Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F28 I1 R1
|
260 |
73.5 |
2514320 |
99.3% |
2496719 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,027,153 |
A→G |
A11A (GCA→GCG) |
ghxQ → |
guanine/hypoxanthine transporter GhxQ |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,027,153 | 0 | A | G | 100.0%
| 261.1
/ NA
| 73 | A11A (GCA→GCG) | ghxQ | guanine/hypoxanthine transporter GhxQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (44/29); total (44/29) |
GGCGATGACCGTTCGATCTACCGCACCTACGTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCACCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCT > NC_000913/3027023‑3027287
|
ggCGATGACCGTTCGATCTACCGCACCTACGTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCca < 2:1172546/140‑1 (MQ=255)
ggCGATGACCGTTCGATCTACCGCACCTACGTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCca > 1:644692/1‑140 (MQ=255)
gCGATGACCGTTCGATCTACCGCACCTACGTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCcac > 2:490347/1‑140 (MQ=255)
tGACCGTTCGATCTACCGCACCTACGTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAggg > 1:7110/1‑140 (MQ=255)
aCCGTTCGATCTACCGCACCTACGTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGgcg < 1:1030896/140‑1 (MQ=255)
aCCGTTCGATCTACCGCACCTACGTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGgcg > 2:1030896/1‑140 (MQ=255)
cGTTCGATCTACCGCACCTACGTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGgcgcg < 1:1042691/140‑1 (MQ=255)
cGTTCGATCTACCGCACCTACGTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGgcgcg < 1:294059/140‑1 (MQ=255)
ttCGATCTACCGCACCTACGTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCt > 1:289763/1‑140 (MQ=255)
aTCTACCGCACCTACGTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGAt > 2:342683/1‑140 (MQ=255)
cTACGTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGgcgcg > 1:866544/1‑123 (MQ=255)
cTACGTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTaa > 2:639883/1‑140 (MQ=255)
cTACGTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTaa > 2:391349/1‑140 (MQ=255)
cTACGTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTaa > 2:857564/1‑140 (MQ=255)
cTACGTTGATGGTCGTCTAGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGgcgcg < 2:866544/123‑1 (MQ=255)
aCGTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGgcgcgc > 2:861572/1‑122 (MQ=255)
aCGTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGgcgcgc < 1:861572/122‑1 (MQ=255)
aCGTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTaaaa > 1:846520/1‑140 (MQ=255)
aCGTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTaaaa > 2:1101616/1‑140 (MQ=255)
gTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAAtt > 1:546178/1‑140 (MQ=255)
ttGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTa < 2:432913/140‑1 (MQ=255)
ggTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCt < 1:137436/140‑1 (MQ=255)
ggTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCt < 2:644692/140‑1 (MQ=255)
ggTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCt > 2:769137/1‑140 (MQ=255)
cgtcTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGt > 2:20450/1‑140 (MQ=255)
gtcTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTAttt < 2:1007537/123‑1 (MQ=255)
gtcTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTAttt > 1:1007537/1‑123 (MQ=255)
gtcTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTg > 2:1102291/1‑140 (MQ=255)
tgtACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAgca < 1:1102291/140‑3 (MQ=255)
cGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGt > 1:1153757/1‑140 (MQ=255)
gCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTc < 2:876391/140‑1 (MQ=255)
cAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTgg < 1:701879/125‑1 (MQ=255)
cAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTgg > 2:701879/1‑125 (MQ=255)
cAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGt > 2:1063714/1‑134 (MQ=255)
cAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGt < 1:1063714/134‑1 (MQ=255)
cAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCa > 2:899269/1‑140 (MQ=255)
cAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCa > 2:294071/1‑140 (MQ=255)
cAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCa > 2:714021/1‑140 (MQ=255)
aCTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAgg < 2:1096605/140‑1 (MQ=255)
aCTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAgg < 2:846520/140‑1 (MQ=255)
aCTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAgg > 1:233183/1‑140 (MQ=255)
aaaCTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTActggc < 2:233183/140‑1 (MQ=255)
tAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCtt > 1:176575/1‑140 (MQ=255)
gAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCt < 1:353334/140‑1 (MQ=255)
aCATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGcc < 2:289763/140‑1 (MQ=255)
aCATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGcc < 1:20450/140‑1 (MQ=255)
aCATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGcc < 2:176575/140‑1 (MQ=255)
atcatTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCAt > 2:915028/1‑140 (MQ=255)
atcatTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCAt > 1:174590/1‑140 (MQ=255)
aTGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTa < 2:546178/140‑1 (MQ=255)
tCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTc < 1:915028/140‑1 (MQ=255)
ggAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGt > 2:933160/1‑140 (MQ=255)
ggAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGt > 2:334433/1‑140 (MQ=255)
ggAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGt > 2:134622/1‑140 (MQ=255)
ggAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGt > 1:1252550/1‑140 (MQ=255)
ggAGACATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGt > 2:1130803/1‑140 (MQ=255)
gagaCATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGtt > 1:92359/1‑140 (MQ=255)
gagaCATCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGtt < 1:857564/140‑1 (MQ=255)
aTCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTAtcgt > 2:672238/1‑140 (MQ=255)
aTCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTAtcgt > 2:350749/1‑140 (MQ=255)
tCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTAtcgtc > 2:686321/1‑140 (MQ=255)
tCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTAtcgtc > 1:510179/1‑140 (MQ=255)
tCCTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTAtcgtc > 2:1205349/1‑140 (MQ=255)
cTACAAACACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATcgtcgt < 1:334433/140‑1 (MQ=255)
aaCACCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCgg < 1:725812/140‑1 (MQ=255)
cacCGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGa < 1:899269/140‑1 (MQ=255)
ccGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAAt > 1:228141/1‑140 (MQ=255)
cGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTAtcg < 2:516414/126‑1 (MQ=255)
cGGACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTAtcg > 1:516414/1‑126 (MQ=255)
ggACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGc > 1:960885/1‑140 (MQ=255)
gACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCt > 1:98511/1‑140 (MQ=255)
gACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCt > 1:777640/1‑140 (MQ=255)
gACGCGCCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCt < 1:1205349/140‑1 (MQ=255)
|
GGCGATGACCGTTCGATCTACCGCACCTACGTTGATGGTCGTCTGGTGTACGAACGCAACTAATAATAAAACTTTAACATCCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCACCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCT > NC_000913/3027023‑3027287
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
