Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F28 I1 R1
|
180 |
66.5 |
2263572 |
99.4% |
2249990 |
138.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,692,417 |
G→A |
G145G (GGC→GGT) |
uidC ← |
outer membrane porin family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,692,417 | 0 | G | A | 100.0%
| 300.2
/ NA
| 87 | G145G (GGC→GGT) | uidC | outer membrane porin family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (46/41); total (46/41) |
TCATCACGAATACCGGTTGTTGAATCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTGCCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGCCCCCAGGGCAAAGCCAAAACTTTTATCACCAT > NC_000913/1692280‑1692553
|
tcatcaCGAATACCGGTTGTTGAATCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTacc < 2:147263/140‑1 (MQ=255)
cGAATACCGGTTGTTGAATCAGTCTATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCAt < 1:347444/140‑1 (MQ=255)
cGAATACCGGTTGTTGAATCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCAt > 1:882453/1‑140 (MQ=255)
cGAATACCGGTTGTTGAATCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCAt > 1:1131636/1‑140 (MQ=255)
cGAATACCGGTTGTTGAATCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCAt > 1:39182/1‑140 (MQ=255)
aaTACCGGTTGTTGAATCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTa > 1:889480/1‑140 (MQ=255)
aaTACCGGTTGTTGAATCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTa > 2:382884/1‑140 (MQ=255)
aTACCGGTTGTTGAATCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTaa < 2:39182/140‑1 (MQ=255)
aTACCGGTTGTTGAATCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTaa < 2:644035/140‑1 (MQ=255)
cGGTTGTTGAATCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGa < 2:947234/140‑1 (MQ=255)
cGGTTGTTGAATCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGa < 1:1000623/140‑1 (MQ=255)
ggTTGTTGAATCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGaa < 2:1054819/140‑1 (MQ=255)
ggTTGTTGAATCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGaa < 2:671399/140‑1 (MQ=255)
gttgttGAATTAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGaa < 1:676705/139‑1 (MQ=255)
gttgttGAATCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGaa > 2:676705/1‑139 (MQ=255)
gttgttGAATCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAAt > 1:602735/1‑140 (MQ=255)
gttgttGAATCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAAt > 1:1089534/1‑140 (MQ=255)
tgttgAATCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATAc > 1:185750/1‑140 (MQ=255)
aaTCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATaa < 2:843150/140‑1 (MQ=255)
aTCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTaa < 1:912700/126‑1 (MQ=255)
aTCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTaa > 2:912700/1‑126 (MQ=255)
tCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAgg < 2:23459/140‑1 (MQ=255)
cAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTaa > 2:754548/1‑124 (MQ=255)
cAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTaa < 1:754548/124‑1 (MQ=255)
aGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGaa > 1:6898/1‑128 (MQ=255)
aGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGaa < 2:6898/128‑1 (MQ=255)
aGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTa > 2:620535/1‑140 (MQ=255)
tCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAg < 1:678333/140‑1 (MQ=255)
ccATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGaa > 2:866940/1‑125 (MQ=255)
ccATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGaa < 1:866940/125‑1 (MQ=255)
ccATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGc < 2:48847/140‑1 (MQ=255)
aaaaTACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCa < 2:807571/140‑1 (MQ=255)
aaaaTACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCa < 2:1131636/140‑1 (MQ=255)
aaaTACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCAt < 2:882453/140‑1 (MQ=255)
tACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAAc > 1:140160/1‑140 (MQ=255)
cTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACta > 1:497254/1‑140 (MQ=255)
aTTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGaa < 2:497254/140‑1 (MQ=255)
ttCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAg < 2:55214/140‑1 (MQ=255)
ttCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAg < 2:1089534/140‑1 (MQ=255)
ttCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCAAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAg < 2:630227/140‑1 (MQ=255)
ccACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGAc < 2:602735/140‑1 (MQ=255)
acaGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCt > 1:799286/1‑140 (MQ=255)
gATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGAc < 1:1010959/135‑1 (MQ=255)
gATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGAc > 2:1010959/1‑135 (MQ=255)
gATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAAt > 1:443425/1‑140 (MQ=255)
aTCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAAtt > 2:736741/1‑140 (MQ=255)
aTCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAAtt > 2:411678/1‑140 (MQ=255)
tatTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGAc > 1:438058/1‑129 (MQ=255)
tatTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGAc < 2:438058/129‑1 (MQ=255)
tatTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGc < 1:736741/140‑1 (MQ=255)
tatTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGc < 2:652255/140‑1 (MQ=255)
ggTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCt > 1:836082/1‑140 (MQ=255)
ggTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCt > 2:146807/1‑140 (MQ=255)
ggTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCt > 2:88809/1‑140 (MQ=255)
ggTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCt > 1:133464/1‑140 (MQ=255)
ggTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCt > 1:661994/1‑140 (MQ=255)
gtgtTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTa < 2:133464/140‑1 (MQ=255)
gCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACt < 1:88809/140‑1 (MQ=255)
gCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACt < 1:565320/140‑1 (MQ=255)
aCCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTTGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTa < 1:833764/140‑1 (MQ=255)
tGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTa < 1:845625/140‑1 (MQ=255)
tGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTa > 2:845625/1‑140 (MQ=255)
ccTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGc > 2:387765/1‑140 (MQ=255)
ccTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGc > 2:173755/1‑140 (MQ=255)
cTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTccc > 2:674527/1‑140 (MQ=255)
cTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGcc > 1:532989/1‑140 (MQ=255)
ttCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGt < 1:668404/124‑1 (MQ=255)
ttCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGt > 2:668404/1‑124 (MQ=255)
ttCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACt < 2:562136/136‑1 (MQ=255)
ttCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACt > 1:562136/1‑136 (MQ=255)
ttCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGccc > 1:727133/1‑140 (MQ=255)
ttCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGccc > 2:75065/1‑140 (MQ=255)
aaCTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGCCCCCAggg > 1:735342/1‑140 (MQ=255)
tGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGCCCCCAGGGCaa > 1:541161/1‑140 (MQ=255)
tGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGCCCCCAGGGCaa < 1:411678/140‑1 (MQ=255)
tCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGCCCCCAGGGCAAAg > 2:650672/1‑140 (MQ=255)
tCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGCCCCCAGGGCAAAg > 1:51434/1‑140 (MQ=255)
tCGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGCCCCCAGGGCAAAg > 2:428316/1‑140 (MQ=255)
cGGTAATGTACGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGCCCCCAGGGCAAAGc < 2:799286/140‑1 (MQ=255)
aCGTTGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGCCCCCAGGGCAAAGCCAAAACttt > 2:160228/1‑140 (MQ=255)
ttGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGCCCCCAGGGCAAAGCCAAGACTTTTAt > 1:204496/1‑140 (MQ=255)
ttGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGCCCCCAGGGCAAAGCCAAAACTTTTAt > 1:887690/1‑140 (MQ=255)
ttGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGCCCCCAGGGCAAAGCCAAAACTTTTAt < 1:428316/140‑1 (MQ=255)
ttGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGCCCCCAGGGCAAAGCCAAAACTTTTAt < 2:51434/140‑1 (MQ=255)
ttGCGAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGCCCCCAGGGCAAAGCCAAAACTTTTAt < 2:140160/140‑1 (MQ=255)
gAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGCCCCCAGGGCAAAGCCAAAACTTTTATCAcc > 1:199945/1‑140 (MQ=255)
gAACTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGCCCCCAGGGCAAAGCCAAAACTTTTATCAcc < 2:114993/140‑1 (MQ=255)
aaCTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGCCCCCAGGGCAAAGCCAAAACTTTTATc < 2:848207/136‑1 (MQ=255)
aaCTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGCCCCCAGGGCAAAGCCAAAACTTTTATc > 1:848207/1‑136 (MQ=255)
aCTACCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGCCCCCAGGGCAAAGCCAAAACTTTTATCACCAt < 1:173755/140‑1 (MQ=255)
|
TCATCACGAATACCGGTTGTTGAATCAGTCCATAAAAATACTCGTGAACGCCACATTCCCCACAGATCAATATTTGGTGTTAAAGCCCAATAACCTAATGCTCCTTCAGAAACTGTCGGTAATGTACGTTGCGAACTGCCAGCCATTAACGGAATACGATAAGGTAAGCTACCATAACTATAATCCGTCCCGAAGCGACCTAATTTAAGCAGGCTATTTTCACTGGGTTTTATTTTTACTGCCCCCAGGGCAAAGCCAAAACTTTTATCACCAT > NC_000913/1692280‑1692553
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
