Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F28 I1 R1
|
180 |
66.5 |
2263572 |
99.4% |
2249990 |
138.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,107,568 |
T→C |
E254E (GAA→GAG) |
glf ← |
UDP‑galactopyranose mutase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,107,568 | 0 | T | C | 100.0%
| 365.2
/ NA
| 101 | E254E (GAA→GAG) | glf | UDP‑galactopyranose mutase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (47/54); total (47/54) |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
TCTTTTGTAACAACCGTATGCTTTGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGTTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCTATGGGCTTTACTCGCTAGAGAATCTTTGTCTTTCAAAAAATCAATGCCT > NC_000913/2107437‑2107703
|
tCTTTTGTAACAACCGTATGCTTTGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGtctc > 2:668994/1‑140 (MQ=255)
tCTTTTGTAACAACCGTATGCTTTGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGtctc > 1:319964/1‑140 (MQ=255)
tGTAACAACCGTATGCTTTGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAAtt > 2:1021084/1‑140 (MQ=255)
tGTAACAACCGTATGCTTTGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAAtt > 2:503964/1‑140 (MQ=255)
tGTAACAACCGTATGCTTTGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAAtt > 1:78572/1‑140 (MQ=255)
caacCGTATGCTTTGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTaaa < 2:891007/140‑1 (MQ=255)
caacCGTATGCTTTGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTaaa > 1:552443/1‑140 (MQ=255)
acCGTATGCTTTGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAaga > 2:65803/1‑140 (MQ=255)
acCGTATGCTTTGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAaga > 2:862369/1‑140 (MQ=255)
ccGTATGCTTTGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAagag < 1:615841/140‑1 (MQ=255)
cGTATGCTTTGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGc > 2:309298/1‑140 (MQ=255)
gTATGCTTTGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCg < 1:668994/140‑1 (MQ=255)
aTGCTTTGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGat > 1:804325/1‑140 (MQ=255)
tGCTTTGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGata > 1:674811/1‑140 (MQ=255)
tGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTa > 2:528169/1‑140 (MQ=255)
gTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTaa < 1:748208/140‑1 (MQ=255)
gTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTaa < 1:503964/140‑1 (MQ=255)
gTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTaa < 2:585625/140‑1 (MQ=255)
gTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTaa < 1:528169/140‑1 (MQ=255)
gTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTaa < 2:674811/140‑1 (MQ=255)
gTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTaa > 1:599616/1‑140 (MQ=255)
tctcAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAAc < 1:961293/140‑1 (MQ=255)
tctcAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAAc > 2:472977/1‑140 (MQ=255)
ctcAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAagag > 2:174345/1‑127 (MQ=255)
ctcAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAagag < 1:174345/127‑1 (MQ=255)
ctcAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACg > 2:505173/1‑140 (MQ=255)
tcAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGc < 1:472977/140‑1 (MQ=255)
cAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCt > 2:398114/1‑140 (MQ=255)
cATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCa < 1:398114/140‑1 (MQ=255)
cATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCa < 1:686499/140‑1 (MQ=255)
gTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTaa > 2:47463/1‑129 (MQ=255)
gTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTaa < 1:47463/129‑1 (MQ=255)
gTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAAcc > 1:198172/1‑140 (MQ=255)
gTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAAcc > 2:116687/1‑140 (MQ=255)
gTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAAcc < 2:501329/140‑1 (MQ=255)
tCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCt < 2:552443/140‑1 (MQ=255)
tCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCt > 1:457512/1‑140 (MQ=255)
aaaTGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCtata > 2:169361/1‑140 (MQ=255)
aaaTGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCtata > 2:210012/1‑140 (MQ=255)
aaaTGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCtata > 1:529067/1‑140 (MQ=255)
aTGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGt < 2:319964/140‑1 (MQ=255)
aTGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGt < 2:274263/140‑1 (MQ=255)
gTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCg < 2:890472/140‑1 (MQ=255)
gTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCg < 2:315918/140‑1 (MQ=255)
gTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCg < 2:712614/140‑1 (MQ=255)
tATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCaa > 2:535368/1‑126 (MQ=255)
tATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCaa < 1:535368/126‑1 (MQ=255)
cAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGa < 1:169361/140‑1 (MQ=255)
cAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGa < 2:799822/140‑1 (MQ=255)
cAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGa > 2:531054/1‑140 (MQ=255)
attattCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATc > 2:870504/1‑140 (MQ=255)
tattCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCaa < 2:457512/140‑1 (MQ=255)
attCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAAt < 1:505173/140‑1 (MQ=255)
ggTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCGTTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTc < 1:846172/140‑1 (MQ=255)
ggTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAATCCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTc < 2:914118/140‑1 (MQ=255)
ggTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTc < 2:581845/140‑1 (MQ=255)
ggTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTc < 2:529067/140‑1 (MQ=255)
ggTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTc < 1:65803/140‑1 (MQ=255)
ggTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTc < 1:862369/140‑1 (MQ=255)
tatGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAgt < 1:882435/140‑1 (MQ=255)
tatGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAgt < 2:198172/140‑1 (MQ=255)
tatGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAgt < 1:384839/140‑1 (MQ=255)
tGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAAt < 1:841819/129‑1 (MQ=255)
tGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAAt > 2:841819/1‑129 (MQ=255)
tGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAgtgt > 1:92738/1‑140 (MQ=255)
tGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAgtgt > 1:47486/1‑140 (MQ=255)
tGGTACATTACCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAgtat > 2:1045833/1‑138 (MQ=255)
tACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAga < 1:531054/140‑1 (MQ=255)
tACATTACCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAga < 1:1045833/140‑1 (MQ=255)
aCATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAgat < 2:233819/140‑1 (MQ=255)
aCATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAgat < 2:653496/140‑1 (MQ=255)
cATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAgatg < 2:78572/140‑1 (MQ=255)
cATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAgatg > 1:1077970/1‑140 (MQ=255)
cATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATACTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAgatg > 1:778446/1‑140 (MQ=255)
tAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATggg < 2:1013622/124‑1 (MQ=255)
tAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATggg > 1:1013622/1‑124 (MQ=255)
gCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAATTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATACTCTAACGCTCCAACCCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCt < 2:778446/140‑1 (MQ=255)
gCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAgat < 2:560602/134‑1 (MQ=255)
gCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAgat > 1:560602/1‑134 (MQ=255)
gCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCt > 1:893901/1‑140 (MQ=255)
cATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTc < 1:476755/123‑1 (MQ=255)
cATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTc > 2:476755/1‑123 (MQ=255)
cATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTAATCAATGGGTc > 1:983716/1‑123 (MQ=255)
tCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAgt > 2:65682/1‑125 (MQ=255)
tCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAgt < 1:65682/125‑1 (MQ=255)
aGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCTATggg > 1:1040260/1‑140 (MQ=255)
aGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCTATggg < 1:116687/140‑1 (MQ=255)
gTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCTATggg < 2:83344/139‑1 (MQ=255)
gTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCTATggg > 1:83344/1‑139 (MQ=255)
taCTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCTATGGGCTTTACTCGCTa > 1:833920/1‑140 (MQ=255)
taCTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCTATGGGCTTTACTCGCTa > 1:979140/1‑140 (MQ=255)
taCTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCTATGGGCTTTACTCGCTa > 2:1112068/1‑140 (MQ=255)
taCTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCTATGGGCTTTACTCGCTa < 2:47486/140‑1 (MQ=255)
cATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCTATGGGCTTTACTCGCTAGAGaa > 2:733126/1‑140 (MQ=255)
ttGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCTATGGGCTTTACTCGCTAGAGAATCTTTGTCTTTCaaa > 1:710621/1‑140 (MQ=255)
ttGGAAATTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCTATGGGCTTTACTCGCTAGAGAATCTTTGTCTTTCaaa > 1:900399/1‑140 (MQ=255)
aaaTTCATGGCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCTATGGGCTTTACTCGCTAGAGAATCTTTGTCTTTCAAAAAAt < 2:598359/140‑1 (MQ=255)
ggCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCTATGGGCTTTACTCGCTAGAGAATCTTTGTCTTTCAAAAAATCAATGCCt < 2:599616/140‑1 (MQ=255)
ggCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCTATGGGCTTTACTCGCTAGAGAATCTTTGTCTTTCAAAAAATCAATGCCt < 1:529531/140‑1 (MQ=255)
ggCGCTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCTATGGGCTTTACTCGCTAGAGAATCTTTGTCTTTCAAAAAATCAATGCCt < 1:1048434/140‑1 (MQ=255)
|
TCTTTTGTAACAACCGTATGCTTTGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGTTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCTATGGGCTTTACTCGCTAGAGAATCTTTGTCTTTCAAAAAATCAATGCCT > NC_000913/2107437‑2107703
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
