Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F28 I1 R1
|
258 |
142.3 |
4824480 |
99.1% |
4781059 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,805,736 |
C→T |
R308C (CGC→TGC) |
proV → |
glycine betaine ABC transporter ATP binding subunit ProV |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,805,736 | 0 | C | T | 99.2%
| 465.6
/ ‑6.2
| 132 | R308C (CGC→TGC) | proV | glycine betaine ABC transporter ATP binding subunit ProV |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (62/69); total (63/69) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
TACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCA > NC_000913/2805600‑2805870
|
tACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATtgcg > 2:1187506/1‑140 (MQ=255)
tACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATtgcg > 1:1869291/1‑140 (MQ=255)
aCCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGa > 1:35053/1‑140 (MQ=255)
ccTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGaa < 2:1822818/140‑1 (MQ=255)
tcttcCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAatat > 1:695720/1‑140 (MQ=255)
cttcCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATg > 1:1061999/1‑140 (MQ=255)
cttcCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATg > 2:1688087/1‑140 (MQ=255)
ttcCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATgg < 1:1401548/140‑1 (MQ=255)
ttgCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCACGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACg < 2:2228285/138‑1 (MQ=255)
tGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACg > 1:102959/1‑140 (MQ=255)
tGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACg > 1:803009/1‑140 (MQ=255)
tGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACg > 1:2253155/1‑140 (MQ=255)
ggCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGt > 1:898474/1‑140 (MQ=255)
cGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAatat < 2:439182/130‑1 (MQ=255)
gTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTAt < 2:898474/140‑1 (MQ=255)
ttGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATc > 2:1861927/1‑140 (MQ=255)
ttGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATc > 2:1224681/1‑140 (MQ=255)
ttGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATc > 2:110479/1‑140 (MQ=255)
tGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCg < 1:1949241/140‑1 (MQ=255)
atatTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGaa < 2:255152/140‑1 (MQ=255)
tatTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAAc < 1:815340/140‑1 (MQ=255)
tatTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAAc < 2:102959/140‑1 (MQ=255)
tatTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAAc < 1:1976608/140‑1 (MQ=255)
tatTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAAc < 2:1382616/140‑1 (MQ=255)
atTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAAcg < 1:1126216/140‑1 (MQ=255)
atTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAAcg < 1:729221/140‑1 (MQ=255)
atTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAAcg < 2:589667/140‑1 (MQ=255)
atTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAAcg < 1:852107/140‑1 (MQ=255)
ttAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAAcgc < 1:1775478/140‑1 (MQ=255)
ttAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAAcgc < 2:2092226/140‑1 (MQ=255)
aGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCgg > 2:1586766/1‑140 (MQ=255)
tCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAAcg < 2:191012/135‑1 (MQ=255)
tCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAAcg > 1:191012/1‑135 (MQ=255)
tCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGta < 2:1061999/140‑1 (MQ=255)
tCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGta < 1:2160094/140‑1 (MQ=255)
ggTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGtaata > 1:107015/1‑140 (MQ=255)
gTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGtaataa > 2:1389617/1‑140 (MQ=255)
ttCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGtt > 2:2325828/1‑140 (MQ=255)
aGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGt < 2:1869291/140‑1 (MQ=255)
tGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCg > 2:1296962/1‑140 (MQ=255)
tGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCg > 2:469903/1‑140 (MQ=255)
cGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGt < 1:1915683/136‑1 (MQ=255)
cGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGt > 2:1915683/1‑136 (MQ=255)
cGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGgc > 1:1671886/1‑140 (MQ=255)
cGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGgc > 1:2334660/1‑140 (MQ=255)
gAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGgcg < 2:116630/140‑1 (MQ=255)
gAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGgcg < 2:35053/140‑1 (MQ=255)
gAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGgcg < 2:1700898/140‑1 (MQ=255)
gAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGgcg < 2:1228179/140‑1 (MQ=255)
atTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGtctc > 2:384926/1‑140 (MQ=255)
cccGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGgcg > 2:351527/1‑129 (MQ=255)
cccGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGgcg < 1:351527/129‑1 (MQ=255)
gccgGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGAt > 1:1303021/1‑140 (MQ=255)
ccgGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGAtt > 1:773617/1‑140 (MQ=255)
ccgGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGAtt > 1:2093479/1‑140 (MQ=255)
ccgGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGAtt > 1:1481821/1‑140 (MQ=255)
ccgGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGAtt > 2:577975/1‑140 (MQ=255)
ccgGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGAtt < 2:803009/140‑1 (MQ=255)
ccgGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGAt > 1:2010042/1‑139 (MQ=255)
aaTTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTaa < 2:695720/140‑1 (MQ=255)
aaTTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTaa < 2:2140706/140‑1 (MQ=255)
ttCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACg < 2:2093479/140‑1 (MQ=255)
tCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACgc < 1:2075448/140‑1 (MQ=255)
cGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGACGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACgca < 2:2097213/140‑1 (MQ=255)
gTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACgcag < 1:339204/140‑1 (MQ=255)
tAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACgcagc > 2:1648346/1‑140 (MQ=255)
tAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACgcagc > 2:2029124/1‑140 (MQ=255)
tAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACgcagc > 1:1717816/1‑140 (MQ=255)
aaaaCCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACgcagca > 1:658940/1‑140 (MQ=255)
aCCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACgcagcagca < 1:2325828/140‑1 (MQ=255)
aCCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACgcagcagca < 2:2071811/140‑1 (MQ=255)
aCCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACgcagcagca < 1:1648346/140‑1 (MQ=255)
aCCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACgcagcagca < 1:1369526/140‑1 (MQ=255)
ccccTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCaa < 1:1193317/140‑1 (MQ=255)
ggCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATg < 2:2330748/139‑1 (MQ=255)
ggCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATg > 1:2330748/1‑139 (MQ=255)
ggCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGGTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATgc > 1:715313/1‑140 (MQ=255)
cACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATgcggcg < 2:1148923/140‑1 (MQ=255)
aCGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGgcgc > 2:1961135/1‑140 (MQ=255)
aCGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGgcgc > 1:1141190/1‑140 (MQ=255)
cACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCtgattgat < 1:384926/140‑1 (MQ=255)
aCTGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATg < 1:525679/140‑1 (MQ=255)
tGAAATTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATgcg < 1:1477869/140‑1 (MQ=255)
aaaTTATTGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGcc > 2:1411118/1‑140 (MQ=255)
ttcttGCAGGATGATGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGtt > 2:203577/4‑140 (MQ=255)
attGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAg > 1:448918/1‑140 (MQ=255)
ttGCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGc < 1:39980/140‑1 (MQ=255)
gCAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAg > 2:1911017/1‑140 (MQ=255)
cAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGt < 1:1128844/140‑1 (MQ=255)
cAGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGt < 2:2334660/140‑1 (MQ=255)
aGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTc > 2:299886/1‑140 (MQ=255)
aGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTc > 2:1994400/1‑140 (MQ=255)
aGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTc > 2:1588648/1‑140 (MQ=255)
aGGATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTc > 2:520659/1‑140 (MQ=255)
ggATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCg < 1:469903/140‑1 (MQ=255)
gATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGa > 1:678747/1‑140 (MQ=255)
gATGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGa < 1:1994400/140‑1 (MQ=255)
aTGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGAt < 1:2252452/140‑1 (MQ=255)
tGAAGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGATTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGGGCCGTTAGCAGTCGATg > 2:2146385/1‑140 (MQ=255)
aaGATTGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGca > 1:385409/1‑140 (MQ=255)
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TACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCA > NC_000913/2805600‑2805870
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
