Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F28 I1 R1
|
159 |
82.1 |
2830106 |
99.3% |
2810295 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,416,753 |
T→C |
R669R (CGT→CGC) |
pta → |
phosphate acetyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,416,753 | 0 | T | C | 100.0%
| 259.7
/ NA
| 70 | R669R (CGT→CGC) | pta | phosphate acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (29/41); total (29/41) |
CAGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAG > NC_000913/2416622‑2416885
|
cAGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGa > 2:362623/1‑140 (MQ=255)
aGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGAc < 1:932727/140‑1 (MQ=255)
aGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGAc < 2:389806/140‑1 (MQ=255)
aGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGAc < 2:1170214/140‑1 (MQ=255)
aGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGAc < 2:1144938/140‑1 (MQ=255)
aGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGAc < 2:1325970/140‑1 (MQ=255)
tACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGCCCt > 1:935912/1‑140 (MQ=255)
tACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGAc < 2:742649/138‑1 (MQ=255)
tACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGAc > 1:742649/1‑138 (MQ=255)
tACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCt > 2:468097/1‑140 (MQ=255)
cgacgCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGa > 2:303268/1‑140 (MQ=255)
gacgCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGAt < 2:641654/140‑1 (MQ=255)
cgCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGAtct < 2:1243962/140‑1 (MQ=255)
cgCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGAtct > 1:470348/1‑140 (MQ=255)
cTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTcc > 1:489366/1‑140 (MQ=255)
cTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTcc > 1:1371565/1‑140 (MQ=255)
aaTGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGc < 1:791078/140‑1 (MQ=255)
ggCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGa < 2:1203325/140‑1 (MQ=255)
ggCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCACCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGa < 2:13662/140‑1 (MQ=255)
gCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGAt < 1:923548/140‑1 (MQ=255)
gCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGAt < 1:405589/140‑1 (MQ=255)
gCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGAt > 2:921083/1‑140 (MQ=255)
tGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGAtgc > 2:1053145/1‑140 (MQ=255)
aCGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGAtgctg < 1:206031/140‑1 (MQ=255)
cGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGAtgctgc > 1:1082388/1‑140 (MQ=255)
cGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGt < 1:72179/140‑1 (MQ=255)
cGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGt > 1:318567/1‑140 (MQ=255)
cAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCa < 1:1006545/140‑1 (MQ=255)
aaGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAg < 1:604761/140‑1 (MQ=255)
aGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGc > 1:654841/1‑140 (MQ=255)
aGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGc > 1:170920/1‑140 (MQ=255)
gcgcCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGcc < 2:1267342/140‑1 (MQ=255)
gcgcCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGcc < 1:1053145/140‑1 (MQ=255)
cGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTACCGACCTGATCTCCATCGGTCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGtt > 2:866103/1‑140 (MQ=255)
ggTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTc > 2:577513/1‑134 (MQ=255)
ggTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTc < 1:577513/134‑1 (MQ=255)
ggTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTgg > 1:887045/1‑140 (MQ=255)
tCGCGTTACCGTGTTCATCTTCCCGGCTCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGgcg < 2:1251315/140‑1 (MQ=255)
cgcgCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGgcgc < 2:654841/140‑1 (MQ=255)
gcgcTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCa < 2:470348/140‑1 (MQ=255)
cgcTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCAc > 1:108015/1‑140 (MQ=255)
gtTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACg < 2:957323/140‑1 (MQ=255)
gtTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACg < 1:362623/140‑1 (MQ=255)
ttCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGa < 2:925906/140‑1 (MQ=255)
tCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGat < 2:84108/140‑1 (MQ=255)
tCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGat < 2:489366/140‑1 (MQ=255)
tCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGat < 1:303268/140‑1 (MQ=255)
tCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATc < 1:1315876/140‑1 (MQ=255)
cTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCACCAAAGCGGAACAGCGCCCTCCCGACCTGATCTCCACCGGGCCGATGCTGCAGGGAATGCGCAACCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGCCGCACTGGTTGACGATATCg > 2:776851/1‑140 (MQ=255)
cccGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGata < 2:157859/134‑1 (MQ=255)
cccGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGata > 1:157859/1‑134 (MQ=255)
aaCACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATcgc > 1:332565/1‑140 (MQ=255)
aaCACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATcgc > 1:1256212/1‑140 (MQ=255)
aaCACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATcgc > 1:1283426/1‑140 (MQ=255)
acCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCt < 2:721592/140‑1 (MQ=255)
gTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACt > 1:955350/1‑140 (MQ=255)
gTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACt > 2:212774/1‑140 (MQ=255)
gTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACt > 1:48805/1‑140 (MQ=255)
gTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACt > 1:609210/1‑140 (MQ=255)
acacCACCTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCg > 2:1210973/1‑140 (MQ=255)
accaccTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGAt < 1:468097/140‑1 (MQ=255)
accaccTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACG‑‑ATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTc < 2:1371565/140‑1 (MQ=255)
accTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCa > 1:1148672/1‑140 (MQ=255)
cTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACTCCATCGCGCTGACTGCGATTCAGt < 2:955350/140‑1 (MQ=255)
cTACAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGt > 2:282821/1‑140 (MQ=255)
cAAAGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTg > 1:75343/1‑140 (MQ=255)
aaGCGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGca < 2:1283426/140‑1 (MQ=255)
cGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCAcag < 2:75343/140‑1 (MQ=255)
cGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCAcag < 2:1148672/140‑1 (MQ=255)
cGGTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCAcag < 1:921083/140‑1 (MQ=255)
ggTACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCAcagc < 2:332565/140‑1 (MQ=255)
tACAGCGCTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCAcagcag < 2:609210/140‑1 (MQ=255)
|
CAGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAG > NC_000913/2416622‑2416885
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
