Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F28 I1 R1
|
180 |
66.5 |
2263572 |
99.4% |
2249990 |
138.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,795,223 |
T→C |
V324A (GTA→GCA) |
gabP → |
4‑aminobutyrate:H(+) symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,795,223 | 0 | T | C | 100.0%
| 361.9
/ NA
| 100 | V324A (GTA→GCA) | gabP | 4‑aminobutyrate:H(+) symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (56/44); total (56/44) |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
ATTGCTCAATATTCCCCATGCGAAATTAATCATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTACGCGCCTGCGAAGGTATTTAAATTTCTGATCGACAGCTCCGGCGCT > NC_000913/2795086‑2795359
|
aTTGCTCAATATTCCCCATGCGAAATTAATCATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCaa < 1:191771/140‑1 (MQ=255)
gCTCAATATTCCCCATGCGAAATTAATCATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGGTGCTCCCGCGGCAATgg > 2:515265/1‑140 (MQ=255)
gCTCAATATTCCCCATGCGAAATTAATCATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATgg > 2:690686/1‑140 (MQ=255)
gCTCAATATTCCCCATGCGAAATTAATCATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATgg > 2:450110/1‑140 (MQ=255)
gCTCAATATTCCCCATGCGAAATTAATCATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATgg > 2:76188/1‑140 (MQ=255)
atatTCCCCATGCGAAATTAATCATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTaaa > 1:573816/1‑140 (MQ=255)
cccATGCGAAATTAATCATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAAc > 2:796061/1‑140 (MQ=255)
cATGCGAAATTAATCATGGACTGCGTGATATTACTTTCCATAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCg < 2:932788/140‑1 (MQ=255)
aTGCGAAATTAATCATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGc > 2:1071984/1‑140 (MQ=255)
aTGCGAAATTAATCATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGc > 1:39080/1‑140 (MQ=255)
gCGAAATTAATCATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAg > 2:171525/1‑140 (MQ=255)
gCGAAATTAATCATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAg > 1:916440/1‑140 (MQ=255)
gCGAAATTAATCATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAg > 1:1121339/1‑140 (MQ=255)
cGAAATTAATCATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGt < 2:413172/140‑1 (MQ=255)
gAAATTAATCATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTa < 2:1121339/140‑1 (MQ=255)
gAAATTAATCATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTa < 2:1030610/140‑1 (MQ=255)
aaaTTAATCATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTaa > 1:1074580/1‑140 (MQ=255)
aTTAATCATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTaaaa > 1:444405/1‑140 (MQ=255)
aTGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTa > 2:466986/1‑140 (MQ=255)
ggACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTa < 1:1073267/128‑1 (MQ=255)
ggACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTa > 2:1073267/1‑128 (MQ=255)
ggACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACg > 2:438549/1‑140 (MQ=255)
ggACTGCGTGATATTACTTTCCGAAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACg > 1:781682/1‑140 (MQ=255)
cTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTgg < 1:690686/140‑1 (MQ=255)
cTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTgg < 1:171525/140‑1 (MQ=255)
cTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTgg < 2:736969/140‑1 (MQ=255)
cTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGAgg < 2:39080/140‑1 (MQ=255)
tGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGc > 1:570547/1‑140 (MQ=255)
tGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGc < 1:200768/140‑1 (MQ=255)
gCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCg > 1:828582/1‑140 (MQ=255)
cGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGt < 2:220881/135‑1 (MQ=255)
cGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGt > 1:220881/1‑135 (MQ=255)
cGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTgg < 2:263819/137‑1 (MQ=255)
cGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTgg > 1:263819/1‑137 (MQ=255)
cGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTg < 2:759030/136‑1 (MQ=255)
cGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTg > 1:759030/1‑136 (MQ=255)
cGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCgg > 1:965464/1‑140 (MQ=255)
cGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCgg > 2:72839/1‑140 (MQ=255)
cGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCgg > 1:818912/1‑140 (MQ=255)
cGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCgg > 2:121057/1‑140 (MQ=255)
tGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGgtg < 1:678579/140‑1 (MQ=255)
tGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGgtg > 2:554306/1‑140 (MQ=255)
gATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGgtgt < 1:294391/140‑1 (MQ=255)
tatTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTa < 1:121057/140‑1 (MQ=255)
cTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACtctc > 1:806923/1‑140 (MQ=255)
cGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGgtg > 2:287554/1‑127 (MQ=255)
cGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGgtg < 1:287554/127‑1 (MQ=255)
cGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCg < 2:573816/140‑1 (MQ=255)
cGTAACAAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCg > 1:835080/1‑140 (MQ=255)
ccAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCATTGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGcgcg < 2:781682/140‑1 (MQ=255)
ccAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGcgcg < 1:796061/140‑1 (MQ=255)
aGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGc < 1:76188/140‑1 (MQ=255)
aGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGc < 2:818912/140‑1 (MQ=255)
ttGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGcgcg < 2:689557/136‑1 (MQ=255)
ttGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGcgcg > 1:689557/1‑136 (MQ=255)
ttGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCAt > 2:877422/1‑140 (MQ=255)
tgtcTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGACGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTGCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGCGTTACTCTCCACCCGCGCGGCCtt > 2:936131/4‑140 (MQ=255)
tGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCAtt > 1:229506/1‑140 (MQ=255)
tGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTa < 1:438549/140‑1 (MQ=255)
gAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTaa < 2:444405/140‑1 (MQ=255)
gAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTaa < 2:570547/140‑1 (MQ=255)
cGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACggtg < 2:362865/140‑1 (MQ=255)
ggCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACggtgg > 2:160852/1‑140 (MQ=255)
ggCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACggtgg < 1:364531/140‑1 (MQ=255)
ggCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACggtgg > 2:177635/1‑140 (MQ=255)
gcgcTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACgg < 1:23261/136‑1 (MQ=255)
gcgcTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACgg > 2:23261/1‑136 (MQ=255)
cgcTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACggtggtg < 2:828582/140‑1 (MQ=255)
cgcTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACggtggtg < 1:877422/140‑1 (MQ=255)
tataCCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGGTGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGaa < 1:515265/140‑1 (MQ=255)
ataCCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACggtg > 1:629707/1‑131 (MQ=255)
ataCCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACggtg < 2:629707/131‑1 (MQ=255)
cgcgTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTAtt > 2:161466/1‑140 (MQ=255)
cgTCAAGGATGCTCTATTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTAc > 1:274996/1‑140 (MQ=255)
cgTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTAc > 1:1019131/1‑140 (MQ=255)
gTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTTACGGTGGTGGGGAACTATTAcg > 1:553379/1‑140 (MQ=255)
tCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTAcgc < 1:161466/140‑1 (MQ=255)
cAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTAcgcg > 1:901468/1‑140 (MQ=255)
cAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTAcgcg > 1:1000357/1‑140 (MQ=255)
cAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTAcgcg > 1:259881/1‑140 (MQ=255)
cAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTAcgcg > 1:851890/1‑140 (MQ=255)
cAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTAcgcg > 2:706446/1‑140 (MQ=255)
gCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTACGCGCCTGCGa < 1:554306/140‑1 (MQ=255)
gCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTACGCGCCTGCGa < 1:1071984/140‑1 (MQ=255)
tctACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTACGCGCCTGCGAAg < 1:466986/140‑1 (MQ=255)
aaGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTACGCGCCTGCGAAGGTATTTAAAt < 2:806923/140‑1 (MQ=255)
cgtcgCGGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTACGCGCCTGCGAAGGTATTTAAATTTCt > 1:1083988/1‑140 (MQ=255)
cgcgGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTACGCGCCTGCGAAGGTATTTAAATTTCTGAt > 2:279001/1‑140 (MQ=255)
cgcgGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTACGCGCCTGCGAAGGTATTTAAATTTCTGAt > 1:672271/1‑140 (MQ=255)
cgcgGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTACGCGCCTGCGAAGGTATTTAAATTTCTGAt > 1:821529/1‑140 (MQ=255)
cgcgGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTACGCGCCTGCGAAGGTATTTAAATTTCTGAt > 1:929912/1‑140 (MQ=255)
cgcgGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTACGCGCCTGCGAAGGTATTTAAATTTCTGAt > 1:1131714/1‑140 (MQ=255)
cgcgGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTACGCGCCTGCGAAGGTATTTAAATTTCTGAt > 2:873913/1‑140 (MQ=255)
cgcgGTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTACGCGCCTGCGAAGGTATTTAAATTTCTGAt > 2:39496/1‑140 (MQ=255)
ggTGATGCTCCCGCGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTACGCGCCTGCGAAGGTATTTAAATTTCTGATCGa < 1:873913/140‑1 (MQ=255)
tGATGCTCCCGTGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTACGCGCCTGCGAAGGTATTTAAATTTCTGATCGACa > 1:649452/1‑140 (MQ=255)
cccGTGGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTACGCGCCTGCGAAGGTATTTAAATTTCTGATCGACAGCTCCgg < 2:649452/140‑1 (MQ=255)
gcgGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTACGCGCCTGCGAAGGTATTTAAATTTCTg > 1:277970/1‑123 (MQ=255)
gcgGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTACGCGCCTGCGAAGGTATTTAAATTTCTg < 2:277970/123‑1 (MQ=255)
cgGCAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTACGCGCCTGCGAAGGTATTTAAATTTCTGATCGACAGCTCCGGCGCt < 1:39496/140‑1 (MQ=255)
|
ATTGCTCAATATTCCCCATGCGAAATTAATCATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTACGCGCCTGCGAAGGTATTTAAATTTCTGATCGACAGCTCCGGCGCT > NC_000913/2795086‑2795359
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
