Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F28 I1 R1
|
260 |
73.5 |
2514320 |
99.3% |
2496719 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,070,029 |
G→A |
P125S (CCG→TCG) |
yihR ← |
putative aldose 1‑epimerase YihR |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,070,029 | 0 | G | A | 100.0%
| 340.7
/ NA
| 96 | P125S (CCG→TCG) | yihR | putative aldose 1‑epimerase YihR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (52/44); total (52/44) |
CCCACGCCATAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGGCAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGG > NC_000913/4069902‑4070165
|
cccACGCCATAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGt > 1:1076216/1‑140 (MQ=255)
cACGCCATAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCa > 2:706438/1‑140 (MQ=255)
gCCATAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAggg > 1:594765/1‑140 (MQ=255)
gCCATAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAggg > 1:365694/1‑140 (MQ=255)
gCCATAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAggg > 1:717104/1‑140 (MQ=255)
ccATAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGt < 2:912853/140‑1 (MQ=255)
tAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAAc > 1:394927/1‑140 (MQ=255)
tAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAAc > 2:1128760/1‑140 (MQ=255)
tAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAAc > 1:993336/1‑140 (MQ=255)
tAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAAc > 1:917725/1‑140 (MQ=255)
aGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCTAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGc < 1:829677/140‑1 (MQ=255)
cgcTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCtgg < 2:194064/140‑1 (MQ=255)
cTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCtggtg > 2:1213455/1‑140 (MQ=255)
tGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCtggtgg > 2:994366/1‑140 (MQ=255)
tGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCtggtgg > 1:529741/1‑140 (MQ=255)
gCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGc > 1:297565/1‑140 (MQ=255)
cGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCg > 1:940981/1‑140 (MQ=255)
ccGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTc > 1:1221216/1‑140 (MQ=255)
ccGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTc < 2:394927/140‑1 (MQ=255)
gATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCAc < 1:946717/140‑1 (MQ=255)
gATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCAc < 2:1076216/140‑1 (MQ=255)
atatTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACt > 1:1104738/1‑140 (MQ=255)
atTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTaa > 1:1138110/1‑140 (MQ=255)
cTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCAc < 2:1068015/134‑1 (MQ=255)
cTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCAc > 1:1068015/1‑134 (MQ=255)
cTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAAttt > 2:4026/1‑140 (MQ=255)
ggCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGc > 2:663125/1‑140 (MQ=255)
gCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGcc > 2:355261/1‑140 (MQ=255)
tGCGATCTCGACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGt > 2:525052/1‑140 (MQ=255)
tGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGt > 2:1079473/1‑140 (MQ=255)
tGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGt > 1:1186083/1‑140 (MQ=255)
tGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGt > 2:466930/1‑140 (MQ=255)
gCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGtc > 1:541794/1‑140 (MQ=255)
cGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGtct > 2:19289/1‑140 (MQ=255)
cGATCTCAACGGAAAGACCAGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGtct > 2:40726/1‑140 (MQ=255)
tctcAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGc < 2:594765/140‑1 (MQ=255)
tcAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCa < 2:1221216/140‑1 (MQ=255)
tcAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCa > 2:900577/1‑140 (MQ=255)
cGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCa > 2:127961/1‑140 (MQ=255)
gAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAag > 1:1079665/1‑140 (MQ=255)
aaaGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCaagcaagc < 2:529741/140‑1 (MQ=255)
aaaGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAagc < 1:497712/140‑1 (MQ=255)
aaaGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAagc < 1:355261/140‑1 (MQ=255)
aaaGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAagc < 1:399552/140‑1 (MQ=255)
cGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGt > 1:1012828/1‑140 (MQ=255)
tgtgtgCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGa > 1:809241/1‑140 (MQ=255)
tgtgtgCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAACATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGa > 2:829807/1‑140 (MQ=255)
gCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGc < 2:809241/140‑1 (MQ=255)
gCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGc < 1:294772/140‑1 (MQ=255)
gCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGc < 2:1138110/140‑1 (MQ=255)
gTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCgg > 1:756200/1‑140 (MQ=255)
gTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCgg < 2:365694/140‑1 (MQ=255)
gAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCtt < 1:40726/140‑1 (MQ=255)
gAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCtt > 1:722560/1‑140 (MQ=255)
gAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCtt < 1:4026/140‑1 (MQ=255)
aGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAGAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGc < 2:830514/134‑1 (MQ=255)
aGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAGAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGc > 1:830514/1‑134 (MQ=255)
aGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCttt > 1:756732/1‑140 (MQ=255)
aGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCttt > 1:807119/1‑140 (MQ=255)
gCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCGGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCtttt > 1:1189028/1‑140 (MQ=255)
gCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCtttt < 1:525052/140‑1 (MQ=255)
aaTAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCGGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGaa < 2:1189028/140‑1 (MQ=255)
aaTAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGaa < 1:19289/140‑1 (MQ=255)
aaTAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGaa < 2:541794/140‑1 (MQ=255)
aaTAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGaa < 2:917725/140‑1 (MQ=255)
aaTAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGaa < 2:1012828/140‑1 (MQ=255)
tAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACt < 1:225397/140‑1 (MQ=255)
tAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACt < 2:993336/140‑1 (MQ=255)
acaacTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATg < 2:940981/140‑1 (MQ=255)
ttGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCAt < 2:717104/140‑1 (MQ=255)
tgtgAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCAtt > 2:330919/1‑140 (MQ=255)
tgtgAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCAtt > 1:1170137/1‑140 (MQ=255)
gtgAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTa > 1:105345/1‑140 (MQ=255)
tgAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTaa < 1:1213455/140‑1 (MQ=255)
gAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAAt < 2:807119/140‑1 (MQ=255)
gCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATggg < 1:900577/140‑1 (MQ=255)
ccAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGt < 2:398288/140‑1 (MQ=255)
ccAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGt < 1:127961/140‑1 (MQ=255)
ccAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGt < 2:1079665/140‑1 (MQ=255)
ccAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGt < 2:756200/140‑1 (MQ=255)
caacATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTa < 1:829807/137‑1 (MQ=255)
cAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTa > 2:281003/1‑140 (MQ=255)
cAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAACTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTa < 2:1104738/140‑1 (MQ=255)
cATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTa < 1:935270/137‑1 (MQ=255)
cATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTa > 2:935270/1‑137 (MQ=255)
aCGGATAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGatat > 2:859801/1‑140 (MQ=255)
aTAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCt > 1:140431/1‑140 (MQ=255)
tAGCCGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTg > 2:497074/1‑140 (MQ=255)
ccGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGccc > 1:563117/1‑140 (MQ=255)
ccGTAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGccc > 1:777036/1‑140 (MQ=255)
tAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTg < 2:297565/140‑1 (MQ=255)
tAACTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTg < 2:362312/140‑1 (MQ=255)
aaCTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTc > 2:828088/1‑130 (MQ=255)
aaCTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTc < 1:828088/130‑1 (MQ=255)
aaCTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGa > 2:388444/1‑140 (MQ=255)
aCTGGGCGACAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGAt < 2:846738/140‑1 (MQ=255)
ggcgacAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCg > 1:796724/1‑140 (MQ=255)
ggcgacAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCg > 2:458594/1‑140 (MQ=255)
gcgacAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGGCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCgg > 2:1089801/1‑140 (MQ=255)
gcgacAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTg < 1:1111135/133‑1 (MQ=255)
|
CCCACGCCATAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGGCAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGG > NC_000913/4069902‑4070165
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
