Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F28 I1 R1
|
258 |
142.3 |
4824480 |
99.1% |
4781059 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,885,377 |
T→C |
L238P (CTG→CCG) |
yeaW → |
carnitine monooxygenase subunit YeaW |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,885,377 | 0 | T | C | 100.0%
| 450.0
/ NA
| 126 | L238P (CTG→CCG) | yeaW | carnitine monooxygenase subunit YeaW |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (72/54); total (72/54) |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
CGCACGCCTGCCAACTGGAAGAACATTGTCGATAACTATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCAAAGGGATGATGACGGTCAT > NC_000913/1885244‑1885512
|
cGCACGCCTGCCAACTGGAAGAACATTGTCGATAACTATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATa > 2:1575483/1‑140 (MQ=255)
gCACGCCTGCCAACTGGAAGAACATTGTCGATAACTATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATAc > 1:1945277/1‑140 (MQ=255)
aCGCCTGCCAACTGGAAGAACATTGTCGATAACTATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACgg < 1:1100702/140‑1 (MQ=255)
cTGCCAACTGGAAGAACATTGTCGATAACTATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTc > 2:2218668/1‑140 (MQ=255)
gCCAACTGGAAGAACATTGTCGATAACTATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGc > 2:1537747/1‑140 (MQ=255)
cTGGAAGAACATTGTCGATAACTATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAAc < 2:1092227/140‑1 (MQ=255)
aCATTGTCGATAACTATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGaa < 2:2358647/140‑1 (MQ=255)
gTCGATAACTATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTc > 2:490374/1‑140 (MQ=255)
gATAACTATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGtt < 1:556546/140‑1 (MQ=255)
tATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAAtt > 2:139671/1‑140 (MQ=255)
tctcGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTg > 1:1221568/1‑140 (MQ=255)
tctcGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTg > 2:1744926/1‑140 (MQ=255)
tctcGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTg > 2:2267410/1‑140 (MQ=255)
tcGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGaa < 2:1221568/140‑1 (MQ=255)
tcGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGaa < 1:27033/140‑1 (MQ=255)
tcGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGaa < 2:337826/140‑1 (MQ=255)
tcGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGaa < 1:1238320/140‑1 (MQ=255)
tcGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGaa < 2:671296/140‑1 (MQ=255)
cggaccacTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGaa > 1:810278/8‑140 (MQ=255)
aGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAagag > 2:1140450/1‑140 (MQ=255)
aGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAagag > 2:1525405/1‑140 (MQ=255)
gTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAgg > 2:1640233/1‑140 (MQ=255)
tGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAggg < 2:1771858/140‑1 (MQ=255)
gCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGaa > 2:489587/1‑134 (MQ=255)
gCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGaa < 1:489587/134‑1 (MQ=255)
gCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGt > 1:2249749/1‑140 (MQ=255)
tATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTAc > 1:1932897/1‑140 (MQ=255)
tCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACgg > 1:2136160/1‑140 (MQ=255)
cACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGa < 1:1553131/140‑1 (MQ=255)
ggTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGc > 2:2076326/1‑140 (MQ=255)
gTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCa > 1:1115551/1‑140 (MQ=255)
gTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCa > 1:1939189/1‑140 (MQ=255)
gTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCa > 1:1851907/1‑140 (MQ=255)
cGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTc > 1:2027077/1‑140 (MQ=255)
cGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTc > 1:620566/1‑140 (MQ=255)
ggCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTcc > 1:1395528/1‑140 (MQ=255)
ggCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTcc > 1:1764954/1‑140 (MQ=255)
ggCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGACAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTcc > 2:1148278/1‑140 (MQ=255)
tCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGtt > 2:1110162/1‑140 (MQ=255)
tCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGtt > 2:313940/1‑140 (MQ=255)
ccAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGttt < 2:1957086/140‑1 (MQ=255)
ccAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGttt > 1:1053640/1‑140 (MQ=255)
ccAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGttt < 1:2076326/140‑1 (MQ=255)
ccAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGttt < 2:845677/140‑1 (MQ=255)
ccAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGttt < 1:2218668/140‑1 (MQ=255)
cAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTc < 1:1107918/140‑1 (MQ=255)
tctcCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCtg < 1:1448006/140‑1 (MQ=255)
ccGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTgg < 1:1140450/140‑1 (MQ=255)
ccGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTgg < 2:2027077/140‑1 (MQ=255)
tCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTg < 2:1930007/140‑1 (MQ=255)
cGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCa < 1:313940/140‑1 (MQ=255)
cGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCa < 2:734225/140‑1 (MQ=255)
cGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCa < 1:2267410/140‑1 (MQ=255)
gTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCt < 1:584629/140‑1 (MQ=255)
gTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCt < 2:1395528/140‑1 (MQ=255)
gTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCt < 2:365868/140‑1 (MQ=255)
gATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCa > 1:1784313/1‑130 (MQ=255)
gATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGaa > 1:743393/1‑140 (MQ=255)
gATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGaa > 2:1630427/1‑140 (MQ=255)
gATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGaa > 1:2224369/1‑140 (MQ=255)
tCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCa < 1:304409/128‑1 (MQ=255)
tCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACg > 1:2088585/1‑140 (MQ=255)
ttACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCa > 2:2354576/1‑140 (MQ=255)
tACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCAc > 1:933433/1‑140 (MQ=255)
tACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCAc < 1:2354576/140‑1 (MQ=255)
aCTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGc > 2:1453503/1‑122 (MQ=255)
aCTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGc < 1:1453503/122‑1 (MQ=255)
aCTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAAccgatca > 1:663762/1‑134 (MQ=255)
aCTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCAcc > 1:833219/1‑140 (MQ=255)
gCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGa > 1:1165539/1‑140 (MQ=255)
gCACACCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGa > 1:1453502/1‑140 (MQ=255)
acacCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATc > 1:493553/1‑140 (MQ=255)
acacCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATc < 2:2158679/140‑1 (MQ=255)
acCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCaa < 2:833219/140‑1 (MQ=255)
acCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCa < 1:1700950/139‑1 (MQ=255)
acCATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGACACCCCGATCaa < 1:1252040/140‑1 (MQ=255)
ccATGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCaaa > 2:1779738/1‑140 (MQ=255)
aTGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCAAAgg > 2:1579693/1‑140 (MQ=255)
tGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCAcc > 2:1468196/1‑128 (MQ=255)
tGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCAcc < 1:1468196/128‑1 (MQ=255)
tGCACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCAAAggg > 1:1728950/1‑140 (MQ=255)
cACGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCAAAGGgat > 1:166913/1‑140 (MQ=255)
aCGGTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCAAAGGgatg > 1:1001465/1‑140 (MQ=255)
gTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCAAAGGGatgatg > 1:2085667/1‑140 (MQ=255)
gTAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCAAAGGGatgatg > 2:2318635/1‑140 (MQ=255)
tAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCaa < 2:362109/129‑1 (MQ=255)
tAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCAAAGGGAtgatga > 2:1837355/1‑140 (MQ=255)
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tAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCAAAGGGAtgatga > 1:712523/1‑140 (MQ=255)
tAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCAAAGGGAtgatga > 1:160790/1‑140 (MQ=255)
tAACTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCAAAGGGAtgatga < 2:2098998/140‑1 (MQ=255)
aaCTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCAAAGGGATGATGAc > 2:2311037/1‑140 (MQ=255)
aaCTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCAAAGGGATGATGAc > 1:1239806/1‑140 (MQ=255)
aCTGGACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCAAAGGGATGATGACg < 2:1728950/140‑1 (MQ=255)
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gACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCAAAGGGATGATGACGGTCa < 1:1630427/140‑1 (MQ=255)
gACGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCAAAGGGATGATGACGGTCa > 1:1675140/1‑140 (MQ=255)
aCGCCGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCAAAGGGATGATGACGGTCAt < 2:2224369/140‑1 (MQ=255)
|
CGCACGCCTGCCAACTGGAAGAACATTGTCGATAACTATCTCGAGTGCTATCACTGTGGTCCGGCGCATCCAGGTTTCTCCGACTCCGTACAGGTTGATCGTTACTGGCACACCATGCACGGTAACTGGACGCTGCAATACGGTTTCGCCAAACCGTCCGAACAGTCGTTTAAATTTGAAGAGGGTACGGATGCGGCATTCCACGGTTTCTGGCTGTGGCCGTGCACGATGCTGAACGTCACCCCGATCAAAGGGATGATGACGGTCAT > NC_000913/1885244‑1885512
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
