Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F28 I1 R1
|
159 |
82.1 |
2830106 |
99.3% |
2810295 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,151,145 |
T→C |
intergenic (‑160/‑40) |
yegI ← / → yegJ |
protein kinase YegI/DUF2314 domain‑containing protein YegJ |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,151,145 | 0 | T | C | 99.0%
| 384.9
/ ‑4.8
| 103 | intergenic (‑160/‑40) | yegI/yegJ | protein kinase YegI/DUF2314 domain‑containing protein YegJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (53/49); total (53/50) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.85e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
TATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATA > NC_000913/2151010‑2151278
|
tattTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGctttt > 2:884441/1‑140 (MQ=255)
tattTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGctttt > 2:921010/1‑140 (MQ=255)
tattTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGctttt > 2:761056/1‑140 (MQ=255)
tattTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGctttt > 1:472262/1‑140 (MQ=255)
tttCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGc > 1:267318/1‑140 (MQ=255)
tttCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGc > 1:1046351/1‑140 (MQ=255)
tttCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGc > 2:1231419/1‑140 (MQ=255)
tttCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGc > 1:405961/1‑140 (MQ=255)
ttCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCt > 1:329010/1‑140 (MQ=255)
tCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTa < 1:26176/140‑1 (MQ=255)
cAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTaa > 1:279281/1‑140 (MQ=255)
aTGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACt > 2:939552/1‑140 (MQ=255)
tGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACtt > 2:330293/1‑140 (MQ=255)
aataatAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTTATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTg > 1:1060421/1‑140 (MQ=255)
ataataACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGa < 1:591082/140‑1 (MQ=255)
acaacTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACaa < 2:1230180/140‑1 (MQ=255)
caacTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACaaa > 2:127726/1‑140 (MQ=255)
acgaaCCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAGTGCAATTTTATCGGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAgg > 2:396533/4‑140 (MQ=255)
acTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACttt > 1:886726/1‑129 (MQ=255)
acTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACttt < 2:886726/129‑1 (MQ=255)
acTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAgg > 2:863565/1‑140 (MQ=255)
cTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAggg > 2:1204620/1‑140 (MQ=255)
tAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGa > 1:96825/1‑140 (MQ=255)
tAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGa > 1:681671/1‑140 (MQ=255)
aaCCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGAt > 1:886119/1‑140 (MQ=255)
aCCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGAtt > 2:1115650/1‑140 (MQ=255)
cATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGa < 2:1312873/125‑1 (MQ=255)
cATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGa > 1:1312873/1‑125 (MQ=255)
cATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCt > 2:574910/1‑140 (MQ=255)
cATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCt > 2:617199/1‑140 (MQ=255)
tAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGga > 2:1212486/1‑140 (MQ=255)
tAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGga > 2:1338121/1‑140 (MQ=255)
attTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGaaaaaa > 2:1183604/1‑140 (MQ=255)
cTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGaa < 2:1162995/140‑1 (MQ=255)
cTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGaa < 1:1387398/140‑1 (MQ=255)
cTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGaa < 2:89175/140‑1 (MQ=255)
tataTGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGaaa < 1:755834/140‑1 (MQ=255)
atatGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGaaaa > 2:855416/1‑140 (MQ=255)
atatGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTAGAGAAAAAATGaaaa < 1:921010/140‑1 (MQ=255)
ggggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGat < 1:127726/140‑1 (MQ=255)
ggggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGat < 1:1212486/140‑1 (MQ=255)
gggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGata > 2:627188/1‑140 (MQ=255)
ggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGATAAAATGAAAAAGatat > 2:13639/1‑140 (MQ=255)
ggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAATGatat > 2:1406045/1‑140 (MQ=255)
ggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGatat < 1:1231419/140‑1 (MQ=255)
ggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGatat > 1:978440/1‑140 (MQ=255)
ggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGatat < 2:267318/140‑1 (MQ=255)
ggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGatat < 2:329010/140‑1 (MQ=255)
ggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGatat < 2:886119/140‑1 (MQ=255)
ggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGatat < 2:681671/140‑1 (MQ=255)
ggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGatat < 1:617199/140‑1 (MQ=255)
ggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGatat < 1:574910/140‑1 (MQ=255)
aaaCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTAc < 2:3214/140‑1 (MQ=255)
aCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGatat < 1:783057/135‑1 (MQ=255)
aCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACtt > 1:384093/1‑140 (MQ=255)
ccACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGaaa < 2:477704/126‑1 (MQ=255)
ccACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGaaa > 1:477704/1‑126 (MQ=255)
cACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATg < 1:1183604/140‑1 (MQ=255)
aCTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGt > 1:909316/1‑140 (MQ=255)
aCTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGt > 2:308294/1‑140 (MQ=255)
aCTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGt < 1:1338121/140‑1 (MQ=255)
cTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGtt > 1:477788/1‑140 (MQ=255)
cTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGtt < 2:238494/140‑1 (MQ=255)
tCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTg > 1:608927/1‑140 (MQ=255)
aaTAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTa > 2:967030/1‑126 (MQ=255)
aaTAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTa < 1:967030/126‑1 (MQ=255)
aTAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTg > 2:716080/1‑140 (MQ=255)
aTAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTg < 1:465160/140‑1 (MQ=255)
aTAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTg < 2:405961/140‑1 (MQ=255)
aaaaTGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTa < 2:909316/140‑1 (MQ=255)
aaaaTGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTa < 1:939552/140‑1 (MQ=255)
aaaTGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACt < 2:892083/123‑1 (MQ=255)
aaaTGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACt > 1:892083/1‑123 (MQ=255)
aaaTGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTAt > 2:1403599/1‑140 (MQ=255)
aaTGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTtac < 1:1115650/140‑1 (MQ=255)
aTGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTtact < 2:35301/140‑1 (MQ=255)
tGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTtacta > 1:846362/1‑140 (MQ=255)
ggATACAATTCAATTTCGGCCGGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAg > 2:1004900/1‑140 (MQ=255)
tcaattTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTc < 1:627188/140‑1 (MQ=255)
aattTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCgg > 1:227511/1‑140 (MQ=255)
gCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGa > 2:238778/1‑134 (MQ=255)
gCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGa < 1:238778/134‑1 (MQ=255)
gCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGtt < 1:365493/140‑1 (MQ=255)
aTAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGa > 2:705814/1‑140 (MQ=255)
aTGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACgg < 2:608927/140‑1 (MQ=255)
aTGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACgg < 1:308294/140‑1 (MQ=255)
tGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACggg < 1:427965/140‑1 (MQ=255)
tGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACggg < 2:1046351/140‑1 (MQ=255)
aTTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACg > 1:101039/1‑136 (MQ=255)
aTTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACg < 2:101039/136‑1 (MQ=255)
aTTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAg > 1:555938/1‑140 (MQ=255)
aTTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTCTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAg > 1:290932/1‑140 (MQ=255)
ttAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAgg < 1:303816/140‑1 (MQ=255)
ttAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAgg < 1:761056/140‑1 (MQ=255)
tAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACTGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGt < 2:227511/140‑1 (MQ=255)
aCTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTa > 1:320810/1‑140 (MQ=255)
aCTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTa < 1:1004900/140‑1 (MQ=255)
cTTCCACAGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTAt > 1:926445/1‑140 (MQ=255)
tCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTCCCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGa < 1:1106963/140‑1 (MQ=255)
cacaGGCTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATa > 1:771158/1‑140 (MQ=255)
|
TATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATA > NC_000913/2151010‑2151278
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
