Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F28 I1 R1
|
258 |
142.3 |
4824480 |
99.1% |
4781059 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,844,073 |
T→C |
V37A (GTC→GCC) |
adeD → |
adenine deaminase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,844,073 | 0 | T | C | 100.0%
| 536.9
/ NA
| 147 | V37A (GTC→GCC) | adeD | adenine deaminase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (79/68); total (79/68) |
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
AAATTGATAAAATCAAAATGAGAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCG > NC_000913/3843936‑3844209
|
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aaTTGATAAAATCAAAATGAGAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGcctc < 1:2234340/140‑1 (MQ=255)
aaTTGATAAAATCAAAATGAGAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGGTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGcctc < 2:825808/140‑1 (MQ=255)
aTTGATAAAATCAAAATGAGAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGcctc > 2:807479/1‑139 (MQ=255)
aTAAAATCAAAATGAGAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATtc < 1:140707/140‑1 (MQ=255)
aTAAAATCAAAATGAGAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATtc < 1:1734318/140‑1 (MQ=255)
aaaaTCAAAATGAGAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATtctc < 1:287389/140‑1 (MQ=255)
aTCAAAATGAGAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGAc < 2:108535/140‑1 (MQ=255)
gagaAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCaa < 1:2343996/140‑1 (MQ=255)
atGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGAc < 1:1331860/123‑1 (MQ=255)
tGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGaa > 2:133879/1‑140 (MQ=255)
gAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGaaa > 1:744116/1‑140 (MQ=255)
aatTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTc < 2:873466/140‑1 (MQ=255)
aatTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTc < 2:419799/140‑1 (MQ=255)
tATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGcc < 1:133879/140‑1 (MQ=255)
tATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGcc < 2:482021/140‑1 (MQ=255)
aTTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGccc < 2:1516009/140‑1 (MQ=255)
ttAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCa > 1:1961151/1‑140 (MQ=255)
ttAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCa > 1:275170/1‑140 (MQ=255)
aaCCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAAt > 1:601856/1‑140 (MQ=255)
aaCCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAAt < 1:2008674/140‑1 (MQ=255)
aCCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTc < 1:1037498/130‑1 (MQ=255)
aCCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAAtt > 1:414683/1‑140 (MQ=255)
cATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATtgt < 2:1104555/140‑1 (MQ=255)
cATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATtgt > 2:1761710/1‑140 (MQ=255)
aaaTTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGAt > 1:2089380/1‑140 (MQ=255)
aTTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTa < 2:601856/140‑1 (MQ=255)
ttCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTaaa < 2:1227224/140‑1 (MQ=255)
ttCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTaaa < 2:1467785/140‑1 (MQ=255)
ttCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTaaa < 2:1118426/140‑1 (MQ=255)
tcatcaCATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAg > 1:1650292/1‑140 (MQ=255)
catcaCATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAAtt > 2:2204138/1‑129 (MQ=255)
atcaCATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTaa < 2:250033/136‑1 (MQ=255)
atcaCATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGa < 1:1218274/140‑1 (MQ=255)
atcaCATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGa > 2:113821/1‑140 (MQ=255)
cacaTTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACg > 1:2108458/1‑140 (MQ=255)
cacaTTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACg < 2:1449033/140‑1 (MQ=255)
cacaTTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACg > 2:1971460/1‑140 (MQ=255)
caTTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGtt > 2:713317/1‑140 (MQ=255)
aTTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTa > 1:2167025/1‑140 (MQ=255)
ttAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTAc < 1:1090565/140‑1 (MQ=255)
tAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTGTTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAg > 2:1645250/1‑131 (MQ=255)
tAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAg < 1:1645250/131‑1 (MQ=255)
tAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACa > 2:1885511/1‑140 (MQ=255)
gCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGAc < 2:2389667/127‑1 (MQ=255)
gCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGAc > 1:2389667/1‑127 (MQ=255)
gCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGt < 1:1747566/129‑1 (MQ=255)
gCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGt > 2:1747566/1‑129 (MQ=255)
gCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCgg > 1:984938/1‑140 (MQ=255)
gCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCgg > 2:751194/1‑140 (MQ=255)
gCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCgg > 2:1558363/1‑140 (MQ=255)
gCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCgg > 1:1674274/1‑140 (MQ=255)
gCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTC‑CGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGgt > 1:946503/1‑140 (MQ=255)
cTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGgt > 1:1444481/1‑140 (MQ=255)
cTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTCGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGgt > 1:1823281/1‑140 (MQ=255)
aTACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTg < 1:113821/140‑1 (MQ=255)
aCCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGgc < 1:2409560/140‑1 (MQ=255)
aCCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGgc < 2:2108458/140‑1 (MQ=255)
aCCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGgc < 1:713317/140‑1 (MQ=255)
aCCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGgc < 1:124600/140‑1 (MQ=255)
aCCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGgc < 2:1371455/140‑1 (MQ=255)
aCCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGgc < 1:1492067/140‑1 (MQ=255)
aCCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGgc < 1:2379163/140‑1 (MQ=255)
aCCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGgc < 1:809200/140‑1 (MQ=255)
ccAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGgcg < 1:1701745/140‑1 (MQ=255)
cAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGgcgc > 1:563895/1‑140 (MQ=255)
aGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCa < 2:2040410/140‑1 (MQ=255)
ggAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAg > 2:949736/1‑140 (MQ=255)
aTTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTg > 1:2055386/1‑131 (MQ=255)
aTTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTg < 2:2055386/131‑1 (MQ=255)
aTTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCa > 2:1672051/1‑136 (MQ=255)
aTTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCa < 2:713488/136‑1 (MQ=255)
aTTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCa > 1:467738/1‑136 (MQ=255)
aTTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCa > 1:713488/1‑136 (MQ=255)
aTTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCa < 2:233007/136‑1 (MQ=255)
aTTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAAt > 2:839443/1‑140 (MQ=255)
aTTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTT‑CATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATa > 1:1421359/1‑140 (MQ=255)
tGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATac > 1:983867/1‑140 (MQ=255)
cGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATg > 2:922685/1‑140 (MQ=255)
cGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATg > 2:165443/1‑140 (MQ=255)
ttCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTc > 1:64461/1‑140 (MQ=255)
ttCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTc > 1:1790395/1‑140 (MQ=255)
tCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTcc > 2:369347/1‑140 (MQ=255)
gCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTg < 1:839443/140‑1 (MQ=255)
gACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCa < 1:220066/140‑1 (MQ=255)
aCGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAg > 1:1564698/1‑140 (MQ=255)
aCGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCAGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAg < 2:1674274/140‑1 (MQ=255)
ttGCCGATTATATTATTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCa > 2:1267829/1‑133 (MQ=255)
tattatTGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTcgcg > 2:108411/1‑140 (MQ=255)
ttGATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCa > 2:2287871/1‑140 (MQ=255)
gATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAAc > 2:1552213/1‑140 (MQ=255)
gATAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAAc > 2:583770/1‑140 (MQ=255)
aTAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTcg > 1:1107126/1‑130 (MQ=255)
aTAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTcg < 2:1107126/130‑1 (MQ=255)
tAATGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAAcgg < 2:1855273/140‑1 (MQ=255)
aaTGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAAcggc > 1:2254812/1‑140 (MQ=255)
aaTGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAAcggc < 1:369347/140‑1 (MQ=255)
aaTGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAAcggc > 2:280686/1‑140 (MQ=255)
aaTGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAAcggc > 2:2151332/1‑140 (MQ=255)
aTGCCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAAcggcg < 1:751194/140‑1 (MQ=255)
|
AAATTGATAAAATCAAAATGAGAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCG > NC_000913/3843936‑3844209
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
