Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F28 I1 R1
|
159 |
82.1 |
2830106 |
99.3% |
2810295 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,556,491 |
T→C |
intergenic (‑211/‑134) |
bdm ← / → osmC |
biofilm‑dependent modulation protein/osmotically inducible peroxiredoxin |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,556,491 | 0 | T | C | 100.0%
| 367.8
/ NA
| 96 | intergenic (‑211/‑134) | bdm/osmC | biofilm‑dependent modulation protein/osmotically inducible peroxiredoxin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (49/47); total (49/47) |
AATATTTGCCGCTTCGTTGTTAAGATTAGTCCTGGTTGATGATTTTTATATTTTAACACCATGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGTAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAAT > NC_000913/1556355‑1556626
|
aaTATTTGCCGCTTCGTTGTTAAGATTAGTCCTGGTTGATGATTTTTATATTTTAACACCATGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAAt < 2:254521/140‑1 (MQ=255)
gCCGCTTCGTTGTTAAGATTAGTCCTGGTTGATGATTTTTATATTTTAACACCATGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATtgt > 2:1309900/1‑140 (MQ=255)
tAGTCCTGGTTGATGATTTTTATATTTTAACACCATGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGc < 1:1075724/140‑1 (MQ=255)
tCCTGGTTGATGATTTTTATATTTTAACACCATGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGaatttaattt > 1:846170/1‑131 (MQ=255)
tCCTGGTTGATGATTTTTATATTTTAACACCATGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGaatttaattt < 2:846170/131‑1 (MQ=255)
tCCTGGTTGATGATTTTTATATTTTAACACCATGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGa > 1:252045/1‑140 (MQ=255)
tCCTGGTTGATGATTTTTATATTTTAACACCATGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGa > 2:50809/1‑140 (MQ=255)
tCCTGGTTGATGATTTTTATATTTTAACACCATGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGa > 1:900708/1‑140 (MQ=255)
cTGGTTGATGATTTTTATATTTTAACACCATGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAg > 1:128618/1‑140 (MQ=255)
gTTGATGATTTTTATATTTTAACACCATGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATGTTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTaa > 2:300681/1‑140 (MQ=255)
tgatTTTTATATTTTAACACCATGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATAttt > 1:810527/1‑140 (MQ=255)
tttATATTTTAACACCATGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGcc < 2:900708/140‑1 (MQ=255)
tAACACCATGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTAt < 2:1367302/140‑1 (MQ=255)
tAACACCATGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTAt > 1:709619/1‑140 (MQ=255)
tAACACCATGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTAt < 1:1193292/140‑1 (MQ=255)
tAACACCATGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTAt < 2:788845/140‑1 (MQ=255)
cacCATGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCg < 1:997603/140‑1 (MQ=255)
ccATGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGa < 1:1309900/140‑1 (MQ=255)
aTGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAat > 2:769144/1‑140 (MQ=255)
tGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTAt > 2:1274079/1‑132 (MQ=255)
tGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTAt < 1:882161/132‑1 (MQ=255)
tGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTAt > 2:882161/1‑132 (MQ=255)
tGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTAt < 1:1274079/132‑1 (MQ=255)
tGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAata > 1:159578/1‑140 (MQ=255)
tGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAata > 1:1323108/1‑140 (MQ=255)
atatTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATc < 1:769144/140‑1 (MQ=255)
ttCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTg > 1:626469/1‑140 (MQ=255)
aTAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATGTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCtt > 2:983622/1‑140 (MQ=255)
aTAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCtt > 2:140294/1‑140 (MQ=255)
aTAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCtt > 2:1099666/1‑140 (MQ=255)
tAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTa > 2:522027/1‑140 (MQ=255)
aGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTAt > 1:439604/1‑140 (MQ=255)
aGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTAt > 1:448097/1‑140 (MQ=255)
ggATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATcc < 1:867150/140‑1 (MQ=255)
ggATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATcc > 2:241501/1‑140 (MQ=255)
ggATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATcc < 2:905144/140‑1 (MQ=255)
gATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCt > 1:1233131/1‑140 (MQ=255)
tgtgATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATcc > 1:76234/1‑136 (MQ=255)
tgtgATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATcc < 2:76234/136‑1 (MQ=255)
gtgATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTg > 1:203541/1‑140 (MQ=255)
gtgATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTg < 2:709619/140‑1 (MQ=255)
tgATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGc < 2:1281586/140‑1 (MQ=255)
gATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATGTTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCt < 1:300681/140‑1 (MQ=255)
gATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCt < 2:15441/140‑1 (MQ=255)
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ggTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTGTTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCt > 1:46818/1‑136 (MQ=255)
ggTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGttt < 1:940527/140‑1 (MQ=255)
ggTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGttt > 2:1188724/1‑140 (MQ=255)
aTCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACg < 2:715966/140‑1 (MQ=255)
aTCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACg < 2:997099/140‑1 (MQ=255)
aTCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACg < 2:1203754/140‑1 (MQ=255)
aTCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACg < 2:203541/140‑1 (MQ=255)
aTCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACg < 1:223169/140‑1 (MQ=255)
aTCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACg < 1:1188724/140‑1 (MQ=255)
aTCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACg < 1:983622/140‑1 (MQ=255)
aTCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACg < 1:50809/140‑1 (MQ=255)
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aTTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCt > 1:330146/1‑125 (MQ=255)
ttAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCt > 1:1294205/1‑140 (MQ=255)
tatTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATaa > 1:3025/1‑140 (MQ=255)
atTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAAt > 1:264427/1‑140 (MQ=255)
gATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTc < 1:982850/140‑1 (MQ=255)
gATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTc < 2:810527/140‑1 (MQ=255)
aTACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACg < 2:423405/125‑1 (MQ=255)
aTACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACg > 1:423405/1‑125 (MQ=255)
aTACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAAtt > 2:1276674/1‑137 (MQ=255)
aTACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAAtt < 1:1276674/137‑1 (MQ=255)
aTACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTcc > 1:1327977/1‑140 (MQ=255)
aTACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTcc > 1:937129/1‑140 (MQ=255)
atatCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCttttt > 2:23254/1‑140 (MQ=255)
atatCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCttttt < 2:1327977/140‑1 (MQ=255)
atatCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCttttt < 2:448097/140‑1 (MQ=255)
atatCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCttttt > 2:1319962/1‑140 (MQ=255)
atCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTaa < 1:522027/140‑1 (MQ=255)
atCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTaa < 1:1319962/140‑1 (MQ=255)
atCTTTTGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTaa < 1:230650/140‑1 (MQ=255)
ttttGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGcc < 2:1294205/140‑1 (MQ=255)
tttGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCttttt > 1:231820/1‑134 (MQ=255)
tttGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCttttt < 2:231820/134‑1 (MQ=255)
tttGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGccc > 1:323842/1‑140 (MQ=255)
tttGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGccc > 1:222951/1‑140 (MQ=255)
tttGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGccc > 2:1257828/1‑140 (MQ=255)
tttGGGGTATTTATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGccc > 2:859155/1‑140 (MQ=255)
ttGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCca > 1:898323/1‑140 (MQ=255)
ttGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCca < 2:128618/140‑1 (MQ=255)
tGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCcac > 2:871770/1‑140 (MQ=255)
tGGGTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCcac < 2:232332/140‑1 (MQ=255)
ggTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAg < 2:777833/140‑1 (MQ=255)
gTTATATATTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAgg > 1:239304/1‑140 (MQ=255)
tatataTTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGgag < 2:3025/140‑1 (MQ=255)
atatatTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGgaga < 1:1361070/140‑1 (MQ=255)
tatatTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTaa < 1:1414264/127‑1 (MQ=255)
tatatTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTaa > 2:1414264/1‑127 (MQ=255)
tatatTCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGagag > 1:84396/1‑140 (MQ=255)
tCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGcaaca > 1:1024101/1‑140 (MQ=255)
tCCCGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGcaaca > 2:1288589/1‑140 (MQ=255)
ccGGCAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAAt > 1:277061/1‑140 (MQ=255)
|
AATATTTGCCGCTTCGTTGTTAAGATTAGTCCTGGTTGATGATTTTTATATTTTAACACCATGATATTCATAGGGATTGTGATTGGTATGATCCGATTAATATTGATACAATATCTTTTGGGTTATATATTCCCGGTAATCTATTGTGGGAATTTAATTTAAGTGCAGAAGTAATATTTTCGCCGGATTTTATTCGGAATATCCTGCTTATCCTCGTGCTGTTTCTCACGTAGTCTATAATTTCCTTTTTAAGCCCACAGGAGAGCAACAAT > NC_000913/1556355‑1556626
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
