Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F28 I1 R1
|
183 |
98.6 |
3427438 |
96.9% |
3321187 |
138.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,778,930 |
(C)6→7 |
coding (3797/4581 nt) |
ypjA ← |
adhesin‑like autotransporter YpjA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,778,924 | 1 | . | C | 100.0%
| 354.7
/ NA
| 95 | A1268G (GCG→GGG) | ypjA | adhesin‑like autotransporter YpjA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base C (40/55); total (40/55) |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
ATAGCCCATAAAAGCGCCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCG‑CCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTACGGCTGCCGTAGAAGGCGTAATG > NC_000913/2778785‑2779058
|
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aTAGCCCATAAAAGCGCCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCg < 2:722017/140‑1 (MQ=255)
tAGCCCATAAAAGCGCCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCG‑c < 2:1147800/140‑1 (MQ=255)
tAGCCCATAAAAGCGCCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCG‑c > 1:1658077/1‑140 (MQ=255)
tAGCCCATAAAAGCGCCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCG‑c < 2:698410/140‑1 (MQ=255)
cccATAAAAGCGCCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCG‑cccc > 2:201996/1‑140 (MQ=255)
tAAAAGCGCCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCG‑ccccccca > 1:1144848/1‑138 (MQ=255)
tAAAAGCGCCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCG‑ccccccca > 1:1167586/1‑138 (MQ=255)
tAAAAGCGCCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCG‑ccccccca < 1:415967/140‑3 (MQ=255)
tAAAAGCGCCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCG‑ccccccca > 1:311895/1‑138 (MQ=255)
tAAAAGCGCCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCG‑ccccccca > 2:215162/1‑138 (MQ=255)
tAAAAGCGCCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCG‑c > 1:1371029/1‑133 (MQ=255)
tAAAAGCGCCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCG‑c < 2:1371029/133‑1 (MQ=255)
aaaGCGCCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCG‑cccccccaga < 1:1119939/140‑5 (MQ=255)
aaaGCGCCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCG‑cccccccaga < 1:1078173/140‑5 (MQ=255)
aaaGCGCCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTAGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCG‑cccccccaga < 1:184215/140‑5 (MQ=255)
aGCGCCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACa < 1:890705/140‑1 (MQ=255)
cgcCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACatt > 2:1559742/1‑140 (MQ=255)
cgcCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCG‑cc < 2:404153/128‑1 (MQ=255)
cgcCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCG‑cc > 1:404153/1‑128 (MQ=255)
cgcCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCAACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACatt > 2:1695743/1‑140 (MQ=255)
gcCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACatta < 1:201996/140‑1 (MQ=255)
tAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTAttg < 2:1167586/140‑1 (MQ=255)
tAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTAttg < 1:558550/140‑1 (MQ=255)
aGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTAttgt > 1:137670/1‑140 (MQ=255)
aGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTAttgt > 2:569628/1‑140 (MQ=255)
aGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTAttgt > 2:618411/1‑140 (MQ=255)
cGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTAttgttg < 2:965735/140‑1 (MQ=255)
gTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTtgtgtg > 2:1364306/1‑140 (MQ=255)
aaTTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGa < 2:1500190/140‑1 (MQ=255)
ttCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACt < 1:433794/140‑1 (MQ=255)
ttCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACt < 1:574194/140‑1 (MQ=255)
ttCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACt < 1:652902/140‑1 (MQ=255)
tCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTc > 2:1425659/1‑140 (MQ=255)
tCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTc > 1:1559285/1‑140 (MQ=255)
ccTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCg < 2:540148/140‑1 (MQ=255)
ccTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCg > 2:558162/1‑140 (MQ=255)
ccTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCg > 2:1027164/1‑140 (MQ=255)
tCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCTGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCtt < 2:478102/140‑1 (MQ=255)
aGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTc > 1:93028/1‑140 (MQ=255)
ggAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCa < 1:1364306/140‑1 (MQ=255)
aCGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAAc > 1:1226889/1‑140 (MQ=255)
aCGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAAc > 1:1074265/1‑140 (MQ=255)
cTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCt > 2:358350/1‑140 (MQ=255)
gTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTcg > 2:1696951/1‑140 (MQ=255)
tCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTcgc > 1:844041/1‑140 (MQ=255)
aTCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGaa < 2:311895/140‑1 (MQ=255)
ccccACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATa < 1:182866/140‑1 (MQ=255)
ccccACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATa < 1:1229441/140‑1 (MQ=255)
cTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGtt < 1:1696951/140‑1 (MQ=255)
tCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAg < 2:137670/140‑1 (MQ=255)
cATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGc > 2:1567406/1‑140 (MQ=255)
aTTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCt < 1:1477995/140‑1 (MQ=255)
aTTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCt < 2:844041/140‑1 (MQ=255)
ttCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTc > 2:926160/1‑140 (MQ=255)
ttCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTc > 1:1248804/1‑140 (MQ=255)
ttCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTc > 1:1653721/1‑140 (MQ=255)
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tCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCa < 1:558162/140‑1 (MQ=255)
tCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCa < 2:1355693/140‑1 (MQ=255)
tCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCa < 1:1027164/140‑1 (MQ=255)
tCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCa < 1:1554783/140‑1 (MQ=255)
tCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCa < 2:93028/140‑1 (MQ=255)
tCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCa < 1:856628/140‑1 (MQ=255)
gTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCAt > 2:1059224/1‑140 (MQ=255)
gTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCAt > 2:724811/1‑140 (MQ=255)
aGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCaa < 1:724387/140‑1 (MQ=255)
tCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATAc < 2:200390/140‑1 (MQ=255)
cTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATAcc < 1:29064/140‑1 (MQ=255)
cTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATAcc < 2:1248804/140‑1 (MQ=255)
aaCCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTa > 2:254618/1‑140 (MQ=255)
aCCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACGTTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTaa > 2:1182666/1‑140 (MQ=255)
cGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGt < 2:1605994/140‑1 (MQ=255)
cGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGt < 1:618411/140‑1 (MQ=255)
gCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTtg < 2:879897/140‑1 (MQ=255)
gCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTtg < 1:358350/140‑1 (MQ=255)
gCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTtg < 2:1036612/140‑1 (MQ=255)
gCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTtg < 1:926160/140‑1 (MQ=255)
gtgACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTa < 2:1653721/140‑1 (MQ=255)
gtgACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTa > 1:1553486/1‑140 (MQ=255)
tgACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTAc < 1:816527/140‑1 (MQ=255)
gACATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTACg < 1:91656/140‑1 (MQ=255)
aCATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATTTTGAGTACgg < 1:724811/140‑1 (MQ=255)
aCATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTACgg < 2:1245862/140‑1 (MQ=255)
aCATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTACgg < 1:1327074/140‑1 (MQ=255)
aCATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTACgg < 2:158648/140‑1 (MQ=255)
aCATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTACgg < 2:1559285/140‑1 (MQ=255)
aCATTATTACGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTACgg < 1:1695743/140‑1 (MQ=255)
ttattaCGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTACGGCTg < 2:567731/140‑1 (MQ=255)
tattaCGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTACGGCTGc > 2:399292/1‑140 (MQ=255)
attaCGGGTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTACgg > 2:523324/1‑135 (MQ=255)
ggTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTACGGCTGCCGTAGaa > 1:788022/1‑140 (MQ=255)
ggTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTACGGCTGCCGTAGaa < 1:1497779/140‑1 (MQ=255)
ggTGTTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTACGGCTGCCGTAGaa > 2:1497779/1‑140 (MQ=255)
gtgtTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTACgg < 1:476755/128‑1 (MQ=255)
gtgtTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTACgg > 2:476755/1‑128 (MQ=255)
gtgtTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTACGGCTGCCGTAGAAg > 1:1074597/1‑140 (MQ=255)
gtTATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTACGGCTGCCGTAGAAGGc > 2:1271391/1‑140 (MQ=255)
ttATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTACGGCTGCCGTAGAAGGCg > 2:1634010/1‑140 (MQ=255)
ttATACGTCGCCCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTACGGCTGCCGTAGAAGGCg > 1:698863/1‑140 (MQ=255)
|
ATAGCCCATAAAAGCGCCTAGCGTGGTAATTCCTTCAGGAATATCATTACGGCTGTCGATCCCCACTGTCATTCCGGTCAGCGTCTGCTCAAACCCGGCACCCGCATCGGTGGTGACATTATTACGGGTGTTATACGTCG‑CCCCCCAGACATTATTGTTGTGTGGACTCGCTTTCATTATGTTCAACCGCTCGCGAATACTGTTTAGCTCAGCATCAAATACCAACGGTAATGTTGCTGCCATATTGAGTACGGCTGCCGTAGAAGGCGTAATG > NC_000913/2778785‑2779058
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
