Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F28 I1 R1
|
258 |
142.3 |
4824480 |
99.1% |
4781059 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,743,395 |
T→C |
V338A (GTA→GCA) |
dgcN → |
diguanylate cyclase DgcN |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,743,395 | 0 | T | C | 100.0%
| 589.1
/ NA
| 162 | V338A (GTA→GCA) | dgcN | diguanylate cyclase DgcN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (88/74); total (88/74) |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
CATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATTGGTTACGCGATGACCATTGAGCACGCCT > NC_000913/2743258‑2743529
|
cATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCAc > 1:1266508/1‑140 (MQ=255)
aCCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATc > 1:756049/1‑140 (MQ=255)
aCCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATc > 2:1468972/1‑140 (MQ=255)
ccTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCt > 2:371017/1‑140 (MQ=255)
ccTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCCGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCt > 2:1608237/1‑140 (MQ=255)
tGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGa > 2:1691361/1‑140 (MQ=255)
ggggTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGaa > 1:1215000/1‑140 (MQ=255)
ggggTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGaa > 2:1873896/1‑140 (MQ=255)
gggTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAg > 2:2322445/1‑140 (MQ=255)
ggTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCTCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGt > 1:1557056/1‑140 (MQ=255)
ggTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGGTGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAg < 2:32109/139‑1 (MQ=255)
ggTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGGTGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAg > 1:32109/1‑139 (MQ=255)
ggTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGt > 1:1864434/1‑140 (MQ=255)
ggTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGt > 2:1392350/1‑140 (MQ=255)
ggTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGt > 2:575294/1‑140 (MQ=255)
ggTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGt > 1:164994/1‑140 (MQ=255)
gTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTg < 1:1290204/140‑1 (MQ=255)
tCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTgc > 1:2002401/1‑140 (MQ=255)
aTGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTgcag > 2:1922880/1‑140 (MQ=255)
tGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTgcagc > 1:1467317/1‑140 (MQ=255)
tGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTgcagc > 1:2287525/1‑140 (MQ=255)
tGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTgcagc > 1:1050772/1‑140 (MQ=255)
tGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTgcagc > 1:788569/1‑140 (MQ=255)
tGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTgcag > 2:1181872/1‑139 (MQ=255)
aCGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGTTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGat < 1:2217622/140‑1 (MQ=255)
aCGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGat < 2:788569/140‑1 (MQ=255)
aCGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGat < 2:1435123/140‑1 (MQ=255)
aCGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGat > 2:218969/1‑140 (MQ=255)
aCGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGat < 2:1050772/140‑1 (MQ=255)
aCGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGat < 1:371017/140‑1 (MQ=255)
aCGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGat < 1:1076604/140‑1 (MQ=255)
cGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGata < 1:1875831/140‑1 (MQ=255)
cGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGat > 1:1097468/1‑135 (MQ=255)
tCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTgcag > 2:1252537/1‑122 (MQ=255)
tCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTg > 1:662318/1‑140 (MQ=255)
tCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTg > 1:1430764/1‑140 (MQ=255)
tCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTg > 1:1384969/1‑140 (MQ=255)
cTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGtt > 1:633642/1‑131 (MQ=255)
ttgattgaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGac > 2:2234158/1‑140 (MQ=255)
attgaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGat > 2:1879083/1‑122 (MQ=255)
attgaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGAcaca < 2:98874/140‑1 (MQ=255)
attgaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGAcaca > 2:2036952/1‑140 (MQ=255)
gaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAAt > 2:1662250/1‑140 (MQ=255)
gaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAAt < 2:2345072/140‑1 (MQ=255)
tCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCttt < 2:872035/140‑1 (MQ=255)
tCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCttt > 2:1771859/1‑140 (MQ=255)
cAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAAt > 2:441615/1‑140 (MQ=255)
aaaCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAAtct < 1:793472/140‑1 (MQ=255)
aaaCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAAtct < 1:299313/140‑1 (MQ=255)
cGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTTACACAAATCTTTAATCTccc < 2:2287525/140‑1 (MQ=255)
tAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCTCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGttt < 2:1557056/140‑1 (MQ=255)
aGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTg > 2:682295/1‑140 (MQ=255)
cTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGAt < 2:1384969/140‑1 (MQ=255)
cTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGAt < 2:662318/140‑1 (MQ=255)
cTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGAt < 2:632295/140‑1 (MQ=255)
cTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGAt < 1:2364186/140‑1 (MQ=255)
ttGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCAt > 2:1296702/1‑140 (MQ=255)
gCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAAt < 2:1282572/140‑1 (MQ=255)
cGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATg > 1:18119/1‑140 (MQ=255)
cATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGac < 1:682295/140‑1 (MQ=255)
cATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGac < 1:718430/140‑1 (MQ=255)
aaaGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCa < 1:1773298/134‑1 (MQ=255)
aGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGAccacca > 1:278200/1‑140 (MQ=255)
aGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGAccacca < 2:18119/140‑1 (MQ=255)
aGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGAccacca < 2:311605/140‑1 (MQ=255)
aGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGAccacca < 1:1468972/140‑1 (MQ=255)
cATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATg < 2:2395461/140‑1 (MQ=255)
aCCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGc < 2:1960717/122‑1 (MQ=255)
aCCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGc > 1:1960717/1‑122 (MQ=255)
aCCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACa > 1:87739/1‑140 (MQ=255)
ccGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACAt < 1:908753/140‑1 (MQ=255)
cGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACAtt < 2:1430764/140‑1 (MQ=255)
gCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTa > 1:591069/1‑140 (MQ=255)
ccTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGac > 1:1015714/1‑126 (MQ=255)
ccTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGac < 2:1015714/126‑1 (MQ=255)
cTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGac > 1:2055795/1‑125 (MQ=255)
cTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGac < 2:2055795/125‑1 (MQ=255)
gggCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGAccacca > 2:1034179/1‑128 (MQ=255)
gggCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGAccacca < 1:1034179/128‑1 (MQ=255)
gggCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCa > 2:180288/1‑140 (MQ=255)
gggCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCa < 1:844593/140‑1 (MQ=255)
gggCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCa < 2:1084066/140‑1 (MQ=255)
ggcggcGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCAt < 2:1462060/140‑1 (MQ=255)
gcgATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATTGGt > 1:133371/1‑140 (MQ=255)
gcgATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATTGGt < 1:1296702/140‑1 (MQ=255)
cgATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATTGGtt < 1:1873896/140‑1 (MQ=255)
aTGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATTGGTTAc < 2:87739/140‑1 (MQ=255)
gAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATTGGTTAcgc < 2:1215000/140‑1 (MQ=255)
gAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATTGGTTAcgc < 1:1662250/140‑1 (MQ=255)
ttCGCTATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATTGGTTACGCGAt < 1:1202888/140‑1 (MQ=255)
tATGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATTGGTTACGCGATGACCa < 2:1266508/140‑1 (MQ=255)
tGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATTGGTTACGCGATGACCAtt < 2:1118629/140‑1 (MQ=255)
tGGTGCTCTATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATTGGTTACGCGATGACCAtt < 1:1450457/140‑1 (MQ=255)
ctctATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATTGGTTACGCGATGACCa < 1:415750/133‑1 (MQ=255)
tctATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATTGGTTACGCGATGACCATTGAGCAc > 2:1009134/1‑140 (MQ=255)
tATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATTGGTTACGCGATGACCa < 2:808599/130‑1 (MQ=255)
tATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATTGGTTACGCGATGACCATTGAGCACGc > 2:634341/1‑140 (MQ=255)
tATGATGCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATTGGTTACGCGATGACCATTGAGCACGc > 1:189929/1‑140 (MQ=255)
tgatgCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATTGGTTACGCGATGACCATTGAGCACGCct > 2:794766/1‑140 (MQ=255)
tgatgCACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATTGGTTACGCGATGACCATTGAGCACGCct > 1:979848/1‑140 (MQ=255)
|
CATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATTGGTTACGCGATGACCATTGAGCACGCCT > NC_000913/2743258‑2743529
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
