Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F28 I1 R1
|
183 |
98.6 |
3427438 |
96.9% |
3321187 |
138.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,253,881 |
(A)5→4 |
coding (334/897 nt) |
yhaJ ← |
DNA‑binding transcriptional activator YhaJ |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,253,877 | 0 | A | . | 100.0%
| 371.0
/ NA
| 86 | coding (338/897 nt) | yhaJ | DNA‑binding transcriptional activator YhaJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base . (41/45); total (41/45) |
AGGAACGAAAATGCATATCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCC > NC_000913/3253740‑3254012
|
aGGAACGAAAATGCATATCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCTGCCAGTTTGTCGATTAACGGGaaa > 1:77580/1‑140 (MQ=255)
aaCAAAAATGCATCCCCGGCGCGATAACAATACCCGCCCCCCCCTGCCCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGaaaagg < 2:949089/140‑3 (MQ=255)
aCGAAAATGCATATCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGaaaaggc > 2:965056/1‑137 (MQ=255)
aaaagccATATCCGGCGCGATAAAAATTCCCCCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAgg < 1:446544/134‑1 (MQ=255)
aatacCCGGCGGGAAAAAAATCCCCCCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCgg < 1:533268/139‑1 (MQ=255)
tccgggCGCAAAAAAAATACCCCCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGACAGGTGTCGGTAc < 2:665309/136‑1 (MQ=255)
atCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTAc > 1:122730/1‑140 (MQ=255)
tCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTAcc > 2:926850/1‑140 (MQ=255)
gggCGCAAAAAAAATACCCCCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAg < 1:778566/139‑1 (MQ=255)
cGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAg > 1:1212376/1‑140 (MQ=255)
cgcgATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAgcgc > 1:760096/1‑140 (MQ=255)
cgcgATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAgcgc > 1:252507/1‑140 (MQ=255)
cgcgATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAgcgc > 1:1242686/1‑140 (MQ=255)
cgATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGCGTCGGTACCAGCGCtt > 1:1607651/1‑140 (MQ=255)
gATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTc < 1:1412902/140‑1 (MQ=255)
aaaaaCAATACCCCCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTc < 2:1352688/137‑1 (MQ=255)
aTAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCg > 2:1365934/1‑140 (MQ=255)
atatCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTcaca < 1:296217/140‑1 (MQ=255)
cccgcccCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTga > 1:1203852/1‑140 (MQ=255)
ccgcccCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTgag < 1:216820/140‑1 (MQ=255)
cccccccTGCCCCAGCCGTTCCCCCGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCATCGCTTCGGTCACAATGGTgag < 2:1212376/137‑1 (MQ=255)
ccccTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATg > 2:1130640/1‑132 (MQ=255)
ccccTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATg < 1:1130640/132‑1 (MQ=255)
ccccTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATg < 1:965056/140‑1 (MQ=255)
ccccTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATg > 1:1603972/1‑140 (MQ=255)
ccccTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATg < 2:1561001/140‑1 (MQ=255)
ccccTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATg < 1:1131245/140‑1 (MQ=255)
ccccTGCTCCAGCCGTCCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATg < 2:941125/140‑1 (MQ=255)
ccTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCg < 1:1539037/140‑1 (MQ=255)
gCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCGGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATg > 2:375011/1‑129 (MQ=255)
gCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCGGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATg < 1:375011/129‑1 (MQ=255)
gCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAAc > 1:414338/1‑140 (MQ=255)
cGTTCCCGCGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACcg < 1:1075545/140‑1 (MQ=255)
cGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACcg < 1:1615864/140‑1 (MQ=255)
tCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACcgcgc > 1:1010787/1‑140 (MQ=255)
tCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACcgcgc > 2:855507/1‑140 (MQ=255)
cccACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGACGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACcgcgcg > 1:1494638/1‑140 (MQ=255)
ccGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCga < 1:1467765/139‑1 (MQ=255)
cccccGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGagag > 1:1221002/1‑140 (MQ=255)
ccccGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGc < 1:372335/140‑1 (MQ=255)
ccccGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGc < 1:48672/140‑1 (MQ=255)
ccGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTGGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCtt > 2:1497309/1‑140 (MQ=255)
cGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTc < 1:926850/140‑1 (MQ=255)
cGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTc < 2:1603972/140‑1 (MQ=255)
cGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTc < 2:1649301/140‑1 (MQ=255)
cGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTc < 2:1208192/140‑1 (MQ=255)
gCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTc > 1:1468012/1‑135 (MQ=255)
gCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTc < 2:1468012/135‑1 (MQ=255)
gCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCAt < 2:252507/140‑1 (MQ=255)
gCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCAt > 2:1607099/1‑140 (MQ=255)
aCTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCa > 2:301301/1‑140 (MQ=255)
tCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCagta < 2:304450/140‑1 (MQ=255)
tCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTCGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCagta > 1:1192654/1‑140 (MQ=255)
cTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCagtag > 2:109338/1‑140 (MQ=255)
atTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTa > 1:1359555/1‑140 (MQ=255)
tGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATc > 2:1042692/1‑140 (MQ=255)
gCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCt > 1:1218286/1‑140 (MQ=255)
aGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCg > 2:1698819/1‑140 (MQ=255)
gTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGt < 1:628067/130‑1 (MQ=255)
gTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGt > 2:628067/1‑130 (MQ=255)
ttGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGc < 1:397708/140‑1 (MQ=255)
gTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTcc > 2:1214010/1‑140 (MQ=255)
tATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCa < 2:221573/140‑1 (MQ=255)
aTTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAg < 2:414338/140‑1 (MQ=255)
tGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCa > 2:1468550/1‑140 (MQ=255)
tttGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAAcg > 2:857855/1‑140 (MQ=255)
tttGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAAcg > 2:1703319/1‑140 (MQ=255)
tttGCCGCCAGTCTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAAcg > 1:769273/1‑140 (MQ=255)
ttGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAAcgc > 2:957351/1‑140 (MQ=255)
tGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAAcgcg > 2:1221451/1‑140 (MQ=255)
tGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAAcgcg > 2:896036/1‑140 (MQ=255)
ccgccAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGcc < 1:1145992/140‑1 (MQ=255)
cgccAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGccc < 2:122730/140‑1 (MQ=255)
gccAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCt < 2:1192654/140‑1 (MQ=255)
gccAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCt < 1:1365934/140‑1 (MQ=255)
gccAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCt < 1:109338/140‑1 (MQ=255)
ccAGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTc > 1:123927/1‑140 (MQ=255)
aGTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGc < 2:1359555/140‑1 (MQ=255)
gTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCt < 1:1607099/140‑1 (MQ=255)
gTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCt < 1:855507/140‑1 (MQ=255)
gTTTGTCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAAAGGTGAGATGCGTCTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCt < 2:1485249/140‑1 (MQ=255)
tCGATTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCcaac < 2:123927/140‑1 (MQ=255)
aTTAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCaacaac < 1:1214010/140‑1 (MQ=255)
ttAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAacaaca < 2:1218286/140‑1 (MQ=255)
ttAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAacaaca < 1:1638666/140‑1 (MQ=255)
tAACGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACAt > 2:957239/1‑140 (MQ=255)
aaCGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACAtc > 1:341126/1‑140 (MQ=255)
aCGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACAtcc > 1:1116154/1‑140 (MQ=255)
aCGGG‑AAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACAtcc > 1:910926/1‑140 (MQ=255)
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AGGAACGAAAATGCATATCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAATGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCC > NC_000913/3253740‑3254012
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
