Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F28 I1 R1
|
180 |
66.5 |
2263572 |
99.4% |
2249990 |
138.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,946,531 |
T→C |
V94A (GTT→GCT) |
yebB → |
putative papain‑like amidase YebB |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,946,531 | 0 | T | C | 98.6%
| 245.7
/ ‑4.6
| 71 | V94A (GTT→GCT) | yebB | putative papain‑like amidase YebB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (34/36); total (34/37) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
TTCCTGGTTGCAGAAAGCCGGGTTCCCCTTTCAACCATCACCACGCTATCTCGTTTTATTAAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGTTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAGCGCTATGTATTCCGGTGGGTGAAATAGAG > NC_000913/1946395‑1946664
|
ttCCTGGTTGCAGAAAGCCGGGTTCCCCTTTCAACCATCACCACGCTATCTCGTTTTATTAAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGa > 1:165194/1‑140 (MQ=255)
tCCTGGTTGCAGAAAGCCGGGTTCCCCTTTCAACCATCACCACGCTATCTCGTTTTATTAAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGaa < 1:880242/140‑1 (MQ=255)
tCCTGGTTGCAGAAAGCCGGGTTCCCCTTTCAACCATCACCACGCTATCTCGTTTTATTAAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGaa > 1:359992/1‑140 (MQ=255)
ccTGGTTGCAGAAAGCCGGGTTCCCCTTTCAACCATCACCACGCTATCTCGTTTTATTAAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAAc > 1:69369/1‑140 (MQ=255)
ccTGGTTGCAGAAAGCCGGGTTCCCCTTTCAACCATCACCACGCTATCTCGTTTTATTAAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAAc > 1:708304/1‑140 (MQ=255)
aaaGCCGGGTTCCCCTTTCAACCATCACCACGCTATCTCGTTTTATTAAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTtccctcc < 1:145901/140‑1 (MQ=255)
gTTCCCCTTTCAACCATCACCACGCTATCTCGTTTTATTAAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACg < 2:1131274/140‑1 (MQ=255)
cccTTTCAACCATCACCACGCTATCTCGTTTTATTAAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCaaa < 1:1010634/140‑1 (MQ=255)
tCAACCATCACCACGCTATCTCGTTTTATTAAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTa > 1:144924/1‑140 (MQ=255)
cATCACCACGCTATCTCGTTTTATTAAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACcaca < 2:165194/140‑1 (MQ=255)
tCACCACGCTATCTCGTTTTATTAAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACAcc > 2:671288/1‑140 (MQ=255)
accacGCTATCTCG‑TTTATTAAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGt > 2:922231/1‑140 (MQ=255)
cGCTATCTCGTTTTATTAAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGtttt < 2:708304/140‑1 (MQ=255)
tctcGTTTTATTAAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACCCCGGTTTTAAATa > 2:1050566/1‑140 (MQ=255)
tctcGTTTTATTAAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATa > 2:769349/1‑140 (MQ=255)
tctcGTTTTATTAAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATa > 1:194840/1‑140 (MQ=255)
cGTTTTATTAAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGTTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGa < 1:539031/140‑1 (MQ=255)
tattaAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCtt < 1:764957/140‑1 (MQ=255)
ttaAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCtt < 2:657066/138‑1 (MQ=255)
ttaAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCtt > 1:657066/1‑138 (MQ=255)
ttaAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTcg > 1:578270/1‑140 (MQ=255)
aaCGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACCCCGGTTTTAAATACGAATCTTCgcgc < 1:1050566/140‑1 (MQ=255)
aaCGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCgcgc > 1:561769/1‑140 (MQ=255)
aCGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGcc > 1:690386/1‑140 (MQ=255)
tCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGtt > 1:196792/1‑140 (MQ=255)
cGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTc > 2:813405/1‑140 (MQ=255)
tgctatAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGttt > 2:218780/1‑140 (MQ=255)
tgctatAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGttt > 2:724724/1‑140 (MQ=255)
ataAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAGATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGa < 2:116170/140‑1 (MQ=255)
ataAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGa < 2:196792/140‑1 (MQ=255)
taAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGat < 1:769349/140‑1 (MQ=255)
taAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGat < 1:464725/140‑1 (MQ=255)
taAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGat > 1:938124/1‑140 (MQ=255)
taAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGat < 2:194840/140‑1 (MQ=255)
taAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGat < 1:762720/140‑1 (MQ=255)
aGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATAtt > 2:1115997/1‑140 (MQ=255)
aGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATAtt > 2:651011/1‑140 (MQ=255)
cGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTta > 1:848361/1‑140 (MQ=255)
cGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTta > 1:854928/1‑140 (MQ=255)
cGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTta > 2:1113897/1‑140 (MQ=255)
cGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTta > 2:384469/1‑140 (MQ=255)
cGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTta > 2:704989/1‑140 (MQ=255)
aTTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGat < 2:721205/133‑1 (MQ=255)
aTTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGat > 1:721205/1‑133 (MQ=255)
aTTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTtata > 1:399628/1‑140 (MQ=255)
aTTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTtata > 1:866089/1‑140 (MQ=255)
ttAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGat < 1:638475/132‑1 (MQ=255)
ttAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGat > 2:638475/1‑132 (MQ=255)
aGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAaag < 1:1113897/140‑1 (MQ=255)
aGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAaag < 2:593909/140‑1 (MQ=255)
aGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCCGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAaag < 2:1023290/140‑1 (MQ=255)
gCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAgc < 1:384469/140‑1 (MQ=255)
gCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAgc < 2:271202/140‑1 (MQ=255)
cTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAgcg < 2:848361/140‑1 (MQ=255)
gggCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAGCGCt > 2:580204/1‑140 (MQ=255)
gggCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAGCGCt < 1:223172/140‑1 (MQ=255)
ggCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAaag < 2:984960/132‑1 (MQ=255)
ggCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAaag > 1:984960/1‑132 (MQ=255)
gCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAGCGCTAt < 1:671288/140‑1 (MQ=255)
aCAGAACGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAGCGCTATGTAt > 2:771831/1‑140 (MQ=255)
aaCGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAGCGCTATGTATTCCg < 2:69369/140‑1 (MQ=255)
aaCGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAGCGCTATGTATTCCg < 2:144924/140‑1 (MQ=255)
aaCGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAGCGCTATGTATTCCg < 1:704989/140‑1 (MQ=255)
aaCGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAGCGCTATGTATTCCg < 1:1115997/140‑1 (MQ=255)
cGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAGCGCTATGTATTCCggt < 1:813405/140‑1 (MQ=255)
cGACAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAGCGCTATGTATTCCggt < 1:218780/140‑1 (MQ=255)
cAAAAACAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAGCGCTATGTATTCCggtggg < 1:922231/140‑1 (MQ=255)
aaaaCAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAGCGCTATGTATTCCggtgggtg < 2:690386/140‑1 (MQ=255)
aaaaCAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAGCGCTATGTATTCCggtggg > 1:771106/1‑138 (MQ=255)
aaaaCAACGAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAGCGCTATGTATTCCggtggg < 2:771106/138‑1 (MQ=255)
gAATTGCTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAGCGCTATGTATTCCGGTGGGTGAAATagag < 2:866089/140‑1 (MQ=255)
|
TTCCTGGTTGCAGAAAGCCGGGTTCCCCTTTCAACCATCACCACGCTATCTCGTTTTATTAAACGTTCGTCTAATCAACGCTATGCTATAAAGCGATTAGACGCTGGGCTGACAGAACGACAAAAACAACGAATTGTTGAACAGGTTCCCTCCCGGCTACGCAAACTTTACCACACCGGTTTTAAATACGAATCTTCGCGCCAGTTCTGTTCAAAATTTGTTTTTGATATTTATAAAGAAGCGCTATGTATTCCGGTGGGTGAAATAGAG > NC_000913/1946395‑1946664
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
