Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F28 I1 R1
|
258 |
142.3 |
4824480 |
99.1% |
4781059 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,592,043 |
A→G |
L45P (CTG→CCG) |
hipA ← |
serine/threonine kinase HipA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,592,043 | 0 | A | G | 100.0%
| 378.5
/ NA
| 104 | L45P (CTG→CCG) | hipA | serine/threonine kinase HipA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (46/58); total (46/58) |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
ATAAATCAAACGGTTGTCTGGATTTGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATCCAAGTGACAAGTTTAGGCATTAC > NC_000913/1591909‑1592179
|
aTAAATCAAACGGTTGTCTGGATTTGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGaa < 1:1502258/140‑1 (MQ=255)
tAAATCAAACGGTTGTCTGGATTTGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGaaa > 1:562066/1‑140 (MQ=255)
aaaCGGTTGTCTGGATTTGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACa < 2:1925416/140‑1 (MQ=255)
aaaCGGTTGTCTGGATTTGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACa < 1:221718/140‑1 (MQ=255)
aaaCGGTTGTCTGGATTTGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACa > 1:564292/1‑140 (MQ=255)
aaCGGTTGTCTGGATTTGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACaa < 2:60293/140‑1 (MQ=255)
aaCGGTTGTCTGGATTTGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACaa < 1:1105577/140‑1 (MQ=255)
aCGGTTGTCTGGATTTGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAAc > 2:233691/1‑140 (MQ=255)
aCGGTTGTCTGGATTTGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAAc < 1:1389327/140‑1 (MQ=255)
ttGTCTGGATTTGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTc < 2:141110/140‑1 (MQ=255)
ttGTCTGGATTTGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTc > 1:1451467/1‑140 (MQ=255)
ttGTCTGGATTTGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTc < 1:1183824/140‑1 (MQ=255)
ttGTCTGGATTTGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTc < 1:1869962/140‑1 (MQ=255)
tGTCTGGATTTGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCt > 1:859017/1‑140 (MQ=255)
gTCTGGATTTGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTg > 1:1132613/1‑140 (MQ=255)
tGGATTTGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCa > 2:610888/1‑140 (MQ=255)
ttGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGCAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACg < 2:1490737/140‑1 (MQ=255)
ttGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACg < 1:1652021/140‑1 (MQ=255)
ggCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACg > 2:1591613/1‑138 (MQ=255)
ggCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGc > 1:936271/1‑140 (MQ=255)
ggCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGc > 2:2368420/1‑140 (MQ=255)
gCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCt > 2:1461844/1‑140 (MQ=255)
gTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCAc > 1:1839695/1‑140 (MQ=255)
tAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCAcccc > 2:2358926/1‑140 (MQ=255)
aaCGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCg > 2:231680/1‑140 (MQ=255)
aTCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGc < 1:610888/140‑1 (MQ=255)
aTCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGc < 1:618604/140‑1 (MQ=255)
aTCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGc < 2:1839695/140‑1 (MQ=255)
aTCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGc < 1:947786/140‑1 (MQ=255)
aTCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGc < 2:1841403/140‑1 (MQ=255)
aTCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGc < 2:1149315/140‑1 (MQ=255)
aTCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGc < 1:2165886/140‑1 (MQ=255)
aTCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGc < 1:1343027/140‑1 (MQ=255)
aTCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGc < 1:231680/140‑1 (MQ=255)
aTCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGc < 1:1578627/140‑1 (MQ=255)
aTCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGc < 2:445806/140‑1 (MQ=255)
aTCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGc < 2:452603/140‑1 (MQ=255)
ccGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTg > 2:648579/1‑122 (MQ=255)
ccGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTg < 1:648579/122‑1 (MQ=255)
ccGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGc > 2:287863/1‑138 (MQ=255)
ccGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGc < 1:287863/138‑1 (MQ=255)
ccGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCAt > 2:1492631/1‑140 (MQ=255)
ccGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCAt > 2:725271/1‑140 (MQ=255)
ccGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCAt > 2:916771/1‑140 (MQ=255)
cGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGc < 1:1004693/137‑1 (MQ=255)
cGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGc > 2:1004693/1‑137 (MQ=255)
tACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGc < 2:516759/129‑1 (MQ=255)
tACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGc > 1:516759/1‑129 (MQ=255)
aTCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGtgtg > 1:812986/1‑140 (MQ=255)
tCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTgc < 2:859017/140‑1 (MQ=255)
cGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTgcg < 2:941726/140‑1 (MQ=255)
cGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTgcg < 1:1492631/140‑1 (MQ=255)
cGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTgcg < 1:725271/140‑1 (MQ=255)
gCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTaaa < 2:1903797/129‑1 (MQ=255)
gCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTaaa > 1:1903797/1‑129 (MQ=255)
gCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTgcgcgc < 2:770400/140‑1 (MQ=255)
aaCAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTaa < 1:1461844/140‑1 (MQ=255)
ggTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTc > 2:2303154/1‑140 (MQ=255)
gTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCg > 1:1383921/1‑140 (MQ=255)
gTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCg > 2:227925/1‑140 (MQ=255)
cGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc < 2:2357831/140‑1 (MQ=255)
gaagTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGACTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGc > 1:1281197/1‑140 (MQ=255)
aagTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGcc > 2:1422927/1‑140 (MQ=255)
aagTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGcc > 2:1294712/1‑140 (MQ=255)
aagTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGcc < 1:2358926/140‑1 (MQ=255)
tACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCt < 1:1422927/140‑1 (MQ=255)
aCGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTg < 1:227925/140‑1 (MQ=255)
aCGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTg < 1:1011483/140‑1 (MQ=255)
cGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTgg > 1:1979803/1‑140 (MQ=255)
gCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGgtt < 1:2368420/140‑1 (MQ=255)
cATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTgg > 2:29585/1‑137 (MQ=255)
cATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGgttg > 1:1113461/1‑140 (MQ=255)
cATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGgttg < 2:1383921/140‑1 (MQ=255)
cATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGgttg > 1:251484/1‑140 (MQ=255)
cATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGgttg > 1:1418270/1‑140 (MQ=255)
cATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGgttg > 2:171621/1‑140 (MQ=255)
cATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGgttg > 1:2258147/1‑140 (MQ=255)
cATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGGGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGgttt > 2:1803614/1‑139 (MQ=255)
aTCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGgttgt < 2:1451467/140‑1 (MQ=255)
agGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATc < 2:368684/140‑1 (MQ=255)
agGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATc < 2:251484/140‑1 (MQ=255)
gTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATCCa < 2:812986/140‑1 (MQ=255)
gTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATCCa > 2:529472/1‑140 (MQ=255)
atTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATCCAAGTGa < 1:916771/140‑1 (MQ=255)
atTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATCCAAGTGa < 2:1418270/140‑1 (MQ=255)
atTCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATCCAAGTGa < 2:564292/140‑1 (MQ=255)
ttCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATCCAAGTGAc < 1:233691/140‑1 (MQ=255)
ttCCCCCTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGACTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATCCAAGTGAc < 2:1281197/140‑1 (MQ=255)
cccccTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATCCAAGTGACaa > 2:290822/1‑140 (MQ=255)
cccTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATCCAAGTGACAAGt > 1:523903/1‑140 (MQ=255)
ccTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATCCAAGTGACAAGtt < 2:523903/140‑1 (MQ=255)
ccTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATCCAAGTGACAAGtt > 1:644464/1‑140 (MQ=255)
ccTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATCCAAGTGACAAGtt < 1:171621/140‑1 (MQ=255)
ccTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATCCAAGTGACAAGtt < 2:772496/140‑1 (MQ=255)
ccTCTGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATCCAAGTGACAAGtt > 2:1201459/1‑140 (MQ=255)
tctGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATCCAAGTGACAAGTTTa < 2:275894/140‑1 (MQ=255)
tGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTTCATACTTAAAGGGGTGCGCGCCGTTGGCCAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGGTTTTCCTCCCAGTGAGAAGTTTAgg > 2:2037330/1‑140 (MQ=255)
tGCAATGGCGGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATCCAAGTGACAAGTTTAgg > 1:208361/1‑140 (MQ=255)
ggcggcGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATCCAAGTGACAAGTTTAGGCATTAc < 1:529472/140‑1 (MQ=255)
ggcggcGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATCCAAGTGACAAGTTTAGGCATTAc < 2:1979803/140‑1 (MQ=255)
|
ATAAATCAAACGGTTGTCTGGATTTGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAACTCGCCTACCCGCTGGTTGTTCATCCAAGTGACAAGTTTAGGCATTAC > NC_000913/1591909‑1592179
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
