Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F28 I1 R1
|
258 |
142.3 |
4824480 |
99.1% |
4781059 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,231,763 |
(A)7→6 |
intergenic (‑132/+121) |
yjbD ← / ← lysC |
conserved protein YjbD/aspartate kinase III |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,231,757 | 0 | A | . | 100.0%
| 678.2
/ NA
| 157 | intergenic (‑126/+127) | yjbD/lysC | conserved protein YjbD/aspartate kinase III |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base . (73/84); total (73/84) |
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
GGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGATAAAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAGGCCATACAGTATTTACTC > NC_000913/4231621‑4231889
|
gggAGTGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGATaaaa > 2:292459/1‑140 (MQ=255)
tGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGATaaaaaatta > 2:508467/1‑137 (MQ=255)
tGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGATaaaaaatta > 1:1504859/1‑137 (MQ=255)
tGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGATaaaaaatta > 2:1313494/1‑137 (MQ=255)
tGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGATaaaaaatta > 2:899122/1‑137 (MQ=255)
tGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGATaaaaaatta > 2:2302271/1‑137 (MQ=255)
tGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGATa > 2:406932/1‑132 (MQ=255)
gCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGATaaa < 2:154588/133‑1 (MQ=255)
atgatgGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAgg < 1:508467/140‑1 (MQ=255)
tgatgGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTaaa < 2:1033907/137‑1 (MQ=255)
tgatgGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTaaa > 1:1033907/1‑137 (MQ=255)
ctgGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCaa > 2:488832/2‑140 (MQ=255)
gTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTTATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAatta > 1:185941/1‑140 (MQ=255)
gTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAatta > 1:18719/1‑140 (MQ=255)
gTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAatta > 1:518919/1‑140 (MQ=255)
gTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAatta > 1:1749502/1‑140 (MQ=255)
gCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAattatt < 1:426778/140‑1 (MQ=255)
gCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAattatt < 1:1688293/140‑1 (MQ=255)
ccTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATtct < 2:1219543/140‑1 (MQ=255)
cAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGATaaaaaatt > 2:42955/1‑120 (MQ=255)
cAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCg > 2:512237/1‑140 (MQ=255)
gCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAg > 2:1732228/1‑140 (MQ=255)
ccAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGa < 1:1732228/140‑1 (MQ=255)
ccAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGa > 2:2093466/1‑140 (MQ=255)
ccAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGa < 2:2218189/140‑1 (MQ=255)
ccAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGa < 2:2271808/140‑1 (MQ=255)
agagagTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACg < 1:632406/140‑1 (MQ=255)
agagagTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACg < 1:1548732/140‑1 (MQ=255)
agagagTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACg < 1:150746/140‑1 (MQ=255)
agagTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCt > 2:334779/1‑140 (MQ=255)
agagTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCt > 1:1432738/1‑140 (MQ=255)
ttCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGa < 1:591313/132‑1 (MQ=255)
cAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTTATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTaa < 2:185941/140‑1 (MQ=255)
cAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACg < 2:1556716/132‑1 (MQ=255)
gtgtACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACa < 1:923783/140‑1 (MQ=255)
gtgtACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACa < 2:1655310/140‑1 (MQ=255)
cGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTa < 1:1313494/140‑1 (MQ=255)
gggAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACa > 2:179914/1‑134 (MQ=255)
aaTTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAgg < 1:2096939/140‑1 (MQ=255)
aTTCGTTTGCGAGCAGAACTGACAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGc < 1:1700618/140‑1 (MQ=255)
ttCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCt > 2:1945530/1‑140 (MQ=255)
ttCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCt > 1:1747049/1‑140 (MQ=255)
tCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTc < 2:1463015/140‑1 (MQ=255)
cGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGc < 2:1744368/131‑1 (MQ=255)
cGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTAtt < 2:441455/140‑1 (MQ=255)
gCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATtgat < 2:2407180/140‑1 (MQ=255)
gCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATtgat < 1:1807729/140‑1 (MQ=255)
gCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATtgat < 2:1083945/140‑1 (MQ=255)
cAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATtgatg > 1:2389123/1‑140 (MQ=255)
tatTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACa < 1:318142/140‑1 (MQ=255)
atTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACaa > 1:2010416/1‑140 (MQ=255)
atTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACaa > 1:2113181/1‑140 (MQ=255)
atTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACaa > 1:925889/1‑140 (MQ=255)
ttCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAg < 1:1030898/140‑1 (MQ=255)
ttCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAg < 1:1945530/140‑1 (MQ=255)
gCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCaa > 1:1153113/1‑140 (MQ=255)
cTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATa < 2:949766/140‑1 (MQ=255)
cTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATa > 1:641550/1‑140 (MQ=255)
ttCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATAc < 2:1983693/140‑1 (MQ=255)
ctTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGcc < 1:2349458/140‑1 (MQ=255)
tttATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGcc > 2:2364910/1‑132 (MQ=255)
tttATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGcc < 1:2364910/132‑1 (MQ=255)
tttATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAatat < 1:2022480/140‑1 (MQ=255)
tttATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTCTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAatat > 1:826314/1‑140 (MQ=255)
ttATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAAtata > 1:8996/1‑140 (MQ=255)
ttATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAAtata > 2:788494/1‑140 (MQ=255)
ttATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAAtata > 1:472295/1‑140 (MQ=255)
ttATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAAtata > 1:882635/1‑140 (MQ=255)
aTCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGc > 1:1008591/1‑140 (MQ=255)
ctctTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCtt > 1:777067/1‑140 (MQ=255)
ctctTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCtt > 2:209394/1‑140 (MQ=255)
tctTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTc < 1:788494/140‑1 (MQ=255)
ctTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTTCAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTcc < 1:511261/140‑1 (MQ=255)
ctTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTcc < 2:2128927/140‑1 (MQ=255)
tttCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCa > 1:356488/1‑140 (MQ=255)
tCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAgg > 2:1816365/1‑140 (MQ=255)
tCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAgg > 2:904254/1‑140 (MQ=255)
tCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAgg < 1:1327887/140‑1 (MQ=255)
tCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAgg < 2:1153113/140‑1 (MQ=255)
tCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAgg > 1:1444850/1‑140 (MQ=255)
tCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAgg < 2:1432738/140‑1 (MQ=255)
tCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAgg < 1:2201484/140‑1 (MQ=255)
tCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAgg > 1:603038/1‑140 (MQ=255)
tCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAgg < 2:1857389/140‑1 (MQ=255)
tCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAgg > 1:719134/1‑140 (MQ=255)
tCGATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAgg < 2:1444850/140‑1 (MQ=255)
gATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAGGcc < 1:292459/140‑1 (MQ=255)
gATAATTAATTAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAGGcc < 1:1606174/140‑1 (MQ=255)
aattaattAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAGGCCATa < 1:164439/140‑1 (MQ=255)
aattaattAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAGGCCATa < 1:185324/140‑1 (MQ=255)
aattaattAGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAGGCCATa < 2:803232/140‑1 (MQ=255)
attaattaGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAGGCCATAc < 2:518919/140‑1 (MQ=255)
attaattaGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAGGCCATAc < 2:641550/140‑1 (MQ=255)
attaGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAGGCCATAc > 1:2361554/1‑136 (MQ=255)
attaGAGATGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAGGCCATAc < 2:2361554/136‑1 (MQ=255)
agaTGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAGGCCGTACAGTATTTAc > 1:1691818/1‑140 (MQ=255)
aTGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAGGCCATACAGTATTTACTc > 2:2174219/1‑140 (MQ=255)
aTGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAGGCCATACAGTATTTACTc > 2:825748/1‑140 (MQ=255)
aTGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAGGCCATACAGTATTTACTc < 2:242817/140‑1 (MQ=255)
tGCAGAT‑AAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAGGCCATACAGTATTTACt < 1:2245032/138‑1 (MQ=255)
|
GGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGATAAAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCCCGAAATATAGCTTCCAGGCCATACAGTATTTACTC > NC_000913/4231621‑4231889
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
