Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A9 F28 I1 R1
|
151 |
87.4 |
2971636 |
99.2% |
2947862 |
138.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,248,921 |
A→G |
intergenic (+99/‑48) |
mzrA → / → yqjC |
modulator protein MzrA/DUF1090 domain‑containing protein YqjC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,248,921 | 0 | A | G | 99.3%
| 518.9
/ NA
| 145 | intergenic (+99/‑48) | mzrA/yqjC | modulator protein MzrA/DUF1090 domain‑containing protein YqjC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (68/76); minor base C (0/1); total (68/77) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
TGACCCGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAA > NC_000913/3248785‑3249057
|
tGACCCGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCaa < 1:1018456/140‑1 (MQ=255)
gACCCGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAAt > 2:93595/1‑140 (MQ=255)
gACCCGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAAt > 2:456780/1‑140 (MQ=255)
gACCCGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAAt > 1:380377/1‑140 (MQ=255)
cccGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCg < 1:1017636/140‑1 (MQ=255)
cccGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCg < 1:456780/140‑1 (MQ=255)
cccGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCg < 1:1442544/140‑1 (MQ=255)
ccGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGt < 1:945971/140‑1 (MQ=255)
ccGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGt < 1:532644/140‑1 (MQ=255)
ccGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGt < 1:409397/140‑1 (MQ=255)
ggTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTc > 2:855913/1‑140 (MQ=255)
gTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTcc < 2:1028252/140‑1 (MQ=255)
ttACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCt > 2:238717/1‑140 (MQ=255)
tACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCtt < 2:299452/140‑1 (MQ=255)
tACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCtt < 2:1382447/140‑1 (MQ=255)
aTAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAAt < 1:746894/140‑1 (MQ=255)
tAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGt < 1:481499/128‑1 (MQ=255)
aCTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGt > 1:418238/1‑126 (MQ=255)
aCTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGt < 2:418238/126‑1 (MQ=255)
aCTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAgg > 2:1408880/1‑140 (MQ=255)
ctctCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGt < 2:341919/140‑1 (MQ=255)
tcATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAAt < 1:368534/133‑1 (MQ=255)
tcATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACCACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAAt > 2:368534/1‑133 (MQ=255)
cATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGa < 1:238717/140‑1 (MQ=255)
aTCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGaa > 2:139573/1‑140 (MQ=255)
ttCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAAt < 1:1277937/136‑1 (MQ=255)
ttCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAAt > 2:1277937/1‑136 (MQ=255)
tCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACaa > 1:296584/1‑140 (MQ=255)
aTAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGa < 1:1408880/140‑1 (MQ=255)
tCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTc < 1:855913/140‑1 (MQ=255)
tCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTc < 1:551006/140‑1 (MQ=255)
aTCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGa < 2:667690/127‑1 (MQ=255)
aTCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATg < 1:139573/140‑1 (MQ=255)
aTCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCCTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGa > 1:667690/1‑127 (MQ=255)
tCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAAtta > 2:710132/1‑138 (MQ=255)
tCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGa > 1:515643/1‑140 (MQ=255)
ccGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGaa < 2:799566/136‑1 (MQ=255)
ccGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGaa > 1:799566/1‑136 (MQ=255)
cGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGaaa > 2:204877/1‑140 (MQ=255)
gAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAAt > 2:1061231/1‑140 (MQ=255)
ctTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAg < 2:380377/140‑1 (MQ=255)
gATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTtc < 2:515643/140‑1 (MQ=255)
tttCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCACATCGCTTTAGCTGTTtctc < 2:485192/140‑1 (MQ=255)
aCCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCtt > 1:492329/1‑140 (MQ=255)
gTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGc < 1:602313/140‑1 (MQ=255)
aaCTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGctc > 1:1316883/1‑140 (MQ=255)
tCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGt > 1:120727/1‑140 (MQ=255)
tCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGt > 1:1029605/1‑140 (MQ=255)
tGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCg < 2:1187763/140‑1 (MQ=255)
aTGAGGCGGTGGTTAACGCTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGtt > 2:1157007/1‑140 (MQ=255)
aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCg < 1:705073/134‑1 (MQ=255)
aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGtt > 1:421372/1‑140 (MQ=255)
aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGtt > 2:425945/1‑140 (MQ=255)
aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGtt > 1:1343225/1‑140 (MQ=255)
tGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTa < 1:743276/140‑1 (MQ=255)
tGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTa < 1:364202/140‑1 (MQ=255)
ggCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTa > 2:1150055/1‑137 (MQ=255)
ggCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTa < 1:1150055/137‑1 (MQ=255)
gCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGcc < 1:425945/140‑1 (MQ=255)
cGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTGCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCa < 1:67394/140‑1 (MQ=255)
cGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCg > 2:696624/1‑128 (MQ=255)
cGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCa > 2:239214/1‑140 (MQ=255)
ggtggtTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTa > 1:1159375/1‑134 (MQ=255)
ggtggtTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCAc > 2:580813/1‑140 (MQ=255)
ggtggtTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCAc > 2:199536/1‑140 (MQ=255)
gtggtTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACt > 2:418930/1‑140 (MQ=255)
tggtTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTa < 1:295731/132‑1 (MQ=255)
tggtTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTa > 2:295731/1‑132 (MQ=255)
gtTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTAcc < 1:710132/140‑1 (MQ=255)
gtTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTAcc < 1:580813/140‑1 (MQ=255)
gtTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTAcc < 1:199536/140‑1 (MQ=255)
gtTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTAcc < 1:1445559/140‑1 (MQ=255)
gtTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTAcc < 1:978156/140‑1 (MQ=255)
cacTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATCAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCTCTTCCCtgtg < 2:919176/140‑1 (MQ=255)
tACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTAcc > 1:924563/1‑132 (MQ=255)
tACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCa > 2:290867/1‑140 (MQ=255)
tACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCa > 2:379997/1‑140 (MQ=255)
tACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCa > 2:565227/1‑140 (MQ=255)
ccGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCa < 2:711119/125‑1 (MQ=255)
ccGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCa > 2:1384400/1‑125 (MQ=255)
ccGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCa < 1:1384400/125‑1 (MQ=255)
ccGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCt > 2:967715/1‑132 (MQ=255)
ccGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCt < 1:967715/132‑1 (MQ=255)
ccGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAgg > 2:455399/1‑140 (MQ=255)
ccGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAgg > 1:1273845/1‑140 (MQ=255)
ccGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAgg > 2:823805/1‑140 (MQ=255)
ccGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAgg > 1:92095/1‑140 (MQ=255)
ccGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAgg > 1:1170326/1‑140 (MQ=255)
ccGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAgg > 1:1215309/1‑140 (MQ=255)
ccGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAgg > 2:437036/1‑140 (MQ=255)
ccGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAgg > 2:485767/1‑140 (MQ=255)
cTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGaaa > 2:519965/1‑140 (MQ=255)
cTTCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGaaa > 1:1113422/1‑140 (MQ=255)
tCGTTGTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAg > 1:491118/1‑140 (MQ=255)
gTCTGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCa < 1:239214/140‑1 (MQ=255)
tGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCaaaa < 1:204877/140‑1 (MQ=255)
tGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCaaaa < 2:550170/140‑1 (MQ=255)
tGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCaaaa < 2:1343225/140‑1 (MQ=255)
tGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCaaaa < 2:1305654/140‑1 (MQ=255)
tGGGCAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCaaaa < 2:1215309/140‑1 (MQ=255)
|
TGACCCGGTTACGGGATAACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAA > NC_000913/3248785‑3249057
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
