Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F28 I1 R1
|
180 |
66.5 |
2263572 |
99.4% |
2249990 |
138.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,021,782 |
C→T |
S519S (AGC→AGT) |
ubiB → |
ubiquinone biosynthesis protein UbiB |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,021,782 | 0 | C | T | 100.0%
| 351.2
/ NA
| 98 | S519S (AGC→AGT) | ubiB | ubiquinone biosynthesis protein UbiB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (57/41); total (57/41) |
GGGCAAGTATTTACAGCACAGTGTTGATAAGATTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGCCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTAACGTATAATGCGGCTTTGTTTAA > NC_000913/4021647‑4021918
|
gggCAAGTATTTACAGCACAGTGTTGATAAGATTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGAc < 1:67663/140‑1 (MQ=255)
acaGTGTTGATAAGATTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATg > 2:633600/1‑140 (MQ=255)
tgtTGATAAGATTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCg > 2:173607/1‑140 (MQ=255)
tgtTGATAAGATTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCg > 2:67703/1‑140 (MQ=255)
tgtTGATAAGATTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCg > 2:782005/1‑140 (MQ=255)
ttGATAAGATTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGc < 1:417280/140‑1 (MQ=255)
aTTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGcc < 2:946517/128‑1 (MQ=255)
aTTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGcc > 1:946517/1‑128 (MQ=255)
aTTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCgg > 1:261216/1‑131 (MQ=255)
aTTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCgg < 2:261216/131‑1 (MQ=255)
aTTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAAt > 2:673663/1‑140 (MQ=255)
aTTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAAt > 2:437731/1‑140 (MQ=255)
aTTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAAt > 1:696294/1‑140 (MQ=255)
aTTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAAt < 2:34584/140‑1 (MQ=255)
aTTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAAt > 1:694726/1‑140 (MQ=255)
aTTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAAt > 2:334952/1‑140 (MQ=255)
aTTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAAt > 2:1072207/1‑140 (MQ=255)
aTTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAAt < 1:67703/140‑1 (MQ=255)
aTTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAAt > 1:502772/1‑140 (MQ=255)
aTTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAAt > 1:473829/1‑140 (MQ=255)
aTTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAAt > 2:668695/1‑140 (MQ=255)
aTTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAAt > 1:168771/1‑140 (MQ=255)
aTTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAAt > 2:7784/1‑140 (MQ=255)
aTTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAAt > 2:737065/1‑140 (MQ=255)
aTTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAAt > 1:237713/1‑140 (MQ=255)
gCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGc < 2:696294/140‑1 (MQ=255)
cccGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCa > 1:649196/1‑140 (MQ=255)
cccGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCa > 1:26479/1‑140 (MQ=255)
cccGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCa > 1:140780/1‑140 (MQ=255)
cccGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGAGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCa > 1:1086028/1‑140 (MQ=255)
ccGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAg > 2:776702/1‑140 (MQ=255)
ccGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAg < 1:776702/140‑1 (MQ=255)
gcgAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTg < 2:834320/127‑1 (MQ=255)
gcgAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTg > 1:834320/1‑127 (MQ=255)
ttCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTg < 1:737065/140‑1 (MQ=255)
ttCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTg < 1:411062/140‑1 (MQ=255)
tCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTggg > 2:581065/1‑139 (MQ=255)
tCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGt > 1:233245/1‑140 (MQ=255)
tACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCt < 1:663734/132‑1 (MQ=255)
tACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCt > 2:663734/1‑132 (MQ=255)
gTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGt < 2:473829/140‑1 (MQ=255)
gTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGt < 2:945578/140‑1 (MQ=255)
tCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGtt > 2:602685/1‑140 (MQ=255)
gggACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGgc > 1:253787/1‑140 (MQ=255)
ggACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGgcg > 1:57851/1‑140 (MQ=255)
aTCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCaaaa > 1:626959/1‑140 (MQ=255)
tCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAac > 2:460150/1‑140 (MQ=255)
tttCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGAtt > 1:940610/1‑140 (MQ=255)
aTTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCg > 2:6436/1‑140 (MQ=255)
gcTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAg < 2:140780/140‑1 (MQ=255)
aCGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCg > 1:430882/1‑140 (MQ=255)
aCGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCg > 1:174777/1‑140 (MQ=255)
aCGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCg < 1:668695/140‑1 (MQ=255)
cGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCgg < 2:1086028/140‑1 (MQ=255)
cGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGCCAGTCGTCCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGGTGGTTAATGGCAGGTGGCATGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCgg < 1:190566/140‑1 (MQ=255)
gTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCggg < 1:460150/140‑1 (MQ=255)
gTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCggg < 1:173607/140‑1 (MQ=255)
gTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCggg < 1:782005/140‑1 (MQ=255)
gTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCggg < 1:6436/140‑1 (MQ=255)
tAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGcc < 2:598092/140‑1 (MQ=255)
tAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGcc < 1:450609/140‑1 (MQ=255)
tAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGcc < 2:626959/140‑1 (MQ=255)
aGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCggg > 2:817329/1‑137 (MQ=255)
aGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCggg < 1:817329/137‑1 (MQ=255)
gTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCgt < 2:174777/140‑1 (MQ=255)
tATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCgtg < 2:237713/140‑1 (MQ=255)
tATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCgtg < 2:768519/140‑1 (MQ=255)
tATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCgtg < 2:649196/140‑1 (MQ=255)
ttAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGc < 2:614593/130‑1 (MQ=255)
ttAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGc > 1:614593/1‑130 (MQ=255)
ttAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTa < 1:280864/140‑1 (MQ=255)
aaGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTc > 2:565318/1‑123 (MQ=255)
aaGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTc < 1:565318/123‑1 (MQ=255)
aaGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGcc < 2:864251/133‑1 (MQ=255)
aaGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGcc > 1:864251/1‑133 (MQ=255)
aGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGcc > 1:1105536/1‑132 (MQ=255)
aGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGcc < 2:585397/132‑1 (MQ=255)
aGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGcc < 2:1105536/132‑1 (MQ=255)
aGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGcc > 1:585397/1‑132 (MQ=255)
aGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTAACg > 2:212303/1‑140 (MQ=255)
cacaTTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCgtg > 2:567139/1‑130 (MQ=255)
cacaTTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCgtg < 1:567139/130‑1 (MQ=255)
cacaTTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTAACGTATaa > 1:936323/1‑140 (MQ=255)
cacaTTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTAACGTATaa > 1:554599/1‑140 (MQ=255)
cacaTTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTAACGTATaa > 1:127976/1‑140 (MQ=255)
cacaTTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTAACGTATaa > 2:813631/1‑140 (MQ=255)
cacaTTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTAACGTATaa > 1:512475/1‑140 (MQ=255)
cacaTTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTAACGTATaa > 2:581808/1‑140 (MQ=255)
acaTTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTAACGTATAAt > 1:328337/1‑140 (MQ=255)
caTTCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTAACGTATAATg > 2:579829/1‑140 (MQ=255)
tCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTAACGTATAATGCgg > 1:161320/1‑140 (MQ=255)
tCTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTAACGTATAATGCgg > 1:516699/1‑140 (MQ=255)
cTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTAACGTATAATGCGGc < 1:579829/140‑1 (MQ=255)
cTTGTTGGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTAACGTATAATGCGGc < 2:168771/140‑1 (MQ=255)
ttgttgGTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTAACGTATAATGCGGCt < 2:57851/140‑1 (MQ=255)
ggTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTAACGTATAATGCGGCt < 2:83121/135‑1 (MQ=255)
ggTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTAACGTATAATGCGGCt > 1:83121/1‑135 (MQ=255)
ggTCAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTAACGTATAATGCGGCTTTGtt > 2:449254/1‑140 (MQ=255)
cAGTCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTAACGTATAATGCGGCTTTGTTTaa < 2:554599/140‑1 (MQ=255)
|
GGGCAAGTATTTACAGCACAGTGTTGATAAGATTGCCCGCGAGCTTCAGTCAAATCATGTACGTCAGGGACAATCGCGTTATTTTCTCGGAATTGGCGCTACGTTAGTATTAAGTGGCACATTCTTGTTGGTCAGCCGACCTGAATGGGGGCTGATGCCCGGCTGGTTAATGGCAGGTGGTCTGATCGCCTGGTTTGTCGGTTGGCGCAAAACACGCTGATTTTTTCATCGCTCAAGGCGGGCCGTGTAACGTATAATGCGGCTTTGTTTAA > NC_000913/4021647‑4021918
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
