:1052906/140‑1 (MQ=255)
ttttAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATa > 1:885509/1‑140 (MQ=255)
ttttAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATa > 1:821909/1‑140 (MQ=255)
ttttAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATa > 2:1235787/1‑140 (MQ=255)
ttttAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATa > 1:68756/1‑140 (MQ=255)
ttAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGGATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAATCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACa > 2:1199495/1‑140 (MQ=255)
ttAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACa > 2:227994/1‑140 (MQ=255)
ttAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACa > 2:140035/1‑140 (MQ=255)
ttAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACa < 2:414440/140‑1 (MQ=255)
ttAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACa > 2:876988/1‑140 (MQ=255)
ttAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTCTCAAAGAGGACTAATACa > 1:465208/1‑140 (MQ=255)
ttCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGa < 2:820659/140‑1 (MQ=255)
tCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGaa > 1:709673/1‑140 (MQ=255)
aTCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATa > 1:980973/1‑128 (MQ=255)
aTCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACt > 1:1062737/1‑140 (MQ=255)
cGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATa < 2:788736/126‑1 (MQ=255)
cGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATa > 1:788736/1‑126 (MQ=255)
tGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGa < 2:435886/127‑1 (MQ=255)
tGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGa > 1:435886/1‑127 (MQ=255)
tGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCg < 1:140035/140‑1 (MQ=255)
gTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGTATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCa < 1:650052/140‑1 (MQ=255)
gTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCa < 2:224476/140‑1 (MQ=255)
gTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCa < 2:1062737/140‑1 (MQ=255)
gTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCa < 1:140437/140‑1 (MQ=255)
gTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCa < 2:752754/140‑1 (MQ=255)
gTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCa < 1:897006/140‑1 (MQ=255)
gTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCa < 2:821909/140‑1 (MQ=255)
gTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCa < 1:795463/140‑1 (MQ=255)
gTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCa < 1:79070/140‑1 (MQ=255)
aaTGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATg < 2:770497/140‑1 (MQ=255)
aaTGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATg < 2:174854/140‑1 (MQ=255)
aaTGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATg < 1:227994/140‑1 (MQ=255)
aaTGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATg > 1:1068568/1‑140 (MQ=255)
tGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCt < 1:601450/140‑1 (MQ=255)
gAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCtt > 1:1090667/1‑140 (MQ=255)
aTAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTAc < 2:670936/140‑1 (MQ=255)
aTAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTAc < 2:709673/140‑1 (MQ=255)
tAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACa > 1:183679/1‑140 (MQ=255)
aGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGa > 2:1066286/1‑131 (MQ=255)
aGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGa < 1:1066286/131‑1 (MQ=255)
aGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACAt > 2:973105/1‑140 (MQ=255)
aCGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATg < 2:872331/129‑1 (MQ=255)
aCGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATagag > 2:1013289/1‑140 (MQ=255)
aCGCGTATACGAATGATCAGAACCCAGGTTCGAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATagag > 2:471249/1‑140 (MQ=255)
cTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTaa < 2:655287/140‑1 (MQ=255)
taCCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCAt < 1:1234259/140‑1 (MQ=255)
aTGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCaa > 1:652831/1‑140 (MQ=255)
aTGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCaa > 1:1193562/1‑140 (MQ=255)
tGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAg > 2:1260436/1‑140 (MQ=255)
gATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGa > 1:976108/1‑140 (MQ=255)
aTCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGaa > 1:805931/1‑140 (MQ=255)
aGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGa < 1:21666/140‑1 (MQ=255)
aGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGa < 2:1068568/140‑1 (MQ=255)
aGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGa < 2:976108/140‑1 (MQ=255)
aGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGa < 1:1013289/140‑1 (MQ=255)
aaGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTa > 1:899099/1‑140 (MQ=255)
ttttAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGa > 1:1028126/1‑126 (MQ=255)
ttttAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGa > 1:917762/1‑140 (MQ=255)
tttAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGaa < 1:1260436/140‑1 (MQ=255)
aaaCTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTc < 1:973105/140‑1 (MQ=255)
tGATAATATTAAGCTATGCTTTAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCtt > 1:73497/1‑122 (MQ=255)
tGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCtt > 1:547626/1‑122 (MQ=255)
gATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAatat > 2:934920/1‑140 (MQ=255)
tAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTc > 1:1135578/1‑126 (MQ=255)
tAAGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTttat < 1:934920/140‑1 (MQ=255)
aGCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTttatta > 1:1072965/1‑140 (MQ=255)
gCTATGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTttattat < 2:93714/140‑1 (MQ=255)
tGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTaga > 2:644371/1‑140 (MQ=255)
tGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTaga < 2:1164716/140‑1 (MQ=255)
tGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTaga > 1:1164071/1‑140 (MQ=255)
tGCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTaga > 1:1148834/1‑140 (MQ=255)
tGCCTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTaga > 2:225120/1‑140 (MQ=255)
gCTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTagag > 1:1021091/1‑140 (MQ=255)
cTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTagaga > 2:155494/1‑140 (MQ=255)
cTTAAATGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTagaga > 1:695728/1‑140 (MQ=255)
aTGAGAGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAAt > 1:514864/1‑140 (MQ=255)
|
TGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCTTATACCAATGATCAAAACCCAGAATGTAAGAATCTTTTAAACTTGATAATATTAAGCTATGCTTAAATGAGGGCATAGTTTCAAAGGGGTCTAATACAATATCGAACTGTAAATCCCGCAGATGCTTACATAGAGTAAGCATTTCAAGAAAACCGGTTGATTCTTTAATACAGAACTCAAATATATTTTTATTATTAGAGAGAAAT > NC_000913/3798797‑3799067
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
