Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F28 I1 R1
|
258 |
142.3 |
4824480 |
99.1% |
4781059 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,710,553 |
C→T |
S45L (TCA→TTA) |
nadB → |
L‑aspartate oxidase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,710,553 | 0 | C | T | 100.0%
| 572.9
/ NA
| 161 | S45L (TCA→TTA) | nadB | L‑aspartate oxidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (80/81); total (80/81) |
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
TACTCTCCCTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTCAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAATTTGTCGCCAGCAATGCA > NC_000913/2710425‑2710689
|
tACTCTCCCTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATg > 2:1238393/1‑140 (MQ=255)
ctctCCCTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACAtttt < 2:1605080/135‑1 (MQ=255)
ctctCCCTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACAtttt > 1:1605080/1‑135 (MQ=255)
ctctCCCTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGcc > 1:251517/1‑140 (MQ=255)
ctctCCCTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGcc < 1:270703/140‑1 (MQ=255)
ctctCCCTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGcc > 1:2227132/1‑140 (MQ=255)
tcCCTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGcc > 1:1276389/1‑137 (MQ=255)
tcCCTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAg > 2:2191770/1‑140 (MQ=255)
tcCCTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAg > 2:2324186/1‑140 (MQ=255)
tcCCTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAg > 2:2330663/1‑140 (MQ=255)
tcCCTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAg > 1:1507933/1‑140 (MQ=255)
cccTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGcc > 1:847082/1‑136 (MQ=255)
cccTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGcc < 2:847082/136‑1 (MQ=255)
ccTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAggg > 2:2026893/1‑140 (MQ=255)
cTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTTACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGc > 2:1395947/1‑140 (MQ=255)
cTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGGCCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGc < 2:1579254/140‑1 (MQ=255)
cTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGc < 1:1477145/140‑1 (MQ=255)
cTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGc < 1:437545/140‑1 (MQ=255)
cTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGc > 2:1782890/1‑140 (MQ=255)
aaCATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGt > 2:1852656/1‑140 (MQ=255)
aCATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTa < 2:147683/140‑1 (MQ=255)
ttCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCGTCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTg > 1:1609137/1‑140 (MQ=255)
ttCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTg > 1:1736443/1‑140 (MQ=255)
ttCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTg > 2:2040616/1‑140 (MQ=255)
ttCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTg > 2:2253657/1‑140 (MQ=255)
tCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTgc > 2:2069291/1‑140 (MQ=255)
tCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTgc > 1:2189617/1‑140 (MQ=255)
cATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTgcc > 2:288513/1‑140 (MQ=255)
cATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTgcc > 1:1376902/1‑140 (MQ=255)
cATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTgcc > 2:240598/1‑140 (MQ=255)
tgtgACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTgccgc > 1:634798/1‑140 (MQ=255)
tgACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGccgccg > 2:1019952/1‑140 (MQ=255)
cGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCgtgt > 2:58502/1‑140 (MQ=255)
tgtTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGttt > 2:1067762/1‑140 (MQ=255)
gATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTtgat < 1:311728/139‑1 (MQ=255)
ttATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGaa < 1:1353045/140‑1 (MQ=255)
tCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACt > 1:1106718/1‑140 (MQ=255)
cGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTg > 1:1930736/1‑140 (MQ=255)
ggTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGa < 2:1192883/140‑1 (MQ=255)
ggTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGa < 1:2352399/140‑1 (MQ=255)
ggTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGa < 2:886965/140‑1 (MQ=255)
ggTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGa < 1:1783841/140‑1 (MQ=255)
ggTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCCACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGa < 1:900954/140‑1 (MQ=255)
gcggcgCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTAATGAAACTGACAGc > 1:1574384/1‑140 (MQ=255)
cggcgCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCa < 2:1952852/140‑1 (MQ=255)
cggcgCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCa > 2:333844/1‑140 (MQ=255)
cgcAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTg > 2:2236856/1‑140 (MQ=255)
cGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCGTCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGc < 2:1609137/140‑1 (MQ=255)
cGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGc < 2:2227132/140‑1 (MQ=255)
cGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGc < 1:153310/140‑1 (MQ=255)
gACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCAt < 1:2026893/140‑1 (MQ=255)
aCTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCAtg < 1:2324186/140‑1 (MQ=255)
aCTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCAtg < 2:217094/140‑1 (MQ=255)
aCTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCAtg < 1:2237768/140‑1 (MQ=255)
tCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGa < 1:2069291/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGa < 2:634798/140‑1 (MQ=255)
gcgcCACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGacac > 1:1071640/1‑140 (MQ=255)
cgcTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGAcaca > 1:16553/1‑140 (MQ=255)
gcTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACat > 1:1853691/1‑140 (MQ=255)
cGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACattgat > 1:1958821/1‑140 (MQ=255)
cTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGc < 1:1290985/140‑1 (MQ=255)
cTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGc < 2:1930736/140‑1 (MQ=255)
ggCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCg > 1:1998135/1‑140 (MQ=255)
gCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCgg > 2:2371471/1‑140 (MQ=255)
tGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCgggg < 1:1019952/140‑1 (MQ=255)
gACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGc < 1:679960/140‑1 (MQ=255)
gACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGc < 2:16553/140‑1 (MQ=255)
aCCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCggggtt < 2:251517/140‑3 (MQ=255)
aCCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCt > 1:417909/1‑140 (MQ=255)
cATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTAt > 1:2150936/1‑140 (MQ=255)
aGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGc < 2:901592/140‑1 (MQ=255)
gTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGa > 2:1310797/1‑140 (MQ=255)
tCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGAt < 1:1195272/140‑1 (MQ=255)
tCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGAt < 1:925863/140‑1 (MQ=255)
aTCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCg > 2:1448498/1‑140 (MQ=255)
tCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCt < 2:1316498/125‑1 (MQ=255)
tCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCt > 1:1316498/1‑125 (MQ=255)
tCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGGAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGc > 2:1709535/1‑140 (MQ=255)
cGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGcc < 2:1106718/140‑1 (MQ=255)
cGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTCTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGcc < 2:2094619/140‑1 (MQ=255)
gTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCa < 2:1998135/140‑1 (MQ=255)
gTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCa < 2:1071640/140‑1 (MQ=255)
gTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCa < 2:398268/140‑1 (MQ=255)
ttCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCAt < 2:793282/140‑1 (MQ=255)
aGTATAGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGt > 1:465648/1‑140 (MQ=255)
aaaGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGa > 1:2274329/1‑140 (MQ=255)
aGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAAt > 1:1874762/1‑140 (MQ=255)
aGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAAt > 1:2201955/1‑140 (MQ=255)
aGGCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACCCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAAt > 1:1077801/1‑140 (MQ=255)
gCCCGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCTGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAAttt > 1:1533973/1‑140 (MQ=255)
cGGTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAATTTGTc > 1:2174034/1‑140 (MQ=255)
gTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAATTTGTCGc > 1:569013/1‑140 (MQ=255)
gTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAATTTGTCGc < 1:834779/140‑1 (MQ=255)
gTAACGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTACCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAATTTGTCGc > 2:272005/1‑140 (MQ=255)
aCGGAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAATTTGTCGCCAg < 2:417909/140‑1 (MQ=255)
ggAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAATTTGTCGCCAGCa < 2:182511/140‑1 (MQ=255)
ggAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAATTTGTCGCCAGCa < 1:2371471/140‑1 (MQ=255)
ggAAGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAATTTGTCGCCAGCa < 2:2274329/140‑1 (MQ=255)
aaGGTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAATTTGTCGCCAGCAAt > 1:259662/1‑140 (MQ=255)
ggTTTAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAATTTGTCGCCAGCAATGc < 1:582508/140‑1 (MQ=255)
|
TACTCTCCCTGAACATTCATGTGACGTGTTGATTATCGGTAGCGGCGCAGCCGGACTTTCACTGGCGCTACGCCTGGCTGACCAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTCAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAATTTGTCGCCAGCAATGCA > NC_000913/2710425‑2710689
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
