Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F28 I1 R1
|
159 |
82.1 |
2830106 |
99.3% |
2810295 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,034,473 |
C→T |
pseudogene (423/1193 nt) |
yedS → |
putative outer membrane protein YedS, N‑terminal fragment |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,034,473 | 0 | C | T | 100.0%
| 350.8
/ NA
| 98 | pseudogene (423/1193 nt) | yedS | putative outer membrane protein YedS, N‑terminal fragment |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (45/53); total (45/53) |
CGTCTGGCATTTGCAGGTTTAGGCTTTGGTCAGAATGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGACAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGT > NC_000913/2034336‑2034608
|
cgTCTGGCATTTGCAGGTTTAGGCTTTGGTCAGAATGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATaa > 2:408199/1‑140 (MQ=255)
cgTCTGGCATTTGCAGGTTTAGGCTTTGGTCAGAATGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATaa > 1:318658/1‑140 (MQ=255)
cgTCTGGCATTTGCAGGTTTAGGCTTTGGTCAGAATGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATaa > 1:1162991/1‑140 (MQ=255)
tttGCAGGTTTAGGCTTTGGTCAGAATGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGaa < 1:627484/140‑1 (MQ=255)
tttGCAGGTTTAGGCTTTGGTCAGAATGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGaa < 1:823964/140‑1 (MQ=255)
gCAGGTTTAGGCTTTGGTCAGAATGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACgg < 1:389547/140‑1 (MQ=255)
cAGGTTTAGGCTTTGGTCAGAATGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGt < 1:1346538/140‑1 (MQ=255)
tAGGCTTTGGTCAGAATGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCt > 2:1035420/1‑140 (MQ=255)
ggCTTTGGTCAGAATGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTaa < 2:548800/140‑1 (MQ=255)
cTTTGGTCAGAATGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATg < 2:459071/140‑1 (MQ=255)
tttGGTCAGAATGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGTGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATgg < 1:1269352/140‑1 (MQ=255)
tttGGTCAGAATGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTaa < 2:286149/137‑1 (MQ=255)
tttGGTCAGAATGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTaa > 1:286149/1‑137 (MQ=255)
ggTCAGAATGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTa > 2:1098595/1‑133 (MQ=255)
ggTCAGAATGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTa < 1:1098595/133‑1 (MQ=255)
aaTGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAAc < 1:632391/140‑1 (MQ=255)
aTGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAAcc > 1:1382722/1‑140 (MQ=255)
aTGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAAcc < 1:408199/140‑1 (MQ=255)
aTGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAAcc < 1:998281/140‑1 (MQ=255)
aTGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAAcc > 2:856189/1‑140 (MQ=255)
aTGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAAcc < 2:785724/140‑1 (MQ=255)
aTGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAAcc > 1:254172/1‑140 (MQ=255)
tACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTAcc < 2:516021/140‑1 (MQ=255)
tCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCa < 1:1412018/128‑1 (MQ=255)
tCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCa > 2:1412018/1‑128 (MQ=255)
tCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAAcc < 1:414335/131‑1 (MQ=255)
tCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAAcc > 2:414335/1‑131 (MQ=255)
tCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAAc > 1:297706/1‑140 (MQ=255)
tCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAAc > 1:335988/1‑140 (MQ=255)
tCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAAc > 1:839908/1‑140 (MQ=255)
tCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAAc > 1:1334926/1‑140 (MQ=255)
tCGACTATGGGCGTAAATACGGTGTCGGAAATGACGTAGAAGCATGGAACGATATGCTGCCAGAATTTGGGGGCGGAACCTATTCTGGCGCTGATAACTTCATTAACGGTCGGGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGCAAc > 2:1208916/1‑140 (MQ=255)
aCTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAAt > 1:215458/1‑140 (MQ=255)
tATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATgg < 2:266745/140‑1 (MQ=255)
ggTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGctt < 2:1162991/140‑1 (MQ=255)
ggTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGctt < 2:318658/140‑1 (MQ=255)
tCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGcttct < 1:822720/140‑1 (MQ=255)
tAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTg > 2:309234/1‑140 (MQ=255)
cTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGtt < 2:733971/140‑1 (MQ=255)
ggTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGcttc > 1:629446/1‑129 (MQ=255)
ggTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGcttc < 2:629446/129‑1 (MQ=255)
ggTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGt > 1:1074977/1‑140 (MQ=255)
tataTGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGc > 1:474302/1‑140 (MQ=255)
tataTGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGc > 2:75389/1‑140 (MQ=255)
tataTGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGc > 1:244485/1‑140 (MQ=255)
tataTGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGc < 2:768943/140‑1 (MQ=255)
cGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAAct > 1:384516/1‑140 (MQ=255)
cGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAAct > 1:247554/1‑140 (MQ=255)
cGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAAct > 1:627342/1‑140 (MQ=255)
cGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAAct > 2:141974/1‑140 (MQ=255)
aGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAActttg > 1:773780/1‑140 (MQ=255)
aGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAActttg > 1:236738/1‑140 (MQ=255)
aGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAActttg > 2:826293/1‑140 (MQ=255)
aGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAActttg > 1:708513/1‑140 (MQ=255)
gAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAActttgc < 2:627342/140‑1 (MQ=255)
gAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAActttgc < 2:458036/140‑1 (MQ=255)
aaGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAActttgct > 2:916902/1‑140 (MQ=255)
cATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAActttgctttg > 2:287682/1‑140 (MQ=255)
cATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAActttgctttg < 2:236738/140‑1 (MQ=255)
tGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCa < 1:821742/140‑1 (MQ=255)
tGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCa > 2:385951/1‑140 (MQ=255)
tGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCa > 1:789137/1‑140 (MQ=255)
tGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCa > 1:240421/1‑140 (MQ=255)
gACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAActttgc > 1:436470/1‑132 (MQ=255)
gACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAActttgc < 2:436470/132‑1 (MQ=255)
gACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAat < 1:916902/140‑1 (MQ=255)
gACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAat > 2:388253/1‑140 (MQ=255)
ccGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAatat < 2:240421/140‑1 (MQ=255)
ccGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAatat < 2:229687/140‑1 (MQ=255)
ccGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAatat < 1:631058/140‑1 (MQ=255)
gATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCa < 1:1208916/140‑1 (MQ=255)
gATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCa < 1:1103712/140‑1 (MQ=255)
gATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCa < 2:1382722/140‑1 (MQ=255)
atatGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAg > 2:336813/1‑140 (MQ=255)
tatGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAgg < 2:773780/140‑1 (MQ=255)
tgctgcCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGt < 1:309234/140‑1 (MQ=255)
tgctgcCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGt < 2:297706/140‑1 (MQ=255)
gctgcCAGAATTTGGTGGCGGTACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGta < 2:1198609/140‑1 (MQ=255)
ctgcCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGtaa < 1:1035420/140‑1 (MQ=255)
ctgcCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGt > 2:157330/1‑138 (MQ=255)
ctgcCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGt < 1:157330/138‑1 (MQ=255)
tgcCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGtaat > 2:474724/1‑140 (MQ=255)
gcCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGtaata > 2:516233/1‑140 (MQ=255)
gAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGa < 2:789137/140‑1 (MQ=255)
gAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGa < 2:708513/140‑1 (MQ=255)
aaTTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGaa < 2:164708/140‑1 (MQ=255)
gtggCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGtaa < 2:340165/127‑1 (MQ=255)
gtggCGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGtaa > 1:340165/1‑127 (MQ=255)
cGATACCTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGAc > 1:10295/1‑140 (MQ=255)
ccTATGCTGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTc < 2:335988/140‑1 (MQ=255)
tGGCGCTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAgg < 1:856189/140‑1 (MQ=255)
gcgcTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGaa < 1:826293/140‑1 (MQ=255)
gcgcTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGaa > 1:663031/1‑140 (MQ=255)
gcgcTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGaa < 1:388253/140‑1 (MQ=255)
gcgcTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGaa < 1:336813/140‑1 (MQ=255)
cgcTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCCACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGAAAGtggtgg < 1:1333855/123‑1 (MQ=255)
cgcTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCCACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGAAAGtggtgg > 2:1333855/1‑123 (MQ=255)
gcTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAgg > 1:853746/1‑140 (MQ=255)
cTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGt < 1:663222/140‑1 (MQ=255)
cTGATAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGt < 2:1074977/140‑1 (MQ=255)
|
CGTCTGGCATTTGCAGGTTTAGGCTTTGGTCAGAATGGTACTTTCGACTATGGTCGTAACTACGGTGTCGTATATGACGTAGAAGCATGGACCGATATGCTGCCAGAATTTGGTGGCGATACCTATGCTGGCGCTGACAACTTCATGAACGGTCGTGCTAATGGTGTTGCAACCTACCGTAACAATGGCTTCTTTGGTTAGGTCGATGGCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGT > NC_000913/2034336‑2034608
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
