Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F28 I1 R1
|
260 |
73.5 |
2514320 |
99.3% |
2496719 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,785,204 |
(A)8→7 |
intergenic (‑193/+558) |
ypjC ← / ← ileY |
DUF5507 domain‑containing protein YpjC/tRNA‑Ile |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,785,197 | 0 | A | . | 100.0%
| 423.0
/ NA
| 97 | intergenic (‑186/+565) | ypjC/ileY | DUF5507 domain‑containing protein YpjC/tRNA‑Ile |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base . (55/42); total (55/42) |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
TTTGTCACTATAAAAAAACGCTCATTTGAGACAATTACTGACATTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGATAAAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGCTCACAAAACTCATCTGCCTGCGGCGGGTGTTC > NC_000913/2785062‑2785331
|
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tttGTCACTATAAAAAAACGCTCATTTGAGACAATTACTGACATTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGATaaaaa > 1:693889/1‑140 (MQ=255)
tttGTCACTATAAAAAAACGCTCATTTGAGACAATTACTGACATTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGATaaaaa > 2:1252229/1‑140 (MQ=255)
tttGTCACTATAAAAAAACGCTCATTTGAGACAATTACTGACATTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGATaaaaa > 1:269312/1‑140 (MQ=255)
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tGTCACTATAAAAAAACGCTCATTTGAGACAATTACTGACATTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGATaaaaaaa > 2:284390/1‑140 (MQ=255)
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tGTCACTATAAAAAAACGCTCATTTGAGACAATTACTGACATTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGATaaaaaa < 1:563388/139‑1 (MQ=255)
tGTCACTATAAAAAAACGCTCATTTGAGACAATTACTGACATTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGATaaaaaa > 2:117674/1‑139 (MQ=255)
tGTCACTATAAAAAAACGCTCATTTGAGACAATTACTGACATTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGATaaaaaa > 2:563388/1‑139 (MQ=255)
gTCACTATAAAAAAACGCTCATTTGAGACAATTACTGACATTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGATaaaaaaac > 2:954440/1‑139 (MQ=255)
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aCGCTCATTTGAGACAATTACTGACATTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATttatt < 1:953997/140‑1 (MQ=255)
cGCTCATTTGAGACAATTACTGACATTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGATaaaaaaaccgt < 2:964689/128‑5 (MQ=255)
cGCTCATTTGAGACAATTACTGACATTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGATaaaaaaaccgt > 1:964689/1‑124 (MQ=255)
tttGAGACAATTACTGACATTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGaaa > 1:33383/1‑140 (MQ=255)
tGAGACAATTACTGGCATTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAAt < 1:533769/140‑1 (MQ=255)
aTTACTGACATTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGttttt > 2:1021699/1‑140 (MQ=255)
tACTGACATTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCa > 1:680373/1‑140 (MQ=255)
aCTGACATTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCaa < 2:1210941/140‑1 (MQ=255)
aTTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTa > 2:579680/1‑140 (MQ=255)
aTTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTa > 1:10541/1‑140 (MQ=255)
aTTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑‑AAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCa > 2:416724/1‑132 (MQ=255)
aTTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑‑AAAAAACCGTTATAATATATTAGTGAAAATCGTTTTTCa < 1:416724/132‑1 (MQ=255)
aaCTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGaa > 2:388097/1‑140 (MQ=255)
aaCTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGaa > 1:546432/1‑140 (MQ=255)
aaCTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGaa > 1:1047690/1‑140 (MQ=255)
aaCTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGaa > 1:1231801/1‑140 (MQ=255)
tGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAAtt < 1:1078056/140‑1 (MQ=255)
cTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTGTAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTta > 1:386384/1‑140 (MQ=255)
cTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTta > 1:484116/1‑140 (MQ=255)
cTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTta > 1:497052/1‑140 (MQ=255)
cTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTta < 2:1157537/140‑1 (MQ=255)
ttCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAAtttgt > 2:1160009/1‑138 (MQ=255)
tCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTtata > 2:754531/1‑140 (MQ=255)
tCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTtata > 2:1182072/1‑140 (MQ=255)
tCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTtata > 2:989672/1‑140 (MQ=255)
tCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTtata > 1:902914/1‑140 (MQ=255)
tCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTtata < 1:1021699/140‑1 (MQ=255)
tCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTtata > 1:295288/1‑140 (MQ=255)
cACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTatat < 1:824996/140‑1 (MQ=255)
tGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCa > 2:185994/1‑140 (MQ=255)
gCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTta < 1:796025/132‑1 (MQ=255)
gCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTta > 2:796025/1‑132 (MQ=255)
gCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCaa < 2:497052/140‑1 (MQ=255)
gCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCaa < 2:474891/140‑1 (MQ=255)
cGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGc < 2:269312/140‑1 (MQ=255)
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aCTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTa > 1:1044955/1‑140 (MQ=255)
aCTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTa < 1:388097/140‑1 (MQ=255)
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attaaattaGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCa < 2:962319/140‑1 (MQ=255)
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ttaGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCa < 2:386384/140‑1 (MQ=255)
ttaGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCa < 1:211570/140‑1 (MQ=255)
ttaGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCa < 1:433633/140‑1 (MQ=255)
aGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACg < 2:296874/140‑1 (MQ=255)
cacaGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCa < 2:1178952/136‑1 (MQ=255)
cacaGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCa > 1:1178952/1‑136 (MQ=255)
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gAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGc < 1:1073939/134‑1 (MQ=255)
gAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGc > 2:1073939/1‑134 (MQ=255)
gAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGt > 2:980570/1‑140 (MQ=255)
gAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGt > 1:403843/1‑140 (MQ=255)
ttAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGc < 1:30821/140‑1 (MQ=255)
aaTTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCa > 2:1192535/1‑123 (MQ=255)
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aaTTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGCTca > 2:467002/1‑140 (MQ=255)
aataaACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGCTCACaaaa > 2:791469/1‑140 (MQ=255)
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taaACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGCTCACAAAACt > 2:437664/1‑140 (MQ=255)
taaACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATATATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGCTCACAAAACt > 1:859017/1‑140 (MQ=255)
aaGGTTATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGCTCACAAAACTCATctgc > 1:788492/1‑140 (MQ=255)
ttATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGCTCACAAAACTCATctgcctgc < 2:788492/140‑1 (MQ=255)
ttATTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGCTCACAAAACTCATctgcctgc < 1:850018/140‑1 (MQ=255)
aTTTCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGCTCACAAAACTCATCTGCCTgcgg > 1:756420/1‑140 (MQ=255)
tttCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGCTCACAAAACTCATCTGCCTgcggc < 2:403843/140‑1 (MQ=255)
tttCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGCTCACAAAACTCATCTGCCTgcggc > 1:1230695/1‑140 (MQ=255)
ttCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGCTCACAAAACTCATCTGCCTgcggcg > 1:789757/1‑140 (MQ=255)
tCGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGCTCACAAAACTCATCTGCCTGcggcgg < 1:1182072/140‑1 (MQ=255)
cGCTGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGCTCACAAAACTCATCTGCCTGCGGCggg > 1:13311/1‑140 (MQ=255)
tGTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGCTCACAAAACTCATCTGCCTGCGGCGGgtgt > 1:1228431/1‑140 (MQ=255)
gTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGCTCACAAAACTCATCTGCCTGCGGCGGGTGtt > 2:955149/1‑140 (MQ=255)
gTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGCTCACAAAACTCATCTGCCTGCGGCGGGTGtt < 2:1018017/140‑1 (MQ=255)
gTATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGCTCACAAAACTCATCTGCCTGCGGCGGGTGtt > 1:55788/1‑140 (MQ=255)
tATGAT‑AAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGCTCACAAAACTCATCTGCCTGCGGCGGGTGTTc < 1:980570/140‑1 (MQ=255)
|
TTTGTCACTATAAAAAAACGCTCATTTGAGACAATTACTGACATTAACTGCTTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGATAAAAAAAACCGTTATAATTTATTAGTGAAAATCGTTTTTCAAGTGTTAGAAATTTATATCTCAATAGCGTTGGTTAATGAGCATAGCCACGCTCCTGTAACGCTCACAAAACTCATCTGCCTGCGGCGGGTGTTC > NC_000913/2785062‑2785331
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
