Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F28 I1 R1
|
159 |
82.1 |
2830106 |
99.3% |
2810295 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,390,763 |
G→A |
R34C (CGT→TGT) |
ymjC ← |
putative uncharacterized protein YmjC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,390,763 | 0 | G | A | 100.0%
| 296.9
/ NA
| 85 | R34C (CGT→TGT) | ymjC | putative uncharacterized protein YmjC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (45/40); total (45/40) |
AGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAG > NC_000913/1390630‑1390898
|
aGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCaaa > 1:627553/1‑140 (MQ=255)
aGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCaaa > 1:161011/1‑140 (MQ=255)
gtgtTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAAt < 2:1190106/140‑1 (MQ=255)
gtgtTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAAt > 1:829814/1‑140 (MQ=255)
gtgtTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAAt < 2:485575/140‑1 (MQ=255)
gtgtTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAAt > 1:274086/1‑140 (MQ=255)
gtgtTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAAt < 2:696604/140‑1 (MQ=255)
tgttgtGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATa > 2:1214172/1‑140 (MQ=255)
tgttgtGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATa > 2:1308466/1‑140 (MQ=255)
tgttgtGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATa > 2:107999/1‑140 (MQ=255)
tgttgtGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATa > 1:793558/1‑140 (MQ=255)
tgtgCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGG‑TTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAgt < 2:1153468/140‑1 (MQ=255)
gtgCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAgt < 1:1325934/140‑1 (MQ=255)
tgCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAgtt > 1:40561/1‑140 (MQ=255)
tgCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAgtt > 1:243166/1‑140 (MQ=255)
cAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAgt < 2:496745/137‑1 (MQ=255)
cAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAgt > 1:496745/1‑137 (MQ=255)
aaTTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAgtttgtt < 1:1214172/140‑1 (MQ=255)
tGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATg < 1:64273/140‑1 (MQ=255)
ggATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGtt > 2:398312/1‑140 (MQ=255)
ggATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGtt < 1:1308466/140‑1 (MQ=255)
aaaTCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATc < 2:893101/140‑1 (MQ=255)
ccTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGcc < 1:1348621/140‑1 (MQ=255)
ttttCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAg > 1:1031264/1‑140 (MQ=255)
ttttCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAg > 2:1406162/1‑140 (MQ=255)
ttcttcAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGtt > 2:606465/1‑140 (MQ=255)
ttcAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGAt < 2:161011/140‑1 (MQ=255)
tcAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCGGTTGAtt < 2:40561/140‑1 (MQ=255)
tcAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGAtt > 1:168204/1‑140 (MQ=255)
aCGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAAt > 1:293360/1‑140 (MQ=255)
aCGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAAt < 2:746860/140‑1 (MQ=255)
tGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATc < 1:593734/135‑1 (MQ=255)
tGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATc > 2:593734/1‑135 (MQ=255)
tGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATg > 1:898074/1‑140 (MQ=255)
gTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATgg < 1:184298/140‑1 (MQ=255)
gTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATgg < 1:185067/140‑1 (MQ=255)
cATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCg < 2:668685/140‑1 (MQ=255)
cATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCg < 2:898074/140‑1 (MQ=255)
tCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCggg > 2:773091/1‑140 (MQ=255)
tCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCggg > 1:671261/1‑140 (MQ=255)
tCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCggg > 2:1289762/1‑140 (MQ=255)
cGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGc < 1:1289762/140‑1 (MQ=255)
cTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATc > 2:948874/1‑140 (MQ=255)
tGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTg > 1:325460/1‑140 (MQ=255)
tGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTg > 1:269776/1‑140 (MQ=255)
tCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCg < 1:1367314/140‑1 (MQ=255)
cACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGc < 2:293360/140‑1 (MQ=255)
cTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCa > 1:1176573/1‑140 (MQ=255)
cTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCa > 1:1053589/1‑140 (MQ=255)
ttttttGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAg < 2:1053589/140‑1 (MQ=255)
ttttttGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAg < 2:1031264/140‑1 (MQ=255)
ttGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCAcc < 2:51005/140‑1 (MQ=255)
tGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCa < 2:269776/140‑1 (MQ=255)
cGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGa > 1:68601/1‑140 (MQ=255)
tttGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACa > 2:1349720/1‑140 (MQ=255)
ttattaGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCAt < 1:606465/140‑1 (MQ=255)
tttGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTTATTAATCACATGCGGGGCTATCTGACCGACAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAAt < 1:670409/139‑1 (MQ=255)
ggATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTAt > 1:840281/1‑140 (MQ=255)
gATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATc < 2:627553/140‑1 (MQ=255)
aTAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCATCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATcc > 1:1168842/1‑140 (MQ=255)
aTAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATcc > 2:773655/1‑140 (MQ=255)
aTAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATcc > 2:708018/1‑140 (MQ=255)
aTAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATcc > 1:1409792/1‑140 (MQ=255)
aTAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATcc > 2:158563/1‑140 (MQ=255)
aTAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATcc > 2:1339393/1‑140 (MQ=255)
aTAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATcc > 2:1293542/1‑140 (MQ=255)
gtgGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGattatt > 2:819606/1‑140 (MQ=255)
gtgGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGattatt > 1:698115/1‑140 (MQ=255)
gtgGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGattatt > 2:1164323/1‑140 (MQ=255)
gtgGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGattatt > 1:409710/1‑140 (MQ=255)
tgGATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTg > 2:1328548/1‑140 (MQ=255)
ggATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCATCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTgg < 2:1168842/140‑1 (MQ=255)
gattttttGC‑GGGTGACCAGGAAAAAAAGTTTTTTTAAAGGTTTGCTTTATTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgc < 2:793558/137‑1 (MQ=255)
gATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgc < 1:773655/140‑1 (MQ=255)
gATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgc < 2:698115/140‑1 (MQ=255)
gATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgc < 2:274086/140‑1 (MQ=255)
gATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgc < 2:1409792/140‑1 (MQ=255)
gATTTTTGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgc < 2:829814/140‑1 (MQ=255)
ttttGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgc > 1:217823/1‑137 (MQ=255)
ttttGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgc < 2:217823/137‑1 (MQ=255)
tGCTGGCTGACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAat > 1:1046995/1‑140 (MQ=255)
ctggctgACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAatat < 1:229543/140‑1 (MQ=255)
tggctgACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATg < 1:1293542/140‑1 (MQ=255)
ggctgACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGc < 1:819606/140‑1 (MQ=255)
tgACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAg > 1:1258254/1‑140 (MQ=255)
tgACAGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAg < 2:1176573/140‑1 (MQ=255)
|
AGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAG > NC_000913/1390630‑1390898
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
