Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F28 I1 R1
|
161 |
75.5 |
2581324 |
99.3% |
2563254 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,439,465 |
(A)7→8 |
intergenic (‑203/‑122) |
ytfJ ← / → ytfK |
protein YtfJ/DUF1107 domain‑containing protein YtfK |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,439,458 | 1 | . | A | 98.7%
| 261.2
/ ‑3.6
| 74 | intergenic (‑196/‑129) | ytfJ/ytfK | protein YtfJ/DUF1107 domain‑containing protein YtfK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base A (36/37); total (37/37) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 |
CATATGTGCTATTTATCGAATTTCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGT‑AAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTGGCACCGCACAGGCGTAATACTCAGCA > NC_000913/4439319‑4439576
|
cATATGTGCTATTTATCGAATTTCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGt > 2:562756/1‑140 (MQ=255)
atatGTGCTATTTATCGAATTTCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGT‑a > 1:991028/1‑140 (MQ=255)
atatGTGCTATTTATCGAATTTCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGT‑a > 2:495491/1‑140 (MQ=255)
atGTGCTATTTATCGAATTTCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGT‑aaa > 1:1174195/1‑140 (MQ=255)
atGTGCTATTTATCGAATTTCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGT‑aaa > 1:464407/1‑140 (MQ=255)
tgtgCTATTTATCGAATTTCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGT‑aaaa < 1:1168390/140‑1 (MQ=255)
tgCTATTTATCGAATTTCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGT‑aaaaaa > 2:741092/1‑140 (MQ=255)
tgCTATTTATCGAATTTCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGT‑aaaaaa < 2:464407/140‑1 (MQ=255)
tttATCGAATTTCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGT‑aaaaaaaagtt > 2:41485/1‑136 (MQ=255)
tATCGAATTTCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTtat > 1:1201035/1‑140 (MQ=255)
aTCGAATTTCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTtata > 2:290183/1‑140 (MQ=255)
aTCGAATTTCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTtata < 2:353571/140‑1 (MQ=255)
cGAATTTCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATAcg > 1:1145843/1‑140 (MQ=255)
cGAATTTCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATAcg > 1:304103/1‑140 (MQ=255)
ttCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTg > 2:1013845/1‑140 (MQ=255)
ttCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTg > 2:676133/1‑140 (MQ=255)
cccGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGa > 2:554138/1‑140 (MQ=255)
cGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGTTAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGaaa > 2:27715/1‑140 (MQ=255)
gCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAAc < 1:41485/140‑1 (MQ=255)
gCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAAc < 2:304103/140‑1 (MQ=255)
aTGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCgg < 1:554138/140‑1 (MQ=255)
aTGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCgg < 1:832415/140‑1 (MQ=255)
aTGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCgg < 1:741092/140‑1 (MQ=255)
aTGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCgg < 1:916966/140‑1 (MQ=255)
tGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGTTAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGa < 1:27715/140‑1 (MQ=255)
tGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGa < 2:1174195/140‑1 (MQ=255)
tGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGa < 1:619162/140‑1 (MQ=255)
tGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGa < 2:1201035/140‑1 (MQ=255)
tGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGa < 1:290183/140‑1 (MQ=255)
gCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGAt < 1:562756/140‑1 (MQ=255)
gTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGCGGAAACATTGCCCGGATAGt < 2:303031/139‑1 (MQ=255)
gTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGCGGAAACATTGCCCGGATAGt > 1:303031/1‑139 (MQ=255)
ttGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCta < 2:1158196/140‑1 (MQ=255)
gCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCtata < 2:475793/140‑1 (MQ=255)
aGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCtat < 2:871135/132‑1 (MQ=255)
aGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCtat > 1:871135/1‑132 (MQ=255)
cgcACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGa > 1:752238/1‑122 (MQ=255)
cgcACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGa < 2:752238/122‑1 (MQ=255)
atatGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAAtt > 2:360049/1‑140 (MQ=255)
tatGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTGACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAAttt > 2:1198600/1‑140 (MQ=255)
atGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTg < 2:991028/140‑1 (MQ=255)
gAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTgcg < 2:1282175/140‑1 (MQ=255)
gAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTgcg < 1:1013845/140‑1 (MQ=255)
gAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTgcg < 1:676133/140‑1 (MQ=255)
gAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTgcg < 1:54040/140‑1 (MQ=255)
aaaaaTGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTgcgc < 2:1145843/140‑1 (MQ=255)
aaaaaTGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTgcgc < 1:1015072/140‑1 (MQ=255)
tataCTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTg > 1:980750/1‑140 (MQ=255)
tataCTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTg > 1:711487/1‑140 (MQ=255)
taCTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTggg < 1:360049/140‑1 (MQ=255)
cTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGCTAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGcc > 2:752901/1‑140 (MQ=255)
gAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGa > 2:999717/1‑140 (MQ=255)
aaGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTggg < 1:183232/135‑1 (MQ=255)
aaGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTggg > 2:183232/1‑135 (MQ=255)
aaGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGAt > 1:460567/1‑140 (MQ=255)
aaGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGAt > 1:246388/1‑140 (MQ=255)
aaGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGAt > 1:600739/1‑140 (MQ=255)
aaGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGAt > 2:28404/1‑140 (MQ=255)
aaGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGAt > 2:1080057/1‑140 (MQ=255)
aGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGAtt > 1:47920/1‑140 (MQ=255)
aGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGAtt > 2:489214/1‑140 (MQ=255)
gACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATtg > 2:962527/1‑140 (MQ=255)
gACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGT‑AAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATtgt > 2:383969/1‑140 (MQ=255)
ccGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATtgtg > 2:1011834/1‑140 (MQ=255)
cgcgCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTgg > 1:989793/1‑140 (MQ=255)
cgcgCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTgg > 1:218334/1‑140 (MQ=255)
cgcTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATtg < 2:346705/135‑1 (MQ=255)
cgcTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATtg > 1:346705/1‑135 (MQ=255)
cgcTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTGGCa > 1:1131248/1‑140 (MQ=255)
cgcTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTGGCa > 1:867526/1‑140 (MQ=255)
cgcTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTGGCa > 2:852482/1‑140 (MQ=255)
ttCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCGCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTGGCACCg < 1:662559/140‑1 (MQ=255)
ttCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTGGCACCg > 2:259893/1‑140 (MQ=255)
ggTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTGGCACCGcgc < 2:867526/140‑3 (MQ=255)
ggTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTGGCACCGcac < 1:1198600/140‑1 (MQ=255)
ggTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTGGCACCGcac < 1:1011834/140‑1 (MQ=255)
tAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTGGCACCGCACAg < 2:600739/140‑1 (MQ=255)
gATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTGGCACCGCACAGGCGTaa < 1:259893/140‑1 (MQ=255)
tAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTGGCACCGCACAGGCGTAATa < 2:711487/140‑1 (MQ=255)
aTTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTGGCACCGCACAGGCGTAATACt > 2:1223573/1‑140 (MQ=255)
gAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTGGCACCGCACAGGCGTAATACTcagca < 1:489214/140‑1 (MQ=255)
tAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTGGCACCGCACAGGCGTAATACTcag < 2:810965/122‑1 (MQ=255)
tAGGTAAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTGGCACCGCACAGGCGTAATACTcag > 1:810965/1‑122 (MQ=255)
|
CATATGTGCTATTTATCGAATTTCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGT‑AAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTGGCACCGCACAGGCGTAATACTCAGCA > NC_000913/4439319‑4439576
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
