Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F28 I1 R1
|
258 |
142.3 |
4824480 |
99.1% |
4781059 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,405,651 |
(C)5→6 |
intergenic (‑579/+52) |
nuoA ← / ← lrhA |
NADH:quinone oxidoreductase subunit A/DNA‑binding transcriptional dual regulator LrhA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,405,646 | 1 | . | C | 100.0%
| 289.3
/ NA
| 81 | intergenic (‑574/+57) | nuoA/lrhA | NADH:quinone oxidoreductase subunit A/DNA‑binding transcriptional dual regulator LrhA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base C (30/51); total (30/51) |
CAGGTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACA‑CCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACATTGGGCTGTATTGCCACGGATTA > NC_000913/2405511‑2405778
|
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cAGGTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACA‑cccc > 1:1426459/1‑140 (MQ=255)
ggTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACA‑cccccc > 2:42909/1‑139 (MQ=255)
ggTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACA‑cccccc > 2:490952/1‑139 (MQ=255)
ggTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACA‑cccccc > 2:546027/1‑139 (MQ=255)
ggTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACA‑cccccc > 1:348252/1‑139 (MQ=255)
ggTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACA‑cccccc > 2:1304061/1‑139 (MQ=255)
ggTGATTTTTTTCAGGAGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACA‑cccccc > 1:1708601/1‑139 (MQ=255)
ggTGATTTTTTTAAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACA‑cccccc > 2:1662495/1‑139 (MQ=255)
gTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACA‑cccccca > 2:236317/1‑138 (MQ=255)
gTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACA‑cccccca > 1:2180565/1‑138 (MQ=255)
gTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACA‑cccccca > 1:1626534/1‑138 (MQ=255)
gTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACA‑cccccca > 1:1579454/1‑138 (MQ=255)
gTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACA‑cccccca > 2:1192430/1‑138 (MQ=255)
gTGATTTTTTTCAGGCGAGTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACA‑cccccca > 1:1635719/1‑138 (MQ=255)
ttttttCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGc < 1:258563/140‑1 (MQ=255)
ttttCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTc < 2:1477108/140‑1 (MQ=255)
ttttCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTc < 2:1953187/140‑1 (MQ=255)
ttttCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTc < 2:1564855/140‑1 (MQ=255)
cGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGCTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCCGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTa < 2:1919118/140‑1 (MQ=255)
gATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTac < 1:1341966/140‑1 (MQ=255)
attattTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTaca < 2:1369907/140‑1 (MQ=255)
tgCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTc < 1:365788/122‑1 (MQ=255)
tgCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTc > 2:365788/1‑122 (MQ=255)
gCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑tct < 1:72636/140‑1 (MQ=255)
gCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTAGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑tct < 1:883830/140‑1 (MQ=255)
cGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑tctc > 1:1994917/1‑140 (MQ=255)
cGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑tctc > 1:1360355/1‑140 (MQ=255)
cGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑tctc > 2:1813763/1‑140 (MQ=255)
gTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCa > 1:1499612/1‑140 (MQ=255)
gTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCa > 2:1447867/1‑140 (MQ=255)
ttCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAg > 1:1487320/1‑140 (MQ=255)
cGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGa < 2:2157567/140‑1 (MQ=255)
cGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGa > 2:1804518/1‑140 (MQ=255)
cGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGa < 1:643140/140‑1 (MQ=255)
aaTCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATtatctat > 1:2351809/1‑140 (MQ=255)
gtTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGAt < 2:1579454/140‑1 (MQ=255)
gtTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGAt > 1:319360/1‑140 (MQ=255)
gtTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCATCCGTCGAt > 1:2294167/1‑140 (MQ=255)
ttGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGAtt < 2:1487320/140‑1 (MQ=255)
ttGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGAtt < 1:490952/140‑1 (MQ=255)
ttGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGAtt > 2:1506264/1‑140 (MQ=255)
ttGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGAtt > 1:1817535/1‑140 (MQ=255)
ttGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTAAGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGAtt < 2:1986602/140‑1 (MQ=255)
tGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTa < 2:1360355/140‑1 (MQ=255)
tGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTa > 1:369645/1‑140 (MQ=255)
gAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATcgtccg > 1:297310/1‑132 (MQ=255)
gAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATcgtccg < 2:297310/132‑1 (MQ=255)
gAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATACGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTa > 2:1514954/1‑139 (MQ=255)
gAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATACGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTa < 1:1514954/139‑1 (MQ=255)
aaaaTGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTAc > 2:2225799/1‑138 (MQ=255)
aaaaTGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTAc < 1:2225799/138‑1 (MQ=255)
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cAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATccc < 2:1994917/140‑1 (MQ=255)
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gTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtcaat < 2:308913/140‑1 (MQ=255)
gTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtcaat < 1:301965/140‑1 (MQ=255)
gTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtcaat < 1:2044101/140‑1 (MQ=255)
tACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtcaatc > 1:280027/1‑140 (MQ=255)
tACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtcaatc < 2:1817535/140‑1 (MQ=255)
ttCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATcaaca < 2:1641248/140‑1 (MQ=255)
tCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATcaacaa > 2:566566/1‑140 (MQ=255)
cTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGaa < 2:1635719/140‑1 (MQ=255)
cTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAatc < 1:1357489/140‑1 (MQ=255)
tATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAatca < 1:1304061/140‑1 (MQ=255)
tGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAatcatc < 1:473131/140‑1 (MQ=255)
tGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAatcatc > 2:45907/1‑140 (MQ=255)
gCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATcc < 1:223866/140‑1 (MQ=255)
gATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTATTCGATATCCCTTtcaat > 2:1128706/1‑122 (MQ=255)
gATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtcaat < 1:1128706/122‑1 (MQ=255)
gATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATcccc < 1:2052976/140‑1 (MQ=255)
tGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCATCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCtt > 2:361147/1‑140 (MQ=255)
aaGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTcc < 1:1804518/140‑1 (MQ=255)
aGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCg > 1:497769/1‑140 (MQ=255)
aGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCg > 2:1939758/1‑140 (MQ=255)
aGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCg < 1:236317/140‑1 (MQ=255)
gATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGa > 2:2189966/1‑140 (MQ=255)
gATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGa > 2:996374/1‑140 (MQ=255)
gATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGa > 1:1788838/1‑140 (MQ=255)
tttttACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGc < 1:1662495/140‑1 (MQ=255)
tttttACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGc < 2:2297586/140‑1 (MQ=255)
ttACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGa > 1:262983/1‑140 (MQ=255)
aCTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACa < 2:1607137/140‑1 (MQ=255)
aCTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACa < 1:1133651/140‑1 (MQ=255)
aCTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCAACCCCTTCCGGAGCAGACa < 2:1232994/140‑1 (MQ=255)
aCTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCATCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACa < 1:361147/140‑1 (MQ=255)
tAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACAtt > 1:1366239/1‑140 (MQ=255)
aaaaaaGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACATTggg < 2:280027/140‑1 (MQ=255)
aaaaaaGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACATTggg < 2:348252/140‑1 (MQ=255)
aaaaaaGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACATTggg < 2:1359834/140‑1 (MQ=255)
cTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACATTGGGCTGTATTGcc < 1:2189966/140‑1 (MQ=255)
cTGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACATTGGGCTGTATTGcc < 1:1813763/140‑1 (MQ=255)
tGGGGTTTAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACATTGGGCTGTATTGCCa < 2:1788838/140‑1 (MQ=255)
tttAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACATTGGGCTGTATTGCCACGGAt < 2:1037398/140‑1 (MQ=255)
tttAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACATTGGGCTGTATTGCCACGGAt < 2:262983/140‑1 (MQ=255)
tAAAACACCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACATTGGGCTGTATTGCCACGGATTa > 1:13878/1‑140 (MQ=255)
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CAGGTGATTTTTTTCAGGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACA‑CCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTG‑‑TCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACATTGGGCTGTATTGCCACGGATTA > NC_000913/2405511‑2405778
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
