Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
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Mapped Reads |
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|
A4 F28 I1 R1
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BRESEQ :: Evidence
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|
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cAATTATCTACCGTTTATTGCTGATTGGCCTCGGATCACCAATGGTGATTTACGGCCTGGTTCGCCCGCTCACCATCGAAACGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCt > 1:847226/1‑140 (MQ=255)
cAATTATCTACCGTTTATTGCTGATTGGCCTCGGATCACCAATGGCGATTTACGGCCTGGTTCGCCCGCTCACCATCGAAACGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCt > 2:606606/1‑140 (MQ=255)
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tACCGTTTATTGCTGATTGGCCTCGGATCACCAATGGTGATTTACGGCCTGGTTCGCCCGCTCACCATCGAAACGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTAtt > 1:165084/1‑140 (MQ=255)
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aTTGCTGATTGGCCTCGGATCACCAATGGTGATTTACGGCCTGGTTCGCCCGCTCACCATCGAAACGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCa < 2:686086/137‑1 (MQ=255)
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aTTGCTGATTGGCCTCGGATCACCAATGGTGATTTACGGCCTGGTTCGCCCGCTCACCATCGAAACGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGt > 1:392887/1‑140 (MQ=255)
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ccaTGGTGATTTACGGCCTGGTTCGCCCGCTCACCATCGAAACGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTaac < 2:1309027/138‑1 (MQ=255)
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gTGATTTACGGCCTGGTTCGCCCGCTCACCATCGAAACGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTaa > 2:285462/1‑134 (MQ=255)
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gTGATTTACGGCCTGGTTCGCCCGCTCACCATCGAAACGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGt > 1:334633/1‑140 (MQ=255)
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cATCGAAACGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCgtgt < 1:772704/140‑1 (MQ=255)
cgcgAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTa > 2:1237166/1‑140 (MQ=255)
cgAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATc < 2:267884/140‑1 (MQ=255)
tAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCt < 2:528630/140‑1 (MQ=255)
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gACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAgg > 1:951574/1‑140 (MQ=255)
gACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAgg > 2:430275/1‑140 (MQ=255)
aaCACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTccc < 2:1122022/140‑1 (MQ=255)
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cacGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGt < 1:979741/140‑1 (MQ=255)
acGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTa > 1:348961/1‑140 (MQ=255)
gCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAgg > 2:1364054/1‑140 (MQ=255)
gCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAgg > 2:390349/1‑140 (MQ=255)
ccccAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGc > 2:1102314/1‑140 (MQ=255)
ccAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCAt > 1:870084/1‑140 (MQ=255)
aaaCGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATa < 1:1102314/140‑1 (MQ=255)
aaaCGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATa < 1:1128818/140‑1 (MQ=255)
aaCGTACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATaa < 1:805621/140‑1 (MQ=255)
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tACTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGAcg > 2:762249/1‑140 (MQ=255)
cTTCTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGAcgcg > 2:507805/1‑140 (MQ=255)
cTGTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTaa > 2:762275/1‑140 (MQ=255)
gTTGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGc > 1:372336/1‑140 (MQ=255)
ttGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGa < 1:63942/130‑1 (MQ=255)
ttGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGa > 2:63942/1‑130 (MQ=255)
ttGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCg < 1:517034/140‑1 (MQ=255)
ttGGCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCg > 2:215526/1‑140 (MQ=255)
gCGTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCg > 1:169358/1‑140 (MQ=255)
gTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCa < 1:1252102/140‑1 (MQ=255)
gTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCa > 2:689018/1‑140 (MQ=255)
gTAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCa < 1:378066/140‑1 (MQ=255)
tAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCAt < 2:1204707/140‑1 (MQ=255)
tAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCAt < 2:348961/140‑1 (MQ=255)
tAGCCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCAt < 2:214151/140‑1 (MQ=255)
|
CAATTATCTACCGTTTATTGCTGATTGGCCTCGGATCACCAATGGTGATTTACGGCCTGGTTCGCCCGCTCACCATCGAAACGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCAT > NC_000913/3754663‑3754936
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
