Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F28 I1 R1
|
258 |
142.3 |
4824480 |
99.1% |
4781059 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,187,068 |
T→C |
Y37H (TAT→CAT) |
rcnB → |
periplasmic protein involved in nickel/cobalt export |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,187,068 | 0 | T | C | 100.0%
| 610.7
/ NA
| 166 | Y37H (TAT→CAT) | rcnB | periplasmic protein involved in nickel/cobalt export |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (77/89); total (77/89) |
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
ATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACATTAAGCAGTGGCAGTTGCGTAACCTGCCCGCGCCTGATGCCGGGACGCA > NC_000913/2186933‑2187204
|
tACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGt < 1:1961119/140‑1 (MQ=255)
aCAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCAGGAATTTCTAAGCATGAGtt > 2:1109635/1‑140 (MQ=255)
aGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTaa > 2:2052162/1‑140 (MQ=255)
aTCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAagt < 2:1415081/140‑1 (MQ=255)
tCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAagta > 2:1885845/1‑140 (MQ=255)
tCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAagta > 1:226986/1‑140 (MQ=255)
tCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAagta > 1:172478/1‑140 (MQ=255)
ccccAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAagtag > 1:1051240/1‑140 (MQ=255)
ccccAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAagtag > 2:1696277/1‑140 (MQ=255)
ccccAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAagtag > 2:180371/1‑140 (MQ=255)
ccccAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAagtag > 1:2234001/1‑140 (MQ=255)
ccccAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAagtag > 1:2125919/1‑140 (MQ=255)
ccccAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAagtag > 1:1967481/1‑140 (MQ=255)
ccccAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAagtag > 2:793059/1‑140 (MQ=255)
ccccAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAagtag > 2:54538/1‑140 (MQ=255)
cccAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAagtagt > 2:2281508/1‑140 (MQ=255)
aaGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCa > 1:1668248/1‑140 (MQ=255)
tGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTg > 2:442655/1‑140 (MQ=255)
ggAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGc < 2:1466095/140‑1 (MQ=255)
ggAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGc < 2:2127786/140‑1 (MQ=255)
gagaGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGtt > 2:280882/1‑124 (MQ=255)
gagaGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGtt < 1:280882/124‑1 (MQ=255)
gagaGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCt > 1:2353531/1‑140 (MQ=255)
gagaGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCt < 1:1889227/140‑1 (MQ=255)
agagTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTg > 2:1814837/1‑140 (MQ=255)
agagTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTg > 2:1984206/1‑140 (MQ=255)
tttATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCACTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCt < 2:703860/135‑1 (MQ=255)
aTGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGTGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGc < 2:326823/131‑1 (MQ=255)
tGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAg < 1:837436/140‑1 (MQ=255)
tGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAg < 1:1822231/140‑1 (MQ=255)
tGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAg < 1:992016/140‑1 (MQ=255)
aCCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCa > 2:1900277/1‑140 (MQ=255)
ccATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCAt > 1:2070192/1‑140 (MQ=255)
cATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCAtt > 2:2076946/1‑140 (MQ=255)
ttAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAg < 2:1865848/134‑1 (MQ=255)
ttAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTc > 2:1582938/1‑140 (MQ=255)
ttAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTc > 1:250504/1‑140 (MQ=255)
ttAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTc > 1:1287909/1‑140 (MQ=255)
ttAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTc > 1:1581756/1‑140 (MQ=255)
ttAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTc > 2:215161/1‑140 (MQ=255)
ttAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTc > 1:1696919/1‑140 (MQ=255)
tAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCACTACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCa < 2:1668248/140‑1 (MQ=255)
tAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCa < 2:1764363/140‑1 (MQ=255)
aaaaTAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCAGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCaaa < 1:1109635/140‑1 (MQ=255)
aaaTAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAAc < 2:1977516/140‑1 (MQ=255)
aaaTAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTCCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAAc < 1:1188383/140‑1 (MQ=255)
aTGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGa > 2:622595/1‑140 (MQ=255)
aTGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGa < 1:1793704/140‑1 (MQ=255)
gTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTACAAACCAGGGGaca > 2:314256/1‑140 (MQ=255)
tGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAAc < 1:372597/129‑1 (MQ=255)
tGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACAcc > 1:913888/1‑140 (MQ=255)
gCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCg < 1:1885845/140‑1 (MQ=255)
cTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGt > 2:138136/1‑140 (MQ=255)
gggTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTAc < 1:108193/140‑1 (MQ=255)
gggTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTAc < 1:2076946/140‑1 (MQ=255)
gggTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTAc < 1:215161/140‑1 (MQ=255)
ggTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTAcc > 2:1827164/1‑140 (MQ=255)
tGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGacac > 2:1154853/1‑132 (MQ=255)
tGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGacac < 1:1154853/132‑1 (MQ=255)
ttttGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGaa > 2:2152647/1‑137 (MQ=255)
ttttGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATg > 2:1425109/1‑140 (MQ=255)
ttGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCGCCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATgta < 1:1385861/140‑1 (MQ=255)
ttGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATgta < 1:853557/140‑1 (MQ=255)
ttGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATgta < 2:240678/140‑1 (MQ=255)
ttGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTACAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATgta < 1:314256/140‑1 (MQ=255)
cTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATgtaccg > 2:960648/1‑140 (MQ=255)
ggTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATgtaccgta < 1:1158153/140‑1 (MQ=255)
tACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTAc > 1:408146/1‑122 (MQ=255)
tACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGtaccgtaccg > 2:443992/1‑140 (MQ=255)
tACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGtaccgtaccg < 1:1651103/140‑1 (MQ=255)
ccAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGAt < 1:364228/140‑1 (MQ=255)
ccAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGAt < 1:960648/140‑1 (MQ=255)
ccAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGAt < 1:1425109/140‑1 (MQ=255)
gTGCCGCCTGGGCCG‑ACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGAt < 1:773656/136‑1 (MQ=255)
gTGCCGCCTGGGCCG‑ACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGAt > 2:773656/1‑136 (MQ=255)
gccgccTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTa < 2:1383823/140‑1 (MQ=255)
gccgccTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTa < 1:137466/140‑1 (MQ=255)
gccgccTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTa < 1:213394/140‑1 (MQ=255)
gccgccTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTa < 2:250504/140‑1 (MQ=255)
ccgccTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTac > 1:1904680/1‑140 (MQ=255)
ccgccTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTac > 1:1266501/1‑140 (MQ=255)
gggCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACAtt > 2:382308/1‑140 (MQ=255)
gCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACATTaa > 2:1840029/1‑140 (MQ=255)
aGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACATTAAGCAGTGGc < 2:913888/140‑1 (MQ=255)
gCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACATTAAGCAGTGGCa < 2:209920/140‑1 (MQ=255)
ccACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACATTAAGCAGTGGCAg > 1:2380981/1‑140 (MQ=255)
ccGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACATTAAGCAGTGGCAGTTg < 1:1854886/140‑1 (MQ=255)
cgcgGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACATTAAGCAGTGGCAGTTGc > 2:1876233/1‑140 (MQ=255)
aCCAATACCTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACATTAAGCAGTGGCAGTTGCGTAACCTGcc < 2:1266501/140‑1 (MQ=255)
ccTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACATTAAGCAGTGGCAGTTGCGTAACCTGCCCGCGCCt > 1:724550/1‑140 (MQ=255)
ccTCGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACATTAAGCAGTGGCAGTTGCGTAACCTGCCCGCGCCt < 1:2043057/140‑1 (MQ=255)
cGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACATTAAGCAGTGGCAGTTGCGTAACCTGCCCGCGCCTGAt > 1:621625/1‑140 (MQ=255)
cGGGAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACATTAAGCAGTGGCAGTTGCGTAACCTGCCCGCGCCTGAt > 2:1728800/1‑140 (MQ=255)
gggAATTTCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACATTAAGCAGTGGCAGTTGCGTAACCTGCCCGCGCCTGATg > 1:47731/1‑140 (MQ=255)
ttCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACATTAAGCAGTGGCAGTTGCGTAACCTGCCCGCGCCTGATGCCGGGa < 1:1827164/140‑1 (MQ=255)
ttCTAAGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACATTAAGCAGTGGCAGTTGCGTAACCTGCCCGCGCCTGATGCCGGGa < 2:621625/140‑1 (MQ=255)
aaGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACATTAAGCAGTGGCAGTTGCGTAACCTGCCCGCGCCTGATGCCGGGACGCa < 1:1728800/140‑1 (MQ=255)
aaGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACATTAAGCAGTGGCAGTTGCGTAACCTGCCCGCGCCTGATGCCGGGACGCa < 2:1051240/140‑1 (MQ=255)
aaGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACATTAAGCAGTGGCAGTTGCGTAACCTGCCCGCGCCTGATGCCGGGACGCa < 1:534694/140‑1 (MQ=255)
aaGCATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACATTAAGCAGTGGCAGTTGCGTAACCTGCCCGCGCCTGATGCCGGGACGCa < 1:854906/140‑1 (MQ=255)
|
ATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGTAGTTTCATTGCTGACTTTAAGCATTTCAAACCAGGGGACACCGTACCAGAAATGTACCGTACCGATGAGTACAACATTAAGCAGTGGCAGTTGCGTAACCTGCCCGCGCCTGATGCCGGGACGCA > NC_000913/2186933‑2187204
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
