Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F28 I1 R1
|
258 |
142.3 |
4824480 |
99.1% |
4781059 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,337,816 |
T→C |
N26D (AAT→GAT) |
mlaC ← |
intermembrane phospholipid transport system ‑ periplasmic binding protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,337,816 | 0 | T | C | 99.5%
| 699.0
/ ‑5.8
| 193 | N26D (AAT→GAT) | mlaC | intermembrane phospholipid transport system ‑ periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (101/91); total (102/91) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
TTCACCTGTACGTATGGCAGCAGTTCCTGATCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATTGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCCACAGGTTCAGTGGTTTCATTATTACC > NC_000913/3337680‑3337951
|
ttCACCTGTACGTATGGCAGCAGTTCCTGATCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATcggt < 1:1535466/140‑1 (MQ=255)
ccTGTACGTATGGCAGCAGTTCCTGATCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATcggtctgg > 1:1142447/1‑140 (MQ=255)
cTGTACGTATGGCAGCAGTTCCTGATCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATcggtctggt < 1:147118/140‑1 (MQ=255)
gTACGTATGGCAGCAGTTCCTGATCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCggtctggtct > 1:1268676/1‑140 (MQ=255)
tACGTATGGCAGCAGTTCCTGATCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGgtctggtctg > 1:2045305/1‑140 (MQ=255)
tACGTATGGCAGCAGTTCCTGATCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGgtctggtctg > 2:151339/1‑140 (MQ=255)
aCGTATGGCAGCAGTTCCTGATCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGc < 2:1874013/140‑1 (MQ=255)
cGTATGGCAGCAGTTCCTGATCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGcc < 2:76738/140‑1 (MQ=255)
aTGGCAGCAGTTCCTGATCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCcgcg > 2:2030568/1‑140 (MQ=255)
tGGCAGCAGTTCCTGATCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCgg < 1:1393938/140‑1 (MQ=255)
ggCAGCAGTTCCTGATCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGt > 1:235232/1‑140 (MQ=255)
ggCAGCAGTTCCTGATCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGt > 2:1606588/1‑140 (MQ=255)
cagcagTTCCTGATCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTg < 2:245228/140‑1 (MQ=255)
cagcagTTCCTGATCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTg < 1:1868197/140‑1 (MQ=255)
cagcagTTCCTGATCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTg < 2:222955/140‑1 (MQ=255)
agcagTTCCTGATCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGc > 2:1961173/1‑140 (MQ=255)
ttCCTGATCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCG‑CCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACt < 2:2005592/140‑1 (MQ=255)
tGATCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCag < 1:1961173/140‑1 (MQ=255)
aTCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGACCGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCagag < 2:1676222/140‑1 (MQ=255)
tCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCTCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGc > 2:2400184/1‑128 (MQ=255)
acaaTGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCa > 2:325506/1‑133 (MQ=255)
acaaTGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCa < 1:325506/133‑1 (MQ=255)
acaaTGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGc > 1:1849790/1‑140 (MQ=255)
acaaTGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGc > 1:1628034/1‑140 (MQ=255)
acaaTGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGc > 1:2386935/1‑140 (MQ=255)
caaTGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCa < 2:229972/140‑1 (MQ=255)
aTGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAAt > 2:1703567/1‑140 (MQ=255)
gTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCAc > 1:132328/1‑140 (MQ=255)
tACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCAcc > 2:998940/1‑140 (MQ=255)
aCGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCa < 1:998940/140‑1 (MQ=255)
aCGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCa > 2:2410304/1‑140 (MQ=255)
aCGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCa < 2:1930964/140‑1 (MQ=255)
cGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAg > 1:1895389/1‑140 (MQ=255)
cAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCag < 1:1792417/123‑1 (MQ=255)
cAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCa > 2:946626/1‑140 (MQ=255)
cAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCa > 2:1292303/1‑140 (MQ=255)
cAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCa > 2:660649/1‑140 (MQ=255)
aGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCaa > 2:1404043/1‑140 (MQ=255)
aTAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAg > 2:1152296/1‑140 (MQ=255)
aTCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGa > 1:2186618/1‑140 (MQ=255)
ccGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGAcc < 1:1748310/140‑1 (MQ=255)
cGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACca < 1:151339/140‑1 (MQ=255)
ggTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTTATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACcatc > 1:1272968/1‑140 (MQ=255)
ggTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACcatc > 2:398941/1‑140 (MQ=255)
ggTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACcatc > 2:356854/1‑140 (MQ=255)
ggTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACcatc > 1:563675/1‑140 (MQ=255)
ttGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAg < 2:422421/130‑1 (MQ=255)
ggCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTa > 1:138597/1‑140 (MQ=255)
ggCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTa < 2:138597/140‑1 (MQ=255)
ggCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTa < 1:2261030/140‑1 (MQ=255)
gCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTaa < 2:1582718/140‑1 (MQ=255)
gCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTaa < 2:2186618/140‑1 (MQ=255)
aaTTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGtt > 1:420520/1‑140 (MQ=255)
aaTTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGtt < 1:1690714/140‑1 (MQ=255)
aaTTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGtt > 1:437794/1‑140 (MQ=255)
aTTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGttt > 1:460488/1‑140 (MQ=255)
tGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCg > 2:964197/1‑140 (MQ=255)
gCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTaa < 2:176519/124‑1 (MQ=255)
gCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGt < 1:1606588/140‑1 (MQ=255)
aGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGt < 2:731627/129‑1 (MQ=255)
aGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGt > 1:731627/1‑129 (MQ=255)
ggCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGa < 1:286671/140‑1 (MQ=255)
cGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGaaa < 2:1743812/140‑1 (MQ=255)
aTCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTGAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAatt > 2:1633921/1‑140 (MQ=255)
aTCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAAGATGCGTCGGTTCTCCTGAAatt > 1:1701944/1‑140 (MQ=255)
aTCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAatt > 2:1362367/1‑140 (MQ=255)
aTCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAatt > 2:564371/1‑140 (MQ=255)
tCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAatta < 1:2353371/140‑1 (MQ=255)
gAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAattatt < 1:638155/140‑1 (MQ=255)
cGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCg < 2:460488/140‑1 (MQ=255)
cGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCg < 1:1205752/140‑1 (MQ=255)
cGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCg < 1:946626/140‑1 (MQ=255)
gTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGt > 2:1030519/1‑140 (MQ=255)
ttttCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGtt < 2:1647729/140‑1 (MQ=255)
ttCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGa > 1:1107388/1‑126 (MQ=255)
ttCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGa < 2:1107388/126‑1 (MQ=255)
tCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTa > 2:1546097/1‑140 (MQ=255)
tCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTa < 1:1644838/140‑1 (MQ=255)
tCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTa < 1:877699/140‑1 (MQ=255)
tCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTa < 1:7092/140‑1 (MQ=255)
tCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTa < 2:588420/140‑1 (MQ=255)
cgccgcCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCca > 1:1460912/1‑140 (MQ=255)
cgccgcCTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCca < 1:1682560/140‑1 (MQ=255)
gccgccTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCcac < 1:1820769/140‑1 (MQ=255)
ccgccTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCcaca < 2:300404/140‑1 (MQ=255)
cgccTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCCACAg > 1:2219013/1‑140 (MQ=255)
ccTCGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCCACAGGt > 2:2071933/1‑140 (MQ=255)
cGTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCCACAGGTTCa < 1:1073573/140‑1 (MQ=255)
gTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCCACAGGTTCAg < 1:660649/140‑1 (MQ=255)
gTCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCCACAGGTTCAg < 1:67212/140‑1 (MQ=255)
tCCATCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCCACAGGTTCAGt > 1:2020660/1‑140 (MQ=255)
aTCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCCACAGGTTCAGTGGt < 1:2403508/140‑1 (MQ=255)
aTCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCCACAGGTTCAGTGGt < 1:398941/140‑1 (MQ=255)
aTCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCCACAGGTTCAGTGGt < 1:2026373/140‑1 (MQ=255)
aTCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCCACAGGTTCAGTGGt < 1:518178/140‑1 (MQ=255)
aTCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCCACAGGTTCAGTGGt < 2:1816861/140‑1 (MQ=255)
tCAGCTTATACGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCCACAGGTTCAGTGGtt < 2:132328/140‑1 (MQ=255)
tataCGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCCACAGGTTCAGTGGTTTCatta > 1:1715689/1‑140 (MQ=255)
tataCGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCCACAGGTTCAGTGGTTTCatta < 2:1460912/140‑1 (MQ=255)
taCGGATCGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCCACAGGTTCAGTGGTTTCattatt > 2:531997/1‑140 (MQ=255)
|
TTCACCTGTACGTATGGCAGCAGTTCCTGATCAACAATGGTACGCAGATAATCCGGGTTGGCCCGAATTTGCGGTTGCTCATTCTTCAGGCGATCGAACGTTTTCTGCGCCGCCTCGTCCATCAGCTTATACGGATTGGTCTGGTCTGCCGCGGTTGCCGCACTCAGAGGTGCAATCACCAGCAAAGCGACCATCATTAAACGTTTAAACATGCGTCGGTTCTCCTGAAATTATTTCGTTGTACCCACAGGTTCAGTGGTTTCATTATTACC > NC_000913/3337680‑3337951
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
