Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F28 I1 R1
|
258 |
142.3 |
4824480 |
99.1% |
4781059 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,764,948 |
Δ1 bp |
coding (206/1617 nt) |
abpA ← |
CP4‑57 prophage; anti‑bacteriophage protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,764,946 | 0 | A | . | 99.4%
| 724.3
/ ‑2.6
| 170 | coding (208/1617 nt) | abpA | CP4‑57 prophage; anti‑bacteriophage protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base . (88/81); minor base T (1/0); total (89/81) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.43e-01 |
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
TTGTTGACCTTTTCCTCTGTGACGATGGAGTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCGAAATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGCGGATAGTCTTGTCACGAAGCATTCGGGTGACAT > NC_000913/2764807‑2765080
|
ttgttgACCTTTTCCTCTGTGACGATGGAGTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCGa > 1:1256001/1‑140 (MQ=255)
ttgttgACCTTTTCCTCTGTGACGATGGAGTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCGa > 2:2374473/1‑140 (MQ=255)
ccTTTTCCTCTGTGACGATGGAGTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTcc < 1:1191024/140‑1 (MQ=255)
ccTTTTCCTCTGTGACGATGGAGTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTcc > 1:335236/1‑140 (MQ=255)
ttCCTCTGTGACGATGGAGTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCGaa < 1:269172/130‑1 (MQ=255)
ttCCTCTGTGACGATGGAGTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCGaa > 2:269172/1‑130 (MQ=255)
ttCCTCTGTGACGATGGAGTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACg > 1:506429/1‑140 (MQ=255)
tgcgACGATGGAGTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGtttt > 2:1438116/4‑140 (MQ=255)
tgACGATGGAGTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGc < 2:540978/140‑1 (MQ=255)
aCGATGGAGTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTTCAACGTGTTTTGCCg > 1:2229240/1‑140 (MQ=255)
cGATGGAGTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCgg < 2:989795/140‑1 (MQ=255)
cGATGGAGTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCgg < 2:209125/140‑1 (MQ=255)
cGATGGAGTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCgg < 2:247628/140‑1 (MQ=255)
aTGGAGTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTg < 1:721278/140‑1 (MQ=255)
aTGGAGTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTg > 2:2030730/1‑140 (MQ=255)
aTGGAGTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTg > 1:1946864/1‑140 (MQ=255)
ggAGTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCt > 2:1441523/1‑140 (MQ=255)
gAGTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCtt > 1:670174/1‑140 (MQ=255)
gTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCgg < 2:671209/133‑1 (MQ=255)
gTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCgg > 1:671209/1‑133 (MQ=255)
ccTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCg > 2:1374791/1‑129 (MQ=255)
ccTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCg < 1:1374791/129‑1 (MQ=255)
ccTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTAc < 2:239220/140‑1 (MQ=255)
aCGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTg > 2:1971635/1‑140 (MQ=255)
aCGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTg > 2:1252815/1‑140 (MQ=255)
cGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGa < 2:1256001/140‑1 (MQ=255)
gTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGaa > 1:99056/1‑140 (MQ=255)
gTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGaa > 1:1860091/1‑140 (MQ=255)
ccAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACg < 2:1946864/140‑1 (MQ=255)
cAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGa > 1:355991/1‑140 (MQ=255)
cAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGa > 2:1630342/1‑140 (MQ=255)
aaGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGaa < 1:2165732/140‑1 (MQ=255)
aGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAg > 1:333373/1‑140 (MQ=255)
cAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑t < 2:506429/140‑1 (MQ=255)
aGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCg < 2:2076508/137‑1 (MQ=255)
gTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCg > 2:352356/1‑135 (MQ=255)
gTCAGACTCACACTGCATTGATTTATGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTa > 1:1158861/1‑140 (MQ=255)
tCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTAt < 1:2113223/140‑1 (MQ=255)
tCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTAt < 1:1624681/140‑1 (MQ=255)
tCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTAt < 2:839652/140‑1 (MQ=255)
tCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTAt < 1:1331881/140‑1 (MQ=255)
tCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTAt < 1:2344467/140‑1 (MQ=255)
gACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCa > 1:1948141/1‑140 (MQ=255)
gACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCa > 2:881326/1‑140 (MQ=255)
gACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCa < 1:737772/140‑1 (MQ=255)
aCTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCg < 1:1648790/130‑1 (MQ=255)
aCTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCAt < 2:1093665/140‑1 (MQ=255)
aCTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCAt > 2:793234/1‑140 (MQ=255)
acacTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGa < 2:767322/140‑1 (MQ=255)
cacTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGAt > 1:941450/1‑140 (MQ=255)
cacTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGAt > 2:634566/1‑140 (MQ=255)
cacTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGAt > 2:522570/1‑140 (MQ=255)
cacTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGAt > 2:501792/1‑140 (MQ=255)
acTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATa < 2:230339/140‑1 (MQ=255)
cTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCAG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATAc < 2:1761280/140‑1 (MQ=255)
gCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACaa < 2:1027404/140‑1 (MQ=255)
cATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAAt > 2:1185800/1‑140 (MQ=255)
cATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAAt > 1:2067039/1‑140 (MQ=255)
aTTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACaa > 1:1982399/1‑134 (MQ=255)
aTTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACaa < 2:1982399/134‑1 (MQ=255)
aTTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGa > 1:382994/1‑140 (MQ=255)
aTTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGa > 1:279580/1‑140 (MQ=255)
tttGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGat > 2:611430/1‑140 (MQ=255)
tgCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCg > 2:79184/1‑140 (MQ=255)
aaaTTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCtg < 2:941450/140‑1 (MQ=255)
aaTTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCtgt > 1:2283612/1‑140 (MQ=255)
aaTTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGAGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCtgt > 1:956819/1‑140 (MQ=255)
ttGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGa > 1:806914/1‑140 (MQ=255)
ttGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGa < 1:2403819/140‑1 (MQ=255)
gAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCATCTGTGAcc < 1:2325599/140‑1 (MQ=255)
cAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTc > 2:1976299/1‑127 (MQ=255)
ggggATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAgcg < 1:144127/140‑1 (MQ=255)
ggggATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAgcg > 1:927347/1‑140 (MQ=255)
ggggATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAgcg < 1:2393948/140‑1 (MQ=255)
ggggATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAgcg < 1:1971635/140‑1 (MQ=255)
aTCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGcaca < 1:522570/140‑1 (MQ=255)
aTCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGcaca < 1:793234/140‑1 (MQ=255)
tCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCacac < 1:501792/140‑1 (MQ=255)
tCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCacac < 1:540236/140‑1 (MQ=255)
cGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACt < 2:1860091/140‑1 (MQ=255)
tCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGc > 2:2281038/1‑140 (MQ=255)
tCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGc > 1:2295594/1‑140 (MQ=255)
ttttATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGCGGa < 2:982842/140‑1 (MQ=255)
ttttATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGCGGa < 1:1479705/140‑1 (MQ=255)
aGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGCGGATAGTCtt > 2:291638/1‑140 (MQ=255)
gCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGCGGa < 2:2168214/132‑1 (MQ=255)
cACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAGCGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGCGGATAGTCTTGt > 2:1080521/1‑140 (MQ=255)
tttGAATTCTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGCGGATAGTCTTGTCACGa > 1:2318599/1‑140 (MQ=255)
cTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGCGGATAGTCTTGTCACGAAGCATTCg < 1:109038/140‑1 (MQ=255)
cTGAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGCGGATAGTCTTGTCACGAAGCATTCg > 1:1712164/1‑140 (MQ=255)
gAACGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGCGGATAGTCTTGTCACGAAGCATTCggg > 2:2335390/1‑140 (MQ=255)
agcGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGCGGATAGTCTTGTCACGAAGCATTCGGGt > 2:1477390/3‑140 (MQ=255)
aaCGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGCGGATAGTCTTGTCACGAAGCATTCGGGt > 1:862775/1‑140 (MQ=255)
aaCGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGCGGATAGTCTTGTCACGAAGCATTCGGGt > 2:872642/1‑140 (MQ=255)
aaCGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGCGGATAGTCTTGTCACGAAGCATTCGGGt > 1:2031348/1‑140 (MQ=255)
cGATGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGCGGATAGTCTTGTCACGAAGCATTCGGGTGa < 2:2295594/140‑1 (MQ=255)
tGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGCGGATAGTCTTGTCACGAAGCATTCGGGTGACAt > 2:1650784/1‑140 (MQ=255)
tGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGCGGATAGTCTTGTCACGAAGCATTCGGGTGACAt > 1:855686/1‑140 (MQ=255)
tGTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGCGGATAGTCTTGTCACGAAGCATTCGGGTGACAt > 1:2245949/1‑140 (MQ=255)
gTCCG‑AATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGATGTGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGCGGATAGTCTTGTCACGAAGCATTCGGGTGACa > 1:2383761/1‑140 (MQ=255)
|
TTGTTGACCTTTTCCTCTGTGACGATGGAGTACCTACGTCCAAGGGACAGGTCAGACTCACACTGCATTGATTTGTGCAAAATTGAACTGCAGGGGATCGTCTTTTTATCAGCACCTTTTGAATTCTGAACGATGTCCGAAATGTTCCAACGTGTTTTGCCGGTGCTTTTTACCTGAACGAAGTCGA‑‑TGTATCCATCAGATACAATGTCGATATCGTCTGTGACCTCGCAGCGCACACTGCGGATAGTCTTGTCACGAAGCATTCGGGTGACAT > NC_000913/2764807‑2765080
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
